Mรฉthode basรฉe sur les mรฉcanismes dโaction
ย ย ย ย ย ย ย ย ย ย ย La division cellulaire est contrรดlรฉe pa figurent les CDK (cycline-dependent kinases consiste ร inhiber un enzyme particulier jugรฉ crucial dans la division cellulaire. La figure dessous montre les CDK les plus pertinents dans cette division cellulaire, et qui peuvent servir de cibles thรฉrapeutiques dans la recherche de nouvelles molรฉcules anticancรฉreuses [Meijer, 2000]. National Cancer Institute (USA), beaucoup plus รฉtendue, utilise 60 diffรฉrentes souches cรฉreuses [Kinghorn et al, 1999]. Sur le plan expรฉrimental, il existe deux : la mรฉthode colorimรฉtrique utilisant lโabsorption du rouge neutre par les cellules vivantes, et la mรฉthode radioactive utilisant lโincorporation de la thymidine tritiรฉe d cellules vivantes. On teste gรฉnรฉralement deux concentrations, en lโoccurrence 1ยตg/mL et/ou 10ยตg/mL, puis on dรฉtermine le pourcentage dโinhibition par rapport au tรฉmoin. En rรจgle gรฉnรฉrale, un extrait ayant un pourcentage dโinhibition supรฉrieur ร 80 pour une concentration de 10 ยตg/mL est considรฉrรฉ comme actif. Dans ce cas, on dรฉtermine la concentration ) par la mรฉthode de rรฉgression linรฉaire. La division cellulaire est contrรดlรฉe par une multitude dโenzymes parmi lesquelles dependent kinases).
La RMN ร onde continue ou RMN ร balayage de champ
ย ย ย ย ย ย ย ย ย Dโaprรจs lโรฉquation {2}, on peut obtenir une rรฉsonance de deux faรงons : (i) faire varier ฮฝ0 ou (ii) faire varier B0. Les premiers appareils de RMN de 60 ร 100 MHz fonctionnaient par onde continue. Cette technique consiste ร soumettre l’รฉchantillon ร analyser ร une radiation รฉlectromagnรฉtique de frรฉquence ฮฝ0 trรจs stable, et ร faire varier le champ magnรฉtique appliquรฉ B0. Le choix de cette technique vient du fait que, sur le plan pratique, il est difficile de maintenir B0 trรจs stable
Exemple de dรฉmarche ร suivre pour lโinterprรฉtation des spectres de RMN
ย ย ย ย ย ย ย ย ย A la suite de diffรฉrents ateliers quโelle a encadrรฉs ร Madagascar et ร Maurice depuis 1993, Dr Marie-Thรฉrรจse MARTIN a proposรฉ une dรฉmarche gรฉnรฉrale pour lโinterprรฉtation des spectres de RMN dโun produit :
Dรฉterminer le nombre dโinsaturation(s) ร partir de la formule brute CxHyNZ en appliquant la formule suivante : X-Y/2 + Z/2+1 {8}
Faire un spectre de 13C
Faire un spectre corrรฉlรฉ proton-carbone HMQC ou HSQC et reporter sur la dimension carbone les ฮด de ces derniers, ensuite faire correspondre les protons avec les carbones qui les portent.
Sur le spectre proton marquer en dessous de chaque signal la frรฉquence du carbone qui les porte et mettre en รฉvidence les protons gรฉminรฉs non รฉquivalent ;
Faire un spectre COSY et relever les enchaรฎnements protoniques. Regarder sโil y a des motifs qui peuvent dรฉjร รชtre dรฉterminรฉs : cycle aromatique para-disubstituรฉ, cycle aromatique 1,2,4-trisubstituรฉ, double liaison, etc. ;
Faire un spectre HMBC et reporter sur la dimension carbone le dรฉplacement chimique de ces derniers, ensuite reporter dans la dimension proton les dรฉplacements chimiques de carbone qui les portent ;
Confirmer les enchaรฎnements dรฉjร trouvรฉs en COSY ร lโaide du spectre HMBC ;
En partant de la partie identifiรฉe de la molรฉcule reconstituer son squelette ;
Certaines parties de la molรฉcule peuvent รชtre plus explicites que dโautres : les aromatiques permettent de dรฉterminer la position des substituants, les protons dโun mรฉthoxy ne corrรจlent quโavec le carbone qui le porte cette fonction, les protons dโun mรฉthyle corrรจlent avec les carbones en ฮฑ et an ฮฒ (2 J et 3 J) ;
Faire un spectre NOESY et relever les diffรฉrentes sortes de tache NOE รฉquilibre conformationel, รฉchange COSY. Noter lโintensitรฉ des corrรฉlations entre protons gรฉminรฉs et commencer par lโinterprรฉtation des taches les plus intenses. Une structure est dรฉterminรฉe lorsque tous les รฉlรฉments dรฉduits de diffรฉrents spectres convergent.
