La famille des Bunyaviridae

Table des matières

INTRODUCTION
PREMIERE PARTIE : SYNTHESE BIBLIOGRAPHIQUE
I. L’AGENT PATHOGENE : LE VIRUS DE SCHMALLENBERG
A. Taxonomie et phylogénie
1. Les arboviroses
2. La famille des Bunyaviridae
3. Le genre Orthobunyavirus et le sérogroupe Simbu
B. Caractéristiques structurales et moléculaires
1. Caractéristiques structurales
2. Propriétés antigéniques et contournement de la réponse immunitaire
3. Capacités de survie dans l’environnement
C. Epidémiologie
1. Espèces sensibles
a) Les ruminants domestiques
b) Les non-ruminants
(1) Les hommes
(2) Autres ongulés
(3) Carnivores et autres
2. Transmission
a) Transmission horizontale
(1) Transmission vectorielle : un moucheron du genre Culicoides
(a) Identification
(b) Biologie
(c) Epidémiologie du moucheron
(d) Météorologie et activité vectorielle
(2) Transmission vénerienne
(3) Autres
b) Transmission verticale
c) « Overwintering »
II. LE VIRUS DE SCHMALLENBERG CHEZ LES RUMINANTS DOMESTIQUES
A. Historique et épidémiologie descriptive de la maladie
B. Diagnostic de la maladie de Schmallenberg
1. Diagnostic clinique.
a) Les signes cliniques non spécifiques
b) Les malformations congénitales
c) Les troubles de la reproduction
2. Diagnostic post-mortem
a) Macroscopique
b) Histologique
(1) Lésions inflammatoires
(2) Lésions dégénératives
(a) Lésions vasculaires et pertes tissulaires
(b) Lésions de la moelle épinière
3. Diagnostic différentiel
4. Diagnostic biologique
a) Les prélèvements : Isolement et identification
(1) Tests indirects
(a) Enzyme-Linked Immunosorbent Assay (ELISA)
(b) Immunofluorescence indirecte
(c) Séroneutralisation virale (VNT)
(2) Tests directs
(a) RT-qPCR
(b) Isolement du virus sur culture cellulaire
(c) Isolement du virus par hybridation in-situ
C. Prévention et mesure de lutte
1. Hygiène et prophylaxie sanitaire : la lutte contre le vecteur
a) La lutte mécanique
b) La lutte écologique
c) La lutte chimique
d) Vaccination
e) Gestion de la reproduction
III. IMPORTANCE DU VIRUS DE SCHMALLENBERG CHEZ LES RUMINANTS SAUVAGES ET DE PARCS ZOOLOGIQUES
A. Quelques aspects généraux sur la conservation des espèces
1. Union Internationale pour la Conservation de la Nature
2. CITES
3. Le système TRACES
4. Plans d’élevage européens
B. Taxonomie et classification des ruminants domestiques et sauvages
1. Caractéristiques anatomiques
7 2. Caractéristiques phylogéniques
3. Quelques aspects de conservation
C. Etude de l’infection du SBV chez quelques espèces sauvages
IV. CONCLUSION
DEUXIEME PARTIE: PARTIE EXPERIMENTALE
I. OBJECTIFS
II. MATERIELS ET METHODES
A. Réalisation des prélèvements
B. Acheminement des prélèvements pour analyses
C. Informations sur les individus
D. Les analyses
1. Protocole : ELISA ID Screen® SBV Competition, ID Vet, France
2. Protocole de séroneutralisation virale
3. Protocole de RT-qPCR
a) Extraction
b) Amplification
c) Analyse selon le logiciel BLAST
4. Protocole souris IFNAR-/-
III. RESULTATS
A. Séropositivité entre les deux parcs
B. Résultats sérologiques par individu
C. Suivi de séropositivité sur plusieurs années
D. Suivi de la séropositivité en fonction de l‘âge
E. Suivi de la séropositivité en fonction du titre en anticorps
F. Suivi cinétique des anticorps
1. Bharal MA6125 (MJP)
2. Hippotrague noir (Beekse-Bergen)
G. RT-qPCR en temps réel et analyses BLAST
H. Examen des dossiers cliniques des animaux étudiés
I. Analyses sur souris IFNAR-/-
IV. DISCUSSION.
A. Les biais de l‘étude
B. Les risques d’introduction du SBV en parcs zoologiques
1. Une grande diversité d’espèces infectées
2. La persistance d’une immunité au fil des années
3. Une rapide dissémination du virus au sein des populations de ruminants en captivité
4. Réflexion sur l’activité des Culicoïdes en Europe et leurs rôles potentiels de transmission de la maladie en zones urbaines
C. La faune sauvage : un rôle de réservoir ?
1. Définition du rôle de réservoir
2. Les conséquences envisageables pour les espèces menacées : le spillover est-il à l’origine d’un danger pour les espèces en voie de disparition ?
D. Réflexion sur la gestion du SBV dans les parcs zoologiques
V. CONCLUSION
BIBLIOGRAPHIE