La PCR (Polymerase Chain Reaction)

Table des matières

INTRODUCTION
CHAPITRE 1 : RAPPELS SUR LA PARATUBERLOSE BOVINE
1 – ETIOLOGIE
1.1 – Classification
1.2 – Morphologie
1.3 – Culture, caractères biochimiques
1.4 – Résistance
2 – EPIDEMIOLOGIE DESCRIPTIVE
2.1 – Situation nationale
2.2 – Situation internationale
3 – EPIDEMIOLOGIE ANALYTIQUE
3.1 – Espèces atteintes
3.2 – Sources et matières virulentes
3.3 – Modalités de transmission
3.3.1 – Transmission horizontale
3.3.2 – Transmission verticale
3.4 – Facteurs de réceptivité et sensibilité
3.4.1 – Facteurs intrinsèques
3.4.2 – Facteurs extrinsèques
4 – PATHOGENIE
4.1 – Devenir du germe dans l’organisme
4.1.1 – Portes d’entrées et extension locale
4.1.2 – Bactériémie
4.2 – Evolution et particularités de la réponse immunitaire
4.2.1 – La réponse immunitaire non spécifique
4.2.2 – L’immunité cellulaire
4.2.3 – L’immunité humorale
4.2.4 – Variation de la réponse immunitaire vis-à-vis de l’infection par M. paratuberculosis
5 – CLINIQUE
5.1 – Symptômes
5.1.1 – Stade 1 : Infection silencieuse
5.1.2 – Stade 2 : Maladie subclinique
5.1.3 – Stade 3 : Affection clinique
5.1.4 – Stade 4 : Affection clinique en fin d’évolution
5.2 – Les lésions de la paratuberculose bovine
5.2.1 – Lésions macroscopiques
5.2.2 – Lésions microscopiques
6 – IMPACT ECONOMIQUE
6.1 – En troupeau laitier
6.1.1 – Les effets sur la production
6.1.2 – Les effets sur la santé et la reproduction
6.1.3 – Effets sur l’état corporel et les réformes
6.2 – En troupeau allaitant
CHAPITRE 2 : DIAGNOSTIC DE LA PARATUBERCULOSE BOVINE ET MOYENS DE LUTTE
1 – DIAGNOSTIC DE LA PARATUBERCULOSE BOVINE
1.1 – Cadre épidémio-clinique
1.2 – Diagnostic de laboratoire
1.2.1 – Les Tests de diagnostic direct
1.2.1.1 – La bactérioscopie
1.2.1.2 – La culture
1.2.1.3 – La PCR (Polymerase Chain Reaction)
1.2.2 – Les tests de diagnostic indirect
1.2.2.1 – Exploration de la réponse immunitaire cellulaire
1.2.2.2 – Détection de la réponse immunitaire humorale
1.3 – Utilisation recommandée des tests selon la situation
1.3.1 – Confirmation d’un diagnostic clinique
1.3.2 – Confirmation de résultats positifs
1.3.3 – Estimation de la prévalence de la paratuberculose dans un troupeau
1.3.4 – Maîtrise de la paratuberculose
1.3.5 – Tests d’achat
1.3.6 – Tests d’exportation
2 – TRAITEMENT ET PROPHYLAXIE
2.1 – Traitement
2.2 – Prophylaxie
2.2.1 – Prophylaxie médicale : la vaccination
2.2.2 – Prophylaxie sanitaire
2.2.2.1 – Conduite des veaux à la naissance
2.2.2.2 – Conduite de l’élevage des veaux
2.2.2.3 – Conduite des animaux malades
2.2.2.4 – Conduite du troupeau adulte
CHAPITRE 3 : PLANS DE MAITRISE COLLECTIVE ET CERTIFICATION DES ELEVAGES BOVINS CONTRE LA PARATUBERCULOSE
1 – LA LUTTE COLLECTIVE CONTRE LA PARATUBERCULOSE BOVINE EN EUROPE ET DANS LE MONDE
1.1 – Programmes mis en œuvre dans les pays à faible prévalence
1.1.1 – En Norvège
1.1.2 – En Suède
1.1.3 – En Finlande
1.1.4 – En Australie
1.1.4.1 – Objectifs
1.1.4.2 – Protéger les zones indemnes
1.1.4.3 – Protéger les troupeaux non infectés
1.2 – Programmes mis en œuvre dans les pays à forte prévalence
1.2.1 – Aux Etats-Unis
1.2.1.1 – Principe
1.2.1.2 – Première étape: la formation
1.2.1.3 – Deuxième étape : la gestion
1.2.1.4 – Troisième étape : Les tests de troupeau et classification
1.2.2 – Aux Pays-Bas
1.2.2.1 – Histoire de la lutte contre la paratuberculose aux Pays-Bas
1.2.2.2 – Principes du programme
1.2.2.3 – Le processus d’assainissement des troupeaux infectés
1.2.2.4 – Le processus de certification
1.2.2.5 – Incitation à la participation au programme
2 – LA LUTTE COLLECTIVE CONTRE LA PARATUBERCULOSE BOVINE EN FRANCE
2.1 – Programme national pour la maîtrise de la paratuberculose en élevage bovin cliniquement infecté
2.1.1 – Diagnostic initial de la paratuberculose clinique
2.1.2 – Déroulement et contenu du plan de maîtrise
2.1.2.1 – Détection et réforme précoce des animaux excréteurs
2.1.2.2 – Maîtrise des risques sanitaires
2.1.2.3 – Gestion des échanges
2.1.3 – Critères de sortie du plan de lutte
2.2 – Programme national de contrôle des élevages négatifs
2.2.1 – Principes
2.2.2 – Conditions de garantie
2.2.2.1 – Tests de qualification
2.2.2.2 – Maintien de la qualification
2.2.2.3 – Achats d’animaux
2.2.2.4 – Confirmation de résultats positifs
2.3 – Les résultats
2.3.1 – Développement général des programmes de lutte contre la paratuberculose en France
2.3.2 – Programme de maîtrise en élevage infecté
2.3.3 – Programme de garantie
3 – POSSIBILITES DE LA MISE EN PLACE D’UNE CERTIFICATION DES ELEVAGES BOVINS FRANÇAIS VIS-A-VIS DE LA PARATUBERCULOSE BOVINE
3.1 – Certification des maladies non réglementées en France
3.1.1 – Présentation de l’ACERSA
3.1.1.1 – Création de l’ACERSA
3.1.1.2 – Organisation de l’ACERSA
Instance Administrative de Gestion
Instance technique de certification
Secrétariat Permanent
3.1.2 – Le système de Certification
3.2 – Processus d’évaluation de la faisabilité de la certification de la paratuberculose82
3.2.1 – Protocole de certification proposé
3.2.2 – Conclusion des études économiques
3.2.2.1 – Modèle de diffusion
3.2.2.2 – Coût évité de la maladie
3.2.2.3 – Coût de la certification
3.2.2.4 – Analyse coût/avantage
3.2.2.5 – Synthèse
CONCLUSION
BIBLIOGRAPHIE