Soutenance mémoire
Mode d’action des antibiotiques
Pour être opérant, l’antibiotique doit pouvoir approcher son site d’action, de l’extérieur vers l’intérieur, en empruntant des voies privilégiées:
– attaquer la paroi bactérienne avec ses caractéristiques Gram positif ou négatif,
– pénétrer et désorganiser la membrane interne,
– désorganiser la machinerie de l’appareil génétique telle i) la topologie de l’ADN et sa transcription en ARN ii) la traduction de l’ARN en acides aminés, l’assemblage en protéines.
Les familles des ATB sont classées selon leur mode d’action, leur spectre et leur cible :
-la paroi : beta-lactamamines, glycopeptides, fosfomycine,
-le ribosome: aminosides, synergistines, macrolides, ketolides, lincosamides, trétracyclines, acide fusidique, phénicolés, oxazolidinone,
-l’ADN : quinolones, rifamycines, nitriimidazolés, sulfamides,
-les membranes : polymyxines, lipopeptides.
Les principales classes d’ATB en pratique courante sont :
-Beta lactamines (noyau β lactam : penam, cephem, monobactam), ciblant les protéines liant les penicillinases (PLP) et impliquées dans la synthèse du peptidoglycane par blocage de la formation de paroi bactérienne.
-Glycopetides (Vancomycine), ciblant dipeptide terminal au niveau du précurseur du peptidoglycane à la surface externe de la membrane plasmique. Ils agissent sur les bactéries en division en inhibant les dernières étapes de la synthèse du peptidoglycane, d’où un blocage de la formation de la paroi.
-Aminosides, ciblant la sous unité 30 S du ribosome où ils se fixent de façon irréversible en inhibant ainsi la traduction par provocation des erreurs de lecture de l’ARN messager. Il en résulte un blocage de la synthèse protéique.
-Quinolones (1ère, 2ième, 3ièmeGénération), qui interviennent dans le maintien de la bonne conformation de l’ADN et ils inhibent la réplication de l’ADN bactérien
La résistance des bactéries aux antibiotiques
L’échappement de certaines bactéries aux actions des ATB a été prédit dès 1945 par A. Fleming. Chaque lancement d’une nouvelle molécule s‘accompagne de l’émergence des bactéries résistantes, quelque temps après et à des degrés divers. A titre illustratif, nous nous concentrerons sur deux bactéries d’intérêt clinique :
– des souches de Staphylocoques aureus sont devenues résistantes après un an du lancement de la pénicilline G en 1942 et celui de la Méticilline en 1961, avec l’avènement SARM (Staphylococcus Aureus Résistant à la Méticilline).
– Le scenario est similaire pour les entérobactéries, sensibles initialement à l’ampicilline.
Ces résistances sont tantôt focalisées sur un antibiotique, tantôt sur plusieurs antibiotiques d’où la notion de BMR (Bacille Multi-Résistant). Les multi résistances aux ATB peuvent être naturelles et acquises, elles ne sont plus sensibles qu’à un petit nombre d’antibiotiques sensé et habituellement actifs en thérapeutique in vivo.
L’âge le sexe et le statut socio-économique
Dans notre étude, les résultats montrent que la tranche d’âge de prédilection est une population des jeunes actifs moins de 30 ans, représentant plus de la moitié [52,16%] de la taille de la série. La population de l’étude est à prédominance masculine [67,44%] et leur activité concerne le plus souvent le secteur I [62,7%]. Selon la littérature, l’âge moyen des patients atteints d’infections après des interventions non prothétiques des membres en France, est de 44 ans + ou – 20 ans (50). Au Brésil, l’âge moyen est de 55,20% + ou – 15 ans (51). La prédominance masculine a été également rapportée dans la littérature, car la prévalence masculine des infections en Espagne est de 84% (52). Dans notre série, l’âge moyen est de 36,72 ans et le sexe ratio de 2,1. Les différents facteurs de risque peuvent trouver effectivement des explications propres au contexte malgache: i) la base de la pyramide des âges à Madagascar est constituée de jeunes ii) le secteur I du secteur formel ou informel attire la majorité de population Malgache iii) l’exposition aux accidents est liée à la nature intrinsèque des travails dans le secteur I, lesquels accidents sont sources de lésions ou de plaies facilement infectables. Les facteurs favorisants sont l’inexpérience des jeunes ou l’insuffisance de prévention des accidents de circulation ou accidents sur les lieux de travail. Dans l’évocation d’autres facteurs contributifs, les conséquences infectieuses des accidents liés à la délinquance de jeunesse, la nature brutale des hommes et la négligence de l’hygiène chez les hommes que chez les femmes.
