La carapace des tortues dulçaquicoles

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Table des matières

Table des figures
Table des graphiques
Table des tableaux
Introduction
Première partie : étude bibliographique
1. Etude bio-écologique de la cistude d’Europe
1.1. Systématique
1.2. Description physique
1.3. Biologie
1.3.1. Cycle de vie
1.3.2. Milieux de vie
1.3.3. Alimentation
1.3.4. Comportement d’insolation
1.3.5. Reproduction
1.3.6. Croissance et longévité
1.4. Répartition
1.5. Statut et mesures de protection
1.6. Menaces et risques sur l’espèce
1.6.1. Fragmentation, perte et dégradation de l’habitat
1.6.2. Prélèvements dans le milieu
1.6.3. Facteurs de mortalité
1.6.4. Impact de l’introduction d’espèces exotiques
2. La carapace des tortues dulçaquicoles
2.1. La carapace normale des tortues dulçaquicoles
2.1.1. Histologie
2.1.2. Anatomie
2.1.3. Physiologie
2.1.3.1. Les différentes fonctions du tégument
2.1.3.2. La mue
2.1.3.3. La cicatrisation
2.1.3.4. Croissance
2.2. Les pathologies de la carapace
2.2.1. Les affections traumatiques
2.2.1.1. Fractures de la carapace
2.2.1.2. Érosion du plastron
2.2.2. Affections nutritionnelles
2.2.2.1. Hypovitaminose A
2.2.2.2. Hypervitaminose A
2.2.2.3. Ostéofibrose nutritionnelle .
2.2.2.4. Ostéodystrophie hypertrophique
2.2.3. Affections parasitaires
2.2.3.1. Les plathelminthes
2.2.3.2. Sangsues
2.2.3.3. Mycoses
2.2.3.4. Algues
2.2.3.5. Spirorchides
2.2.4. Affections bactériennes de la carapace
2.2.4.1. Dermatite superficielle
2.2.4.2. Abcès et pyogranulomes
2.2.4.3. Dermatophilose
2.2.4.4. La dermatite ulcéreuse
2.2.5. Infections bactériennes générales affectant la carapace
2.2.5.1. Aéromonose
2.2.5.2. Pseudomonose
2.2.5.3. Salmonellose
2.2.5.4. Septicémie cutanée ulcéreuse
2.2.5.5. Autres septicémies
2.2.5.6. Mycobactériose
2.2.6. Affections virales
2.2.6.1. Fibropapillomatose
2.2.6.2. Maladie des taches grises
2.2.6.3. Poxvirose
2.2.7. Tumeurs non viro-induites
2.2.8. Autres affections
2.2.8.1. Dyskératose cutanée
2.2.8.2. Dermatite de contact
2.2.8.3. Anomalies de l’écaillure
Seconde partie : étude expérimentale
3. Etude épidémiologique
3.1. Définitions et objectifs
3.2. Matériel et méthodes
3.2.1. En Aquitaine
3.2.2. A la Tour du Valat
3.2.3. Dans la Réserve Naturelle de Chérine
3.2.4. Au centre d’élevage des tortues de A Cupulatta
3.2.5. En région Auvergne
3.2.6. Au Parc Zoologique de Sainte-Croix
3.2.7. France entière
3.3. Résultats
3.3.1. Impact du lieu de capture
3.3.2. Evolution temporelle du SUC
3.3.3. Susceptibilité des cistudes
3.3.4. Caractéristiques des lésions
3.3.5. Impacts du SUC
3.4. Discussion
3.4.1. Matériel et méthodes
3.4.2. Résultats
3.4.2.1. Distribution spatiale du SUC
3.4.2.2. Identification de facteurs favorisants
3.4.2.3. Evolution de la pathologie : forme épidémiologique
3.4.2.4. Susceptibilité des tortues
3.4.2.5. Caractéristiques des lésions .
3.4.2.6. Impacts du SUC
3.4.2.7. Bilan
4. Etude étiologique
4.1. Matériel et méthodes
4.1.1. Individus prélevés
4.1.2. Protocole de prélèvement
4.1.3. Protocole d’analyse
4.1.3.1. Culture et identification primaire
4.1.3.2. Identification poussée en spectrométrie MALDI-TOF
4.1.3.3. Analyse des résultats
4.2. Résultats
4.3. Discussion
4.3.1. Matériel et méthode
4.3.1.1. Protocole
4.3.1.2. Biostatistiques
4.3.2. Résultats
4.3.3. Conclusion
Conclusion
Liste des sigles et abréviations utilisés
Bibliographie
Annexes

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