Table des matières
Introduction générale
Première partie : La qualité des sols et le fonctionnement des écosystèmes terrestres
Chapitre I – La qualité des sols : Définitions du concept et facteurs
I.1. Introduction
I.2. Rôle de la qualité du sol dans le fonctionnement des écosystèmes
I.3. Santé et qualité des sols
I.4. Le concept de qualité des sols
Chapitre II – Evaluation de la qualité des sols
II.1. Approche fonctionnelle et indicateurs
II.2. Indices mathématiques de la qualité des sols
II.3. Les formes d’hétérogénéité et leur importance dans l’évaluation de la qualité des sols
II.3.1. Hétérogénéité spatiale
II.3.2. Hétérogénéité temporelle
II.3.3. Hétérogénéité fonctionnelle
II.4. La qualité physique, chimique et biologique des sols
II.4.1. La qualité chimique
II.4.2. La qualité physique
II.4.3. La qualité biologique
Deuxième partie : Modifications des relations sol-microorganismes-plantes au cours du processus de restauration de prairies alpines dégradées
Introduction : problématique, contexte et objectifs des travaux
Chapitre I – Organisation physique et activités bactériennes de sols alpins naturels, dégradés puis reconstitués
I.1. Abstract
I.2. Introduction
I.3. Material and methods
I.3.1. Field situations
I.3.2. Soil sampling strategy
I.3.4. Soil analysis
I.3.5. Microbial analysis
I.3.6. Statistical analysis
I.4. Results
I.4.1. Soil texture
I.4.2. Soil structure
I.4.3. Soil chemistry (total carbon and nitrogen contents, CEC)
I.4.4. Microbial activities
I.5. Discussion
I.6. References
Chapitre II – Réponses des communautés bactériennes à des modifications de la structure physique d’un écosystème prairial alpin : influence de la localisation des bactéries
II.1. Abstract
II.2. Introduction
II.3. Material and Methods
II.3.1. Field sites and soil sampling
II.3.2. Soil fractionation
II.3.3. Rhizosphere and non rhizosphere soil collection and root biomass measurement
II.3.4. Soil texture and C and N content
II.3.5. Extraction and purification of DNA from soil and fraction samples
II.3.6. Automated intergenic spacer analysis (A-RISA): global soil microbial community
II.3.7. PCR-RFLP on the nifH gene pool: the community of nitrogen-fixing bacteria
II.3.8. Statistical analysis
II.4. Results
II.4.1. Multivariate analysis of bulk soils and microenvironments
II.4.2. Bacterial community structure analysis from F2000-250 and F50-2 aggregate-size fractions
II.4.3. Bacterial community structure analysis from rhizosphere soil
II.5. Discussion
II.6. References
Conclusions
Troisième partie : Réponses du sol, de la flore et de la microflore bactérienne à des perturbations chimiques complexes
Introduction : problématique, contexte et objectifs des travaux
Chapitre I – Perturbations des propriétés physico-chimiques d’un sol lessivé soumis à l’épandage d’effluents de déchets d’incinération
I.1. Summary
I.2. Introduction
I.3. Materials and methods
I.3.1. Soil, leachates and field experiment
I.3.3. Aggregate stability test
I.3.4. Grain size distribution in presence of MSWI-leachates
I.4. Results
I.4.1. Field impact assessments
I.4.2. Aggregates stability test
I.4.3. Effects of leachates on grain size distribution
I.5. Discussion
I.6. Conclusion
I.7. References
Chapitre II – Réponses à court terme des communautés bactériennes telluriques : empreintes génétiques et activité potentielles
II.1. Abstract
II.2. Introduction
II.3. Materials and methods
II.3.1. Soil and experimental design
II.3.2. Chemical analysis
II.3.3. Microbial activities
II.4. Results
II.4.1. Immobilization of MSWI ash leachate components in soil columns
II.4.2. Microbial activities on day 30
II.4.3. Structure of soil bacterial communities on day 30
II.5. Discussion
II.6. References
Chapitre III – Réponses des plantes et des communautés bactériennes des perturbations chimiques complexes
III.1. Abstract
III.2. Introduction
III.3. Materials and methods
III.3.1. Experimental design
III.3.2. Soil contamination measurements
III.3.3. Plant biomasses and carbon nitrogen contents
III.3.4. Microbial community structure by Automatised – Ribosomal Intergenic Spacer Analysis
III.4. Results and discussion
III.4.1. Soil contamination
III.4.2. Effects of leachates on vegetation
III.4.3. Effects of leachates on soil microbial community structure
III.5. Conclusion
III.6. References
Chapitre IV – Elaboration d’une batterie de tests de phytotoxicité: Essais de laboratoire
IV.1. Résumé
IV.2. Introduction
IV.3. Matériel et méthodes
IV.3.1. Préparation des cultures expérimentales
IV.3.2. Paramètres mesurés
IV.3.3.Analyses statistiques
IV.4. Résultats et discussion
IV.4.1. Biomasses foliaires et racinaires
IV.4.2. Croissance des racines
IV.4.3. Biosynthèse de la proline
IV.5. Conclusion
Synthèse et conclusion
Conclusions générales et perspectives
Références bibliographiques