Matรฉriel vรฉgรฉtal
ย ย ย ย ย ย ย ย ย ย La plante qui a servi ร notre รฉtude a รฉtรฉ rรฉcoltรฉe ร Sakaraha en octobre 2005. Elle a รฉtรฉ identifiรฉe sous le nom Salacia leptoclada par Armand Rakotozafy. Un herbier a รฉtรฉ conservรฉ au Laboratoire de Chimie Appliquรฉe sous le Nยฐ FDU 051 et ร lโIMRA sous le numรฉro MAD115. Cโest un arbrisseau glabre ร feuilles persistantes, rameaux noirรขtres, parsemรฉs de lenticelles peu saillantes, trรจs petites, les ultimes grรชles de moins de 1mm de diamรจtre. Feuilles opposรฉes, parfois subopposรฉes, concolores, vertes membraneuses, pรฉtiole5-10mm, de long : limbe ovale ou ovale- lancรฉolรฉ (3-8,5 x 2-4,4 et jusquโร 11 x 5,3cm) ou plus รฉtroit (5,3-9 x 2,2-3 cm) ร plus grande largeur au milieu ou plus souvent au-dessous du milieu, plus ou moins en coin ou arrondi ร la base non dรฉcurrente, attรฉnuรฉ- obtus ou courtement acuminรฉ au sommet ; dents marginales nombreux (15-20 par bord), denses, petites et peu saillantes mais toujours bien visibles. Fascicules multiflores, parfois courtement pรฉdonculรฉs ; pรฉdicelles grรชles, mais courts (3-5mm) ; Fleurs petites (5-6mm diam). Sรฉpales trรจs petits 5-6 fois plus petits que les pรฉtales oblongs (3 x 1,5mm), au moins 2 fois plus longs que les larges. Disque trรจs court. Etamines un peu plus hautes que le style, parfois ร anthรจres coalescentes audessus du style de 1mm de haut. 6 ovules au moins dans chaque loge de lโovaire. Baie globuleuse, petite (au plus 10mmde diam.); pรฉricarpe plus mince, avec les mรชmes vaisseaux en filaments soyeux que sur S. madagascariensis. Graines nombreuses (15-20 par fruit), ovoรฏdes ou cylindracรฉes, petites (au plus 3,5 x 1,5mm) sans albumen et ร cotylรฉdons unis en une seule masse comme S. madagascarienssis [H.Perrier de la bรขthie(1946)] Cette plante est connue sous le nom vernaculaire : Vandamena et Malainkevitsa dans la rรฉgion de Sakaraha. Elle est traditionnellement utilisรฉe pour guรฉrir la plaie et combattre le paludisme en faisant une dรฉcoction de la partie aรฉrienne de la plante dans un 1itre dโeau au minimum. On lโadministre sous forme de tisane ou ยซ tambavy ยป.
DISCUSSION
ย ย ย ย ย ย ย ย ย ย ย Le principe cytotoxique de Vandamena a รฉtรฉ identifiรฉ comme รฉtant une quinonemethide triterpรจne qui est caractรฉristique de la famille botanique des Celastraceae et Hyppocrateaceae. Il est trรจs probable que la prรฉsence du noyau quinonique confรจre ร cette famille chimique une importante activitรฉ cytotoxique. Il est intรฉressant de signaler quโune autre plante dรฉnommรฉe Vandamena a รฉtรฉ rรฉcoltรฉe ร Sakaraha, et a รฉtรฉ identifiรฉe comme รฉtant un Diospyros sp. Le mot Vandamena vient du fait que la dรฉcoction de la plante possรจde une coloration rouge sang caractรฉristique. Lโรฉtude de la plante Diospyros a permis de connaรฎtre que le constituant cytotoxique est aussi une quinone mais de type diffรฉrent. Ainsi, la coloration rouge des quinones a donnรฉ naissance au nom vernaculaire Vandamena, et les produits correspondants sont cytotoxiques. Il sโagit lร dโun rรฉsultat intรฉressant sur le plan du savoir traditionnel en rapport avec les connaissances modernes. Ceci permettre dโorienter les collectes futures en vue de cibler les plantes qui peuvent prรฉsenter une originalitรฉ dans les constituants chimiques. Cโest sur cette recherche de la diversitรฉ chimique que reposera toute la rรฉussite de la dรฉcouverte de nouveaux mรฉdicaments. Sur le plan mรฉcanistique, les quinones pourraient jouer le rรดle dโintercalants de lโADN grรขce ร sa structure plane, ce qui expliquerait leurs activitรฉs cytotoxiques. Les quinones possรจdent รฉgalement des activitรฉs antipaludiques, et comme exemple pertinent, on peut citer lโatovaquone dont la structure a รฉtรฉ inspirรฉe de celle du lapachol isolรฉ de Tabebuia sp originaire du Brรฉsil et utilisรฉe dans le traitement de la malaria.
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Table des matiรจres
INTRODUCTION
CHAPITRE 1 : RAPPELS BIBLIOGRAPHIQUES
1. La maladie cancรฉreuse
1.1. Dรฉfinition
1.2. Evolution de la maladie
1.3. Chimiothรฉrapie anticancรฉreuse
1.4. Mรฉthode de la recherche des Molรฉcules anticancรฉreuses
2. les terpenoรฏdes
2.1. Dรฉfinition
2.2. Classification
2.3. Biogenรจse
2.4. Biogenรจse des quinones triterpรจnes
3. Mรฉthodes spectroscopiques de dรฉtermination des structures
3.1. RMN 1D et 2D
3.2. Application ร la dรฉtermination de structure
3.3. Spectromรฉtrie de masse
CHAPITRE 2 : ETUDES DE VANDAMENA
1. Travaux antรฉrieurs sur le genre salacia
2. Matรฉriels et mรฉthodes
2.1. Solvants, rรฉactifs et adsorbants
2.2. Matรฉriel vรฉgรฉtal
2.3. Isolement du principe actif
3. Rรฉsultatsย
4. Analyse structurale de la molรฉcule bioactive isolรฉe
4.1. Interprรฉtation du spectre de masse
4.2. Interprรฉtation de la RMN 1D et 2D
5. Discussionย
CONCLUSION
REFERENCES
ANNEXES
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