Transcription des microARN

Table des matières

INTRODUCTION
PARTIE 1 : RÔLES ET BIOSYNTHÈSE DES MICROARN
1. Rôles des microARN
1.1. Découverte des microARN
1.2. MicroARN chez les métazoaires
1.3. MicroARN chez les plantes
1.4. MicroARN et physiologie
1.4.1. MicroARN et cellules souches
1.4.2. MicroARN et cellules germinales
1.4.3. MicroARN et cycle cellulaire
1.4.4. MicroARN, hématopoïèse et immunité
1.4.5. MicroARN et tissu nerveux
1.4.6. MicroARN et muscles
1.5. MicroARN et pathologie
1.5.1. MicroARN et cancers
1.5.2 MicroARN et maladies cardiovasculaires
1.5.3. MicroARN et maladies du système nerveux central
1.5.4. MicroARN et maladies génétiques
1.5.5. MicroARN et maladies infectieuses
2. Identification et nomenclature des microARN
2.1. Méthodes d’identification des microARN et de leurs cibles
2.2. Nomenclature des microARN
3. Gènes à l’origine des microARN
3.1. MicroARN exoniques
3.2. MicroARN introniques
3.2.1. Introns de régions non codantes
3.2.2. Introns de régions codantes
3.2.3. Mirtrons, courts introns de régions codantes
3.3. MicroARN mixtes
3.4. Groupe de gènes (cluster)
4. Transcription des microARN
4.1. Action de l’ARN polymérase
4.2. Structure des transcrits primaires
4.3. Cas particulier des mirtrons
5. Maturation des microARN
5.1. Action de Drosha dans le noyau
5.1.1. Composition de Drosha
5.1.2. Sélection du site de clivage
5.2. Transport par exportin-5
5.2.1. Modalités de l’export
5.2.2 Exportin-5 et stabilité du pré-microARN
5.3. Action de Dicer dans le cytoplasme
5.3.1. Composition de Dicer
5.3.2. Sélection du site de clivage
5.3.3. Résultat du clivage
5.4. Sélection du brin guide
5.4.1. Assemblage du miRISC
5.4.2. Modalités de sélection
5.4.3. MiARN mature et devenir du brin passager
6. Schéma récapitulatif
7. Alternatives à cette synthèse classique des microARN
7.1. Voie des mirtrons, indépendante de Drosha
7.1.1. Mirtrons classiques
7.1.2. Mirtrons à queue en 5’
7.1.3. Mirtrons à queue en 3’
7.1.4. Schéma récapitulatif
7.2. Voie des miARN dérivés de shARN endogènes
7.3. Voie indépendante de Dicer
PARTIE 2 : MODES D’ACTION ET RÉGULATION DES MICROARN
1. Reconnaissance de l’ARNm cible
1.1. Composition du miRISC
1.1.1 Protéines Argonautes
1.1.2. Protéines GW182
1.2. Site d’hybridation (seed )
1.3. Appariements supplémentaires et compensatoires
1.4. Importance de l’accessibilité du site
2. Clivage et dégradation de l’ARNm
2.1. Conditions nécessaires
2.2. Clivage de l’ARNm
3. Blocage de la traduction de l’ARNm
3.1. Généralités sur la traduction de l’ARNm
3.2. Déadénylation de l’ARNm
3.2.1. Généralités sur la dégradation des ARNm
3.2.2. Mécanisme de la déadénylation médiée par les microARN
3.3. Inhibition de l’initiation de la traduction
3.3.1. Inhibition de la reconnaissance de la coiffe
3.3.2. Inhibition du recrutement de la sous-unité 60S
3.4. Séquestration de l’ARNm dans des corps cytoplasmiques
3.5. Inhibition aux étapes post-initiation
4. Activation de l’ARNm
4.1. Exemples d’activation
5. Régulation des microARN
5.1. Régulation de la transcription des gènes à microARN
5.1.1. Activateurs et répresseurs de transcription des miARN
5.1.2. Boucles de rétrocontrôle de l’expression des miARN
5.2. Régulation de la maturation des microARN
5.2.1. Régulation du clivage par Drosha
5.2.2. Régulation du clivage par Dicer
5.2.3. Les miARN isoformes
5.2.4. Edition de l’ARN
5.3. Régulation des fonctions des microARN
5.3.1. Au niveau des protéines Ago
5.3.2. Au niveau des protéines GW182
5.3.3. Protéines autres que GW182 et Ago
5.3.4. Interactions entre miRISC et RNP
5.3.5. Edition de l’ARN
5.4. Turn-over des microARN
5.4.1. Conditions cellulaires affectant la stabilité des miARN
5.4.2. Enzymes dégradant les miARN
5.4.3. Fonctions régulatrices des ARN cibles
PARTIE 3 : MICROARN ET INFECTION VIRALE
1. Virus et microARN
1.1. Origine et identification des microARN viraux
1.2. Nomenclature des microARN viraux
2. MicroARN viraux
2.1. Gènes à l’origine des microARN viraux
2.2. Synthèse des microARN viraux
2.2.1. Synthèse classique
2.2.2. Voies alternatives
2.3. Modes d’action des microARN viraux
2.4. Fonctions des microARN viraux
2.4.1. Longévité accrue des cellules infectées
2.4.2. Echappement à la réponse immunitaire
2.4.3. Régulation du déclenchement du cycle lytique
2.4.4. Autres fonctions
3. Influence des virus sur les microARN cellulaires
4. Influence des microARN cellulaires sur les viru
4.1. Régulation négative
4.2. Régulation positive
4.3. Tropisme tissulaire
5. MicroARN et herpès virus
CONCLUSION 
BIBLIOGRAPHIE