Le système racinaire des céréales une cible pour l’amélioration variétale ?

Table des matières

Introduction
1. Synthèse bibliographique
1.1. Le système racinaire des céréales
1.1.1. Architecture du système racinaire
1.1.2. Interaction racines – sol – microbiome : la rhizosphère
1.1.3. Le système racinaire des céréales : une cible pour l’amélioration variétale ?
1.2. Le mil
1.2.1. Biologie de la plante
1.2.2. Origine et domestication
1.2.3. Importance économique et sociale
1.2.4. Facteurs limitants la production du mil
1.3. Problématique du stage
2. Matériels et méthodes
2.1. Matériel végétal
2.2. Génotypage par séquençage
2.3. Modélisation de QTL : Bulk Segregant Analysis (BSA)
2.3.1. Simulation de la population F2
2.3.2. Analyses statistiques
2.4. Evaluation de l’homogénéité des lignées BC2F4
2.4.1. Diversité phénotypique de la croissance racinaire précoce des lignées BC2F4
2.4.2. Diversité génétique des lignées BC2F4
2.5. Analyse statistique des données
3. Résultat
3.1. Modélisation de QTLs : Analyse de ségrégation en masse (Bulk Segregant Analysis ou BSA)
3.1.1. Impact de la variation de qtl effect sur la précision d’estimation de la position de QTL
3.1.2. Impact de la variation du nombre d’individus d’une population en fonction de l’effet QTL
3.2. Analyses de lignées recombinantes fixées
3.2.1. Analyse de l’homogénéité génétique des lignées
3.2.2. Analyse de l’homogénéité phénotypique des lignées
4. Discussion 
Conclusion