La flore intestinale normale

Table des matières

Résumé
Abstract
Liste des abréviations
Listes des figures
Listes des tableaux
Introduction
ChapitreI : Etude bibliographique
1.Écosystème gastro-intestinal : composition et évolution
1.1 Description générale
1.2 La microflore intestinale
1.3 Effets bénéfique
1.3.1 Participation à la nutrition
1.3.2 Protection contre les pathogènes
1.3.3 Fonction imunologique
1.4 Facteurs agissant sur la colonisation bactérienne
1.4.1 Influence du terrain génétique
1.4.2 Influence du terme de naissance
1.4.3 Influence du mode d’accouchement
1.4.4 Influence de l’alimentation
1.4.5 Influence des traitements médicamenteux
1.4.6 Influence des conditions d’hygiène
2.Les probiotiques
2.1Définitions
2.2Les propriétés fonctionnelles des Probiotiques
2.2.1 Survie des probiotiques dans le tube digestif chez l’Homme
2.2.2 Mécanismes d’action et d’adaptation des probiotiques
2.3Les probiotiques et leurs effets bénéfiques sur la santé
a) Les probiotiques et les infections gastro-intestinales
b) Les probiotiques et l’intolérance au lactose
c) les probiotiques et le cholestérol
d) Les probiotiques et la prévention du cancer du colon
e) Les probiotiques et les maladies inflammatoires de l’intestin
f) Les probiotiques et la perméabilité intestinale
g) Les probiotiques et la motilité de l’intestin
2.1 Les principales souches microbiennes à potentiel probiotique
3.Les Bifidobacteries
3.1 Définition
3.2 Ecologique des bifidobactéries
3.3 Taxonomie et les différents espèces:
3.4 Caractéristiques morphologiques , physiologiques et biochimiques des bifidobactéries:
3.4.1 Morphologie:
3.4.2 Physiologies des bifidobacteries :
3.4.2.1 Température:
3.4.2.2 L’Oxygène:
3.4.2.3 Le pH :
3.4.2.4 La sensibilité aux antibiotiques
3.4.2.5 Les besoins nutritionnels des bifidobacteries
3.4.3 Biochimie des bifidobacteries
3.4.3.1 Le Métabolisme
3.4.3.2 Métabolisme des vitamines
3.4.3.3 Production des substances antimicrobiennes
3.4.3.4 Les bifidobactéries en tant qu’agents aromatisants
3.5 Les caractéristiques des principales espèces utilisées dans les aliments
3.5.1 Bifidobacterium longum
3.5.2 Bifidobacterium bifidum
3.5.3 Bifidobacterium breve
3.5.4 Bifidobacterium infantis
3.5.5 Bifidobacterium lactis
3.5.6 B.Adolescentis
3.5.7 B.Pseudo Longum
3.5.8 B.Thermophilum
3.5.9 B.Suis
3.6 L’utilisation des bifidobactéries dans les produits laitiers
3.7. Propriétés génotypiques
3.7.1 La composition en bases cytosine-guanine del’ADN
3.7.2 Les plasmides
3.7.3 Les séquences d’ADN étudiées
Le gène codant pour la protéine Hsp60
L’espace intergénique 16S-23
Chapitre II : Matériel et méthodes
1 Provenance des échantillons
2 Milieux de Cultures
3 Isolementet purification des bifidobactéries
3.1 Purification des souches
3.2 Pré-identification des bifidobactéries
3.2.1 Étude macroscopique
3.2.2 Étude microscopique
3.3 Identification du genre
3.3.1 Recherche de la catalase
3.3.2 Recherche de l’oxydase
3.3.3 Recherche de type fermentaire
3.3.4 Mise en évidence de la production d’indole
3.3.5 Mise en évidence de l’uréase
3.3.6 Protéolyse de la gélatine.
3.3.7 Test de croissancesur bile (2 %)
3.3.8 Test de croissance en milieu hyper-salé
3.4 Caractérisation des espèces
3.5 Dosage de l’acide lactique et l’acide acétique par HPLC
3.6 Identification génotypiques des souches
3.6.1 Extraction de l’ADN
3.6.2 Amplification etséquençage du gène 16S rDNA
3.6.3 Séquençage
4 Résistance aux conditions gastro-intestinales stimulées
4.1 Tolérance aux conditions acides de l’estomac
4.2 Résistance aux sels biliaires
4.3 Résistance aux sucs gastriques
4.4 Résistance aux enzymes pancréatiques
5 Cinétique de croissance à différentes concentration de salinité en culture pure
6 L’ antibiogramme
7 La mise en évidence des interactions
7.1 Recherche des interactions entre les différentes espèces de Bifidobacterium et des espèces pathogènes
8 Conservation des souches bactériennes
8.1 Conservation courte durée.
8.2 Conservation longue durée
ChapitreIII :Résultats et discussion
Résultats
1.Isolement et purification
2.Pré-identification des souches
2.1 Aspect macroscopiques
2.2 Aspect microscopiques
2.3 Caractérisation du genre
2.4 Caractérisation des espèces
2.5 Dosage de l’acide lactique et l’acide acétique par HPLC
3.L’identification génétique des souches
3.1 Extraction de l’ADN
3.2 Amplification d’ADN
3.3 Séquençage
3.3.1 Séquences de quelque souche étudiée
4.Résistance aux conditions gastro-intestinales stimulées
4.1 Tolérance aux conditions acides de l’estomac:
4.2 Résistance aux sels biliaires
4.3 La résistance aux sucs gastriques
4.4 La résistance aux enzymes pancréatiques
5 .Cinétique de croissance à différentes concentration de salinité en culture pure
6 L’antibiogramme
7 La mise en évidense des interactions
Discussion
Isolement et identification phénotypique des souches
Identification génotypique des souches
Caractérisation technologique des souches étudiées
La mise en évidence des critères probiotiques des souches étudiées
Conclusion
Références bibliographiques
ANNEXES