CONCLUSION
La pathologie infectieuse de l’appareil locomoteur devient de plus en plus fréquente et pose un problème de prise en charge. L’examen bactériologique est une étape fondamentale pour le diagnostic et le traitement adéquat des infections. Les sujets jeunes, le sexe masculin et les travailleurs dans le secteur primaire sont les plus exposés suite à la fréquence des accidents. Le membre inférieur est le siège des lésions le plus fréquemment retrouvé. L’existence des infections nosocomiales majoritairement liée aux infections du site opératoire est révélée, et la prévalence des infections communautaires non négligeable est aussi importante que celle des infections nosocomiales dont la prévention est difficile du fait de la précarité des mesures d’hygiène dans l’ensemble des USFR. Les résultats des antibiogrammes sont largement dominés par Staphylococcus aureus, suivi de Pseudomonas aeruginosa. L’isolement des bacilles multi-résistants surtout dans le groupe de staphylocoque illustre bien le risque permanant de l’extension des infections. La plupart de nos patients répond parfaitement aux traitements que nous avons institués. Dans tous les cas, la prise en charge des infections demande la participation de tous. D’où l’importance de la priorité des projets des USFR et du renforcement de la lutte contre les infections nosocomiales au sein du CHU en insistant sur l’importance des lavages des mains, de l’isolement septique et de la surveillance de l’usage des antibiotiques à l’hôpital
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Table des matières
INTRODUCTION
REVUE DE LA LITTERATURE
A-Rappel des champs couverts par l’infectiologie
1. Définitions
2. Place phylogénique des bactéries dans le monde vivant
3. La localisation des bactéries
3.1 Au sein du monde du vivant
3.2 Dans le corps humain ou chez l’animal
3.3 Dans l’environnement
4. Les relations de l’hôte avec les agents pathogènes
4.1- La modélisation de l’exposition aux germes
4.2- Le cheminement vers l’infection
4.3 Les propriétés des germes incriminés, cause d’infection
B-Rappels des fondamentaux en bactériologie clinique
1. Regard du fondamentaliste
1.1 Caractérisation de la bactérie
a) Morphologie
b) Structure générale
. composants obligatoires
. composants facultatifs
c) Métabolisme et fonctions
1.2 Classification de la bactérie selon ses caractéristiques
1.3 Identification de la bactérie en pratique de laboratoire
a) les méthodes en routine de laboratoire de microbiologie
a.1 Bactérioscopie
a.2 Culture bactérienne sur milieux de culture
a.3 Tests aux enzymes
b) les autres outils de laboratoire
b.1 Sérologie ou sérodiagnostic
b.2 Recherche d’antigènes solubles
b.3 CR
b.4.RN16S
2 Regards à l’interface clinique-microbiologie
2.1 L’antibiotique vu à l’interface clinique-microbiologie
2.2 Mode d’action des antibiotiques
2.3 L’antibiogramme, l’examen de référence
2.4 La résistance des bactéries aux antibiotiques
2.5 Mécanisme de la résistance aux antibiotiques
3. Regard du clinicien au chevet du patient infecté
3.1 L’antibiothérapie en clinique
3.2 Le profil bactérien en clinique
3.2.1- le profil selon l’âge du patient
3.2.2- le profil bactérien selon les milieux d’acquisition de l’infection
a) Définition INOSO
b) l’ampleur du phénomène
c) Classification INOSO
3.2.3- Cas particulier de l’orthopédie-traumatologie
3.3 Démarche clinico-biologique devant une infection du chirurgien orthopédique
3.3.1 L’interrogatoire
3.3.2 L’examen clinique
3.3.3 L’examen paraclinique
C-Revue de la littérature en bactériologie clinique
1. Problématique à l’échelle internationale
a- Dans les pays du Nord
b- Dans les pays du Sud
c- Problématique à l’échelle malgache
MATERIELS ET METHODES
1. Justification de l’étude
2.Objectif
3. Le cadre de l’étude
4. Les critères d’étude
Matériels
Méthodes
Le protocole de l’étude
Paramètres d’étude
Le traitement des données – Analyses statistiques
RESULTATS
Résumé des observations médicales
1-La fréquence
2- Les caractéristiques des patients infectés
2.1 – L’âge
2.2 -Les caractéristiques des patients selon le sexe et le statut socioéconomique
2.3- La provenance des patients infectés admis dans le service
2.4 -La topographie anatomique des sites infectieux
2.5 – Les caractéristiques des infections
3 – Nature des germes identifiés sur les cultures positives
3.1-le profil bactérien global
3.2-Les associations bactériologiques sur les sites de prélèvement
3.3-La répartition des résistances bactériennes aux antibiotiques
4 – Les Corrélations clinico-bactériologiques
4.1-La typologie des germes classés selon la provenance des patients admis dans l’unité d’orthopédie
4.2 -La répartition des germes selon les caractéristiques des infections
5 – L’évaluation du traitement infectieux
5.1 – La répartition des patients infectés selon le traitement institué
5.2 – La répartition des patients selon l’évolution et le pronostic
5.3 – La durée d’hospitalisation dans l’unité A d’orthopédie
5.4 -La relation entre la durée de séjour et les caractéristiques clinico – bactériologiques des sujets
DISCUSSIONS
1) Fréquence des infections
2) Caractéristiques des patients
2.1) L’âge le sexe et le statut socio-économique
2.2) La provenance des patients
2.3) Les topographies anatomiques des infections
2.4) Les caractéristiques des infections
3) La nature des germes identifiés
3.1) profil bactérien des infections de l’unité d’orthopédie
3.2) Association des germes
3.3) Résistance bactérienne
4) Corrélation clinico-bactériologique
4.1 La typologie de germe classée selon la provenance des patients
4.2 La typologie des germes classés selon l’acquisition d’INOSO-ICOMMU
5) L’évaluation du traitement infectieux
5.1) Le traitement aux antibiotiques
5.2) L’évolution et pronostic
5.3) La relation entre la durée d’hospitalisation, l’INOSO-ICOMMU
Suggestion
Conclusion
ANNEXES
BIBLIOGRAPHIES
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