Généralités sur la Rhizosphère

Table des matières

INTRODUCTION
SYNTHESE BIBLIOGRAPHIQUE
I. GENERALITES SUR LA RHIZOSPHERE
I.1. Définition
I.2. Exsudation racinaire
I.3. Les microorganismes rhizosphériques et leurs effets sur la plante
I.3.1. Les Bactéries
I.3.2. Les Champignons
I.3.3. Les Actinomycètes
II. INTERACTIONS BIOLOGIQUES ANTAGONISTES DANS LA RHIZOSPHERE
II.1. La compétition
II.2. L’antagonisme
II.2.1. Antibiose
II.2.2 Parasitisme et prédation
III. GENERALITES SUR LES CHAMPIGNONS PHYTOPATHOGENES
III.1. Evolution générale de l’infection d’une plante par les champignons phytopathogènes
III.1.1. Contamination
III.1.2. La pénétration
III.1.3. L’infection
III.1.4. La dissémination du pathogène
III.1.5. La conservation et la vitalité du pathogène
III.2. Exemple de champignon phytopathogène
III.2.1. Fusarium spp
III.2.1.1. Systématique
III.3. Lutte biologique contre les phytopathogènes
III.3.1. Définition
III.3.2. Mécanisme d’action des agents de lutte biologique
III.3.3. Exemples d’agents de lutte biologique contre les champignons phytopathogènes
III.3.4. Avantages de l’utilisation des agents de lutte biologique
III.3.5. Côtés négatifs des agents de lutte biologique
III.4. Autres moyens de lutte contre les champignons phytopathogènes
III.4.1. Pratiques culturales
III.4.2. Utilisation de fongicides
MATERIELS ET METHODES
I. MATERIELS
I.1. Matériels Biologiques
I.1.1. Isolats utilisés
I.1.1.1. Isolat fongique pathogène
I.1.1.2. Isolats bactériens
I.1.1.3. Réactivation des isolats
I.1.2. Les plantes utilisées
II. METHODES
II.1. Isolement des champignons phytopathogènes
II.1.1. Techniques d’isolement
II.1.1.1. Isolement sans désinfection préalable
II.1.1.2. Isolement avec désinfection préalable
II.1.2. Identification des isolats
II.1.3. Conservation des isolats
II.2. Test de virulence de Fusarium sp. sur la germination des plantes
II.2.1. Revivification des isolats de champignon
II.2.2. Stérilisation des graines
II.2.3. Dispositif du test de virulence
II.2.3.1. Contamination en pré-levée
II.2.3.2. Contamination en post-levée
II.2.4. Evaluation des résultats 7
II.3. Test de virulence de Fusarium sp. sur la croissance végétative des plantes
II.4. Les isolats microbiens antagonistes de champignons phytopathogènes
II.4.1. Identification et purification des isolats
II.4.2. Conservation des isolats
II.4.2.1. Gélose inclinée à 4°C
II.4.2.2. Conservation à -80°C
II.5. Test d’antagonisme des Pseudomonas et des Actinomycètes vis-à-vis de Fusarium sp
II.5.1. Test in vitro
II.5.1.1. Déroulement de la confrontation
II.5.1.2. Evaluation des résultats
II.5.2. Bioprotection de la tomate contre la fonte de semis causée par Fusarium
II.5.2.1. Préparation d’inoculum de Fusarium
II.5.2.2. Préparation d’inoculum de Pseudomonas et d’Actinomycète
II.5.2.3. Traitement des graines de plante avec les isolats de Pseudomonas et d’Actinomycète
II.5.2.4. Traitement du sol avec les isolats de Fusarium
II.5.2.5. Déroulement du test
RESULTATS ET INTERPRETATIONS
I Isolement et caractérisation morphologique des champignons phytopathogènes
I.1. Les isolats de champignons phytopathogènes
I.2. Caractéristiques morphologiques des isolats
I.2.1. Isolats Fo-01et Fo-02
I.2.2. Isolat Alt 01
I.2.3. Isolat Rh-01
I.2.4. Isolat Ni-01
I.2.5. Isolat Hel-01
I.2.6. Isolat Pn-01
II. Virulence des isolats de Fusarium sur la germination des graines in vitro
II.1. Virulence des isolats in vitro
II.1.1. Effet de Fo-01et Fo-02 sur la germination des graines in vitro
II.1.2. Effet de Fo-01et Fo-02 sur la croissance racinaire des plantes
III. Virulence des isolats de Fusarium in vivo
III.1. Virulence de l’isolat Fo-01
III.2. Virulence de l’isolat Fo-02
IV. Isolement des isolats d’Actinomycète et de Pseudomonas
V. Inhibition du développement de l’isolat Fo-02 par les isolats de Pseudomonas et d’Actinomycète in vitro
VI. Inhibition de la virulence de Fusarium Fo-02 par le Pseudomonas Ps16 et l’Actinomycète Ac66 in vivo
DISCUSSION
CONCLUSION ET PERSPECTIVES
REFERENCES BIBLIOGRAPHIQUES
ANNEXES