Pomme de terre et biotechnologie : Utilisations industrielles

Table des matières

Introduction générale
Revue bibliographique
I)-Quelques notions sur la pomme de terre
1)- Production de la pomme de terre à l’échelle marocaine
2)-Pomme de terre et biotechnologie : Utilisations industrielles
3)- Facteurs influençant la production de la pomme de terre
4)- Principales maladies bactériennes de la pomme de terre
II)- Généralités sur les Erwinia
1)-Notions générales
1-1)-Erwinia chrysanthemi
1-2)-Erwinia carotovora (Pectobacterium carotovorum)
2)-Phytopathogénicité d’Erwinia
2-1)-Enzymes dégradatives de la bactérie E. chrysanthemi
a)-Pectinaes
b)-Cellulases
c)-Protéases
2-2)-Rôle des gènes « pel » dans le développement de la macération du tubercule des pommes de terre
2-3)-Autres déterminants du pouvoir pathogène d’E. chrysanthemi
a)-Rôle des composantes de la surface bactérienne
b)-Rôle de l’assimilation du fer par E. chrysanthemi dans la mise en œuvre et la progression de la phytopathogénicité
c)-Rôle de la mobilité et du chimiotactisme dans le développement de la phytopathogénicité d’E. chrysanthemi
d)-MsrA comme agent de défense contre le stress oxydatif
2-4)-Mécanisme du développement de la pourriture molle par E.chr chez les pommes de terre
III)- Moyens du contrôle de la pathogénicité de Dickeya spp
1)- Contrôle physique
2)-Contrôle chimique
3)-Contrôle biologique
Matériel et méthodes
I)-Origine des isolats faisant l’objet de l’étude
II)-Isolement, purification et identification des isolats
1)-Isolement et purification des isolats
2)-recherche et caractérisation biochimiques d’Erwinia chrysanthemi et des isolats purifiés
2-1)-Révélation de l’activité cellulase
2-2)-Révélation de l’activité amylase
2-3)-Révélation de l’activité pectinase
2-4)-Test de pathogénicité des isolats sur les tubercules de pommes de terre
III)-Dosage des activités enzymatiques
1)-Dosage de l’activité cellulase
2)-Dosage de l’activité amylase
3)-Dosage de l’activité pectinase
IV)-Identification moléculaire des isolats: Réaction de polymérisation en chaine (PCR)  
1)- Principe de la PCR
2)- Protocole expérimental
2-1)-Extraction rapide de l’ADN par choc thermique
2-2)- Préparation du mixte de PCR
2-3)- Electrophorèse sur gel d’agarose
a)-Préparation du gel
b)-Dépôt des produits d’amplification
c)-Migration et visualisation du gel
V)-Recherche des bactéries antagonistes des Erwinia chrysanthemi
1)-Méthode de surcouche
2)-Méthode de stries
Résultats et discussion
I)-Caractérisation biochimique des isolats purifiés
1)-Révélation de l’activité cellulase
2)-Révélation de l’activité amylase
3)-Révélation de l’activité pectinase
II)-Test de pathogénicité des isolats sur les tubercules de pommes de terre
III)-Dosage des activités enzymatiques
1)-Croissance et activité cellulolytique des isolats
2)-Croissance et activité amylolytique des isolats
3)-Croissance et activité pectinolytique des isolats
IV)-Identification moléculaire des isolats: Réaction de polymérisation en chaine (PCR)
V)-Recherche des bactéries antagonistes des Erwinia chrysanthemi
1)-Méthode de surcouche
2)-Méthode de stries
Conclusion et perspectives  
Références bibliographiques