La particule virale et son génome

Table des matières

Liste des abréviations
Table des figures
Table des tableaux
Introduction
PARTIE BIBLIOGRAPHIQUE : Connaissances actuelles sur les réoviroses aviaires
1. Les réovirus aviaires
1.1 Taxonomie
1.2 Structure
1.2.1 La particule virale et son génome
1.2.2 Les protéines virales
1.3 Propriétés physico-chimiques
1.3.1 Résistance à la température
1.3.2 Survie sur des matériaux retrouvés en élevage
1.3.3 Sensibilité aux variations de pH et aux désinfectants usuels
1.3.4 Sensibilité à la trypsine
1.4 Cycle de réplication
1.4.1 Réception de la particule virale au niveau de la membrane cellulaire
1.4.2 Entrée et décapsidation du virus
1.4.3 Expression génétique
1.4.4 Morphogénèse et sortie de la cellule
1.5 Modifications cellulaires induites par l’infection virale
1.5.1 Apoptose
1.5.2 Fusion cellule-cellule
1.5.3 Perméabilisation de la membrane
1.5.4 Résistance à l’interféron
2. La réovirose aviaire
2.1 Généralités
2.2 Les arthrites et ténosynovites virales
2.2.1 Historique
2.2.2 Pathogénèse et épidémiologie
2.2.3 Signes cliniques observés lors d’arthrite virale
2.2.4 Lésions macroscopiques
2.2.5 Modifications histologiques
2.2.6 Réponse immunitaire à l’infection
2.3 Autres implications pathologiques des réovirus
2.3.1 Le syndrome de malabsorption
2.3.2 Autres atteintes chez Gallus gallus
2.3.3 La réovirose chez d’autres espèces avicoles
3. Situation actuelle : émergence mondiale de nouveaux variants
3.1 De nombreux cas de réovirose décrits ces 20 dernières années
3.2 Le variant ERS
3.2.1 Découverte et isolement de la souche
3.2.2 Infection expérimentale d’individus SPF par la souche isolée
3.2.3 Des caractéristiques sérologiques différentes des souches connues
3.2.4 Autres cas impliquant le variant ERS par la suite
3.3 Réovirus émergents aux Etats-Unis
3.3.1 Manifestations cliniques
3.3.2 Lésions observées après autopsie
3.3.3 Caractérisation des souches
3.3.4 Autre exemple dans la même région
3.4 Exemple d’épisodes cliniques au Canada
3.4.1 Signes cliniques, lésions et évaluation de la séroprévalence
3.4.2 Caractérisation des agents pathogènes
3.5 Emergence de cas en France en 2011-2012
3.5.1 Contexte
3.5.2 Résultats
3.5.3 Discussion et conclusion
3.6 Résumé d’autres cas d’émergence rapportés
3.6.1 Tunisie (Kort et al., 2015)
3.6.2 Chine
3.7 Conclusion sur ces exemples
4. Stratégies de diagnostic et de lutte contre la réovirose
4.1 Méthodes de diagnostic
4.1.1 Diagnostic clinique et nécropsique
4.1.2 Apport de l’histologie
4.1.3 Mise en évidence directe du virus
4.1.4 Techniques sérologiques
4.1.5 Méthodes de typage des réovirus aviaires
4.1.6 Virulence et tropisme des souches
4.2 Les méthodes de lutte passent essentiellement par la vaccination
4.2.1 La vaccination contre la réovirose
4.2.2 L’adaptation de la prophylaxie face aux limites de la vaccination classique
PARTIE EXPERIMENTALE Etude épidémiologique et virologique de cas émergents de réovirose dans le Sud-Ouest de la France chez des poulets Label Rouge, 2016-2018
1. Contexte
2. Matériel et méthode
2.1 Critères d’inclusion des élevages dans l’étude
2.2 Visite d’élevage et prélèvements réalisés
2.3 Autopsie et prélèvements réalisés
2.4 Analyse virologique
2.4.1 Isolement du virus
2.4.2 Transcription inverse, réaction de polymérisation en chaîne (RT-PCR) et séquençage
3. Résultats
3.1 Signes cliniques
3.2 Pesées
3.3 Autopsies
3.4 Examen histologique
3.5 Analyse virologique
3.6 Analyse des épitopes
4. Discussion
Conclusion générale
Références bibliographiques