TLRs et Paludisme

Table des matières

I. INTRODUCTION
OBJECTIFS
II. GENERALITES 
1. Epidémiologie
2. Cycle de vie du parasite
3. Physiopathologie
4. Système immunitaire de l’hôte
4.1 Immunité innée
4.2 Immunogénétique de la réponse de l’hôte humain
5 Cas spécifique l’enfant
6. Méthodes de diagnostic
7. Les molécules antipaludiques
8. Les méthodes utilisées pour l’étude de l’expression génétique
8.1 Isolation d’ARN total
8.2 Techniques d’analyse des ARN
9. Aspects spécifiques et challenges
IV. METHODOLOGIE 
1. Démarche méthodologique
2. Matériels et méthodes
2.1 Cadre et lieu d’étude
2.2 Population d’étude
2.3 Période d’étude
2.4 Echantillonnage
2.5 Organisation du travail
2.6 Techniques de l’étude
2.7 Analyse Microarray
2.8. Validation des données par la qRT-PCR : Méthode de Taq Man
V. RESULTATS
1. Identification des patients
1.1 Résultats cliniques
1.2 Résultats parasitologiques
2. Optimisation des techniques de lymphoséparation
3. Examen des molécules d’ARN total
3.1 Evaluation de la concentration et la pureté des échantillons
3.2 Evaluation de l’intégrité des échantillons par électrophorèse
3.3 Validation des échantillons par le Bioanalyser 2100 Agilent
4. Résultats des microarrays
4.1 Résultats par comparaison des stades A et C
4.2 Résultats par comparaison des stades A, B et C
4.3 Résultats par comparaison des stades A, B et C avec seuil de filtrage 1,5
VI. COMMENTAIRES ET DISCUSSION 
VII. CONCLUSION ET RECOMMANDATIONS 
VIII. ANNEXES
Annexe 1 : Extraction d’ADN génomique avec le QIAmp® DNA Mini Kit
Annexe 2 : Extraction d’ARN avec le Kit RiboPure™-Blood
Annexe 3 : Protocole pour l’électrophorèse d’ARN total
Annexe 4 : Lavage de l’ARN total avec le Kit Rneasy® Cleanup
IX. REFERENCES BIBLIOGRAPHIQUES
X. RESUME