Table des matières
Liste des enseignants
Dédicaces et remerciements
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Table des tableaux
Table des illustrations
Table des cartes
Table des schémas
PREMIERE PARTIE : BIBLIOGRAPHIE
CHAPITRE I : LES STRONGLES GASTRO-INTESTINAUX CHEZ LES OVINS
A. Généralités
B. Biologie des strongles gastro-intestinaux
1. Un cycle parasitaire impliquant une phase libre dans le milieu extérieur
2. Ecologie des stades libres : une forte dépendance aux conditions d’humidité et de température
(a) De l’œuf à la L3
i. Température et développement des stades pré-infestants
ii. Humidité relative, Hygrométrie, Pluviométrie et développement des stades pré-infestants
(b) Survie de la L3 et migration
i. Survie de la L3
ii. Migration hors des fèces
3. Distribution actuelle des espèces de SG et leurs perspectives
C. Physiopathologie, conséquences cliniques de l’infestation et diagnostic
1. Action pathogène des SGI
(a) Haemonchus contortus
(b) Teladorsagia circumcincta et Trichostrongylus colubriformis
2. Réponse immunitaire de l’hôte
3. Diagnostic des strongyloses gastro-intestinales
CHAPITRE II : L’ELEVAGE OVIN FRANÇAIS ET PLACE DE LA CONDUITE EN PATURAGE DANS LA FILIERE OVIN VIANDE
A. Généralités sur l’élevage ovin viande et ses systèmes de production en France
1. Effectifs et chiffres-clefs
2. Races ovines allaitantes et systèmes de production
(a) Système transhumant pyrénéen
(b) Système herbager
(c) Système intensif de production
B. Les conséquences zootechniques du parasitisme gastro-intestinal
CHAPITRE III : LA LUTTE CONTRE LE PARASITISME GASTRO-INTESTINAL : QUELLE(S) STRATEGIE(S) ?
A. Stratégie unimodale : la lutte chimique
1. Molécules anthelmintiques historiquement utilisées
(a) Lactones macrocycliques
(b) Benzimidazolés
(c) Salicylanilidés
(d) Imidothiazolés
(e) Dérivés de l’amino acétonitrile ou DAAs
2. Et résistance aux anthelminthiques : une problématique mondialement d’actualité
(a) Qu’est-ce que la résistance ?
(b) Qui concerne-t-elle ?
(c) Quels en sont les mécanismes ?
(d) Quand la suspecter et comment l’objectiver ?
(e) Quelles conclusions peut-on en tirer ?
B. Stratégie multimodale et avènement des stratégies de lutte intégrée
1. « Targeted treatments » et « targeted selective treatments » : Vers un usage raisonné des anthelminthiques en élevage
2. Agir en amont : la sélection génétique dans les stratégies de contrôle du parasitisme gastro-intestinal ovin
3. L’alimentation, une piste d’avenir ?
4. Une gestion agronomique orientée vers une limitation de l’infestation
(a) Origine et conception du pâturage cellulaire
(b) Implications en matière de lutte contre les SGI
DEUXIEME PARTIE : MATERIEL ET METHODES
CHAPITRE I : PRESENTATION DU SITE EXPERIMENTAL ET DES ANIMAUX A. Le site du Mourier
1. Localisation
2. Des relevés réguliers de température et de pluviométrie sur le terrain
3. Une hauteur d’herbe régulièrement contrôlée
B. Protocoles de pâturage, allotement
1. Organisation du parcellaire
2. Allotement des brebis et conduite
(a) Conduite en pâturage tournant
(b) Conduite en pâturage cellulaire
(c) Critères d’allotement et de conduite
CHAPITRE II : OUTILS DE DETERMINATION DE LA CHARGE PARASITAIRE ET DE L’HELMINTHOFAUNE
A. Coprologies individuelles et de mélange
1. Coprologies individuelles
2. Coprologies de mélange
B. Coprocultures de groupe
C. PCR temps réel sur matrice larvaire : un outil de détermination de la composition de l’helminthofaune
CHAPITRE III : AUTRES DONNEES COLLECTEES
A. Indicateurs cliniques et zootechniques
1. Note d’état corporel (NEC)
2. Indice de diarrhée (ID)
3. Sang veineux
B. Traitements antiparasitaires
CHAPITRE IV : TRAITEMENT DES DONNEES A. Préliminaires
B. Analyses
TROISIEME PARTIE : RESULTATS CHAPITRE I : ELEMENTS DE CONTEXTE
CHAPITRE II : CONDUITE DES BREBIS A. Principe de calcul des temps de retour par cellule
B. Premiers constats sur les systèmes mis en place
C. Evolution du chargement instantané dans les deux systèmes
CHAPITRE III : APPORTS DE LA COPROLOGIE ET DE LA qPCR
Sous-partie 1 : chez les brebis A. Données brutes d’excrétion d’œufs et leur traitement statistique
1. OPG moyens et effet « saison »
2. OPG moyens dans les deux systèmes en fonction des classes d’âge
3. Proportions de fortes excrétrices dans chaque système
(a) Analyse sur l’ensemble des résultats (décembre 2016 à mai 2018)
(b) Analyse sur la base de données corrigée
B. Résultats de l’identification larvaire et de la quantification par qPCR
1. Identification morphologique larvaire
2. Enseignements de la qPCR sur la présence des trois espèces majeures au Mourier
Sous-partie 2 : chez les agneaux A. Apport de la coprologie
1. Coprologies individuelles
(a) SGI
(b) Oocystes
2. Identification morphologique des larves de strongles digestifs et résultats de qPCR
(a) Identification morphologique
(b) Résultats de q PCR
3. Identification morphologique des coccidies
B. Résultats cliniques et thérapeutiques
CHAPITRE IV : RESULTATS CLINIQUES ET THERAPEUTIQUES CHEZ LES BREBIS
A. Note d’état corporel
1. Effet système
2. Effets âge et saison
B. Indice de diarrhée
C. Hématocrites
D. Traitements antiparasitaires
QUATRIEME PARTIE : DISCUSSION
A. Quels premiers constats relatifs aux strongyloses gastro-intestinales à l’issue de deux ans d’étude ?
1. Un niveau d’excrétion moyen en système cellulaire qui n’est pas inférieur au système tournant
2. Une helminthofaune différente entre les deux systèmes
3. Des résultats cliniques, zootechniques et thérapeutiques à l’enseignement variable
B. Quelques points d’intérêt dans la conception de notre pâturage cellulaire comparé à d’autres systèmes basés sur les mêmes principes
CONCLUSION
AGREMENT SCIENTIFIQUE
REFERENCES BIBLIOGRAPHIQUES
