L’origine et l’héritabilité des variants phénotypiques

Table des matières

CHAPITRE I : INTRODUCTION GENERALE
I.1. L’ADAPTATION
I.2. ADAPTATION ET VARIABILITE PHENOTYPIQUE
I.2.1. Origine et héritabilité variants phénotypiques
I.2.1.1. Les théories de l’évolution adaptative
I.2.1.2. Origines des variants phénotypiques
I.2.1.3. Exemples d’héritabilité non mendélienne
I.2.2. Les deux systèmes d’héritabilité « Dual inheritance system »
I.3. NOTION D’EPIGENETIQUE
I.3.1. Porteurs de l’information épigénétique
I.3.1.1. La méthylation de l’ADN
I.3.1.1.1. La 5-méthylcytosine (5mC)
I.3.1.1.2. Méthylation de l’ADN chez les vertébrés vs les invertébrés
I.3.1.1.3. La 5-hydroxyméthylcytosine (5hmC)
I.3.1.2. Les modifications des histones
I.3.1.3. Les ARN non codants
I.3.1.4. La localisation nucléaire des loci
I.3.2. Etat chromatinien : Euchromatine / Hétérochromatine
I.4. MODELE THEORIQUE : GENETIQUE / EPIGENETIQUE / VARIABILITE PHENOTYPIQUE
I.5. INTERACTIONS HOTES / PARASITES : BON MODELE POUR LA BIOLOGIE EVOLUTIVE
I.5.1. Modèle d’étude : Biomphalaria glabrata / Schistosoma mansoni
I.5.1.1. La bilharziose : Deuxième endémie parasitaire mondiale
I.5.1.2. Cycle de vie de S. mansoni
I.5.2. La théorie de la Reine Rouge
I.5.2.1. « Gene for gene »
I.5.2.2. « Matching phenotype »
I.5.3. Polymorphisme de compatibilité
I.5.3.1. Polymorphisme de compatibilité – traits de vie
I.5.3.2. Polymorphisme de compatibilité moléculaire
I.5.4. Mécanismes de diversification des éléments clés de l’interaction
I.5.5. Régulation épigénétique des interactions hôte / parasite
I.5.5.1. Epigénétique chez S. mansoni et B. glabrata : Etat des connaissances
I.5.5.1.1. Epigénétique chez S. mansoni
I.5.5.1.2. Epigénétique chez B. glabrata
I.5.5.2. Régulation épigénétique des SmPoMucs chez S. mansoni
I.6. OBJECTIFS DE LA THESE
CHAPITRE II : IMPLICATION DE L’EPIGENETIQUE DANS LE SUCCES D’INFESTATION CHEZ LE PARASITE SCHISTOSOMA MANSONI
II.1. PARTIE 1 : LE ROLE DE L’EPIGENETIQUE DANS LA REGULATION DES SMPOMUCS
II.1.1. Contexte de la partie 1
II.1.2. Publication N°1: Schistosoma mansoni Mucin Gene (SmPoMuc) Expression: Epigenetic Control to Shape Adaptation to a New Host
II.2. PARTIE 2 : LES BASES EPIGENETIQUES DES VARIANTS PHENOTYPIQUES ADAPTATIFS CHEZ LE PARASITE SCHISTOSOMA MANSONI
II.2.1. Contexte de la partie 2
II.2.2. Approches méthodologiques
II.2.2.1. Les croisements et génération des hybrides de S. mansoni
II.2.2.2. Le traitement de S. mansoni à la Trichostatin A (TSA)
II.2.3. Publication N°2 : Epigenetic origin of adaptive phenotypic variants in the blood-fluke Schistosoma mansoni
II.2.4. Résultats complémentaires non publiés
II.2.5. Tests statistiques
CHAPITRE III : CONCLUSION GENERALE