Etude sur le dromadaire

Table des matières

Introduction
Chapitre 1 : Synthèse bibliographique
1.Etude sur le dromadaire
1.1. Classification et importance du dromadaire
1.2 Morphologie et physiologie générale du dromadaire
1.3 Taxonomie
1.4 Répartition géographique et effectif
1.4.1 Dans le monde
1.4.2. En Algérie
1.5 Les races camelines
1.5.1 Les races camelines dans le monde
1.5.2 Les races camelines Algériennes
2.Le lait de chamelle
2.1. Production laitière
2.2. Caractéristiques du lait de chamelle
2.3. Les dérivés de lait de chamelle
3.Les bactéries lactiques
3.1. Les bactéries lactiques du lait de chamelle
3.1.1. Ecologie des bactéries lactiques
4.Les ferments lactiques
4.1. Cultures spécialisées de LAB
4.2. Cultures protectrices
4.3. Cultures de maturation
4.4. Probiotique et Santé – Promouvoir les cultures
5.Tendances futures et considérations finales
6.Méthodes d’étude des bactéries lactiques
6.1. Méthodes phénotypiques
6.2. Analyse sérologique
6.3. Méthode génotypique
7.Rappelle sur les techniques d’identification moléculaires des microorganismes
7.1. Polymorphisme de conformation des simples brins (SSCP)
7.2. Analyse des courbes de fusion à haute résolution (HRMA)
7.3. PCR répétitive extragénique palindromique (rep-PCR)
7.4. L’Amplification aléatoire d’ADN polymorphe (RAPD)
7.5. Polymorphisme de longueur des fragments de restriction (RFLP)
7.6. Polymorphisme de longueur de fragments de restriction terminaux (T-RFLP)
7.7. Polymorphisme de longueur de fragment amplifié (AFLP)
7.8. Electrophorèse en gel à gradient dénaturé (DGGE)
7.9. Électrophorèse sur gel à effet pulsé (PFGE)
7.10. Les puces d’ADN
7.11. PCR en temps réel (RT-PCR)
7.12. Le profil plasmidique
7.13. Spectrométrie de masse par temps de vol de désorption / ionisation assistée par matrice
8.Les techniques de séquençage
8.1. Séquençage par dégradation chimique (Maxam et Gilbert, 1977).
8.1.1. Principe
8.1.2. Méthode
8.1.3. Avantage/inconvénient
8.2. Séquençage par synthèse enzymatique (Sanger et al., 1977)
8.2.1. Principe
8.2.2. Méthode
8.3. Séquençage à haut débit (séquençage de deuxième génération)
Conclusion de la synthèse bibliographique
Chapitre 2 : Matériel et méthodes
1.Cadre de l’étude
2.Provenances des échantillons
3.Analyses physico-chimiques
3.1. Mesure de pH
3.2. Acidité Dornic
3.3. Détermination de la densité
3.4. Le point d’ébullition
3.5. La teneur en eau
3.6. Teneur en matière sèche (Extrait sec E.S.)
3.7. Dosage des protéines
3.8. Dosage de la matière grasse
3.9. Dosage des glucides
3.10. Dosage de la vitamine C
3.11. Teneur en oligo-éléments (minéraux)
3.12. Mesure de l’activité antioxydant
4.Analyses microbiologiques
4.1. Préparation des suspensions de dilution
4.2. Isolement des bactéries lactiques
4.3. Conservation des isolats
4.4. Identification phénotypique des bactéries lactiques
4.4.1. Caractérisation morphologique
a) Examens macroscopiques
b) Examens microscopiques
4.4.2. Caractérisation physiologique
a) Recherche de la catalase
b) Croissance à 45° C
c) Croissance à pH 9,6
d) Croissance à 6,5% de NaCl
e) Test de thermo-résistance
4.4.3. Caractérisation biochimique
a) Recherche de l’arginine déhydrolase (ADH)
b) Production des composés aromatiques
c) Production de dextrane
d) Utilisation du citrate
e) Etude de l’activité protéolytique
f) Profile fermentaire (test de fermentations des sucres)
g) Identification des isolats par galerie API 50 CHL
4.4.4. Caractérisation moléculaire des bactéries
a) Extraction de l’ADN
b) Amplification de l’ADN par PCR
c) Electrophorèse sur gel d’agarose des produits de la PCR
d) Analyse phylogénétique des bactéries
e) Séquençage
4.5. Pouvoir fermentaire des isolats
4.5.1. La cinétique d’acidification
4.5.2. La cinétique de croissance
4.6. Mise en évidence des interactions bactériennes
4.7. La cinétique de croissance en culture mixte en milieu lait
Chapitre 3 : Résultats et discussion
1.Les analyses physico-chimiques
1.1. Le pH
1.2. L’acidité dornic
1.3. La densité
1.4. Le point d’ébullition
1.5. La teneur en eau
1.6. La matière sèche
1.7. Le dosage des protéines
1.7.1. Les protéines totales
1.7.2. La caséine.
1.8. La teneur en matière grasse
1.9. La teneur en glucides
1.10. La vitamine C
1.11. Les sels minéraux
1.12. L’activité anti-oxydante
2.Isolement et identification des bactéries lactiques du lait de chamelle
2.1. Sélection des bactéries lactiques
2.2. Examen morphologique
2.3. Etude physiologique des isolats
2.4. Identification au niveau de l’espèce.
2.5. Activité protéolytique et lipolytique des isolats
3.Etude moléculaire des bactéries lactiques
3.1. Etude de la diversité par les régions ITS
3.2. Identification des isolats l’ARNr 16s
3.3. Phylogénétique des isolats
4.Cinétique de croissance en milieu lait
4.1. Cultures pures
4.2. Cultures mixtes
Conclusion générale
Références bibliographiques
Annexes