Étude des médiateurs moléculaires des interactions microbiennes de la levure Yarrowia lipolytica

Table des matières

INTRODUCTION
SYNTHESE BIBLIOGRAPHIQUE
I. LES INTERACTIONS MICROBIENNES AU SEIN D’UN ECOSYSTEME
I.A. Définition d’une interaction
I.B. Les différentes interactions microbiennes
I.B.1. Interactions trophiques ou nutritionnelles
I.B.2. Interaction par antibiose
I.B.3. Interaction par chimiotaxie et par contact physique
I.B.4. Les biofilms
I.B.5. Le « Quorum sensing »
a. Le « Quorum sensing » chez les bactéries
b. Le « Quorum sensing » chez les levures
c. Les communications bactéries-levures
I.C. Exemple d’un écosystème microbien: le fromage
I.C.1. Le fromage: un écosystème complexe
I.C.2. La fabrication du fromage
I.C.3. Les acteurs de l’écosystème fromager
I.C.3.1. Les levures
a. Genre Yarrowia
b. Genre Debaryomyces
I.C.3.2. Les bactéries
a. Genre Brevibacterium
b. Genre Arthrobacter
c. Genre Pseudomonas
I.C.4. Les différents types d’interaction: exemples des produits laitiers
a. Amensalisme
b. Compétition
c. Parasitisme
d. Commensalisme
e. Mutualisme
II. LE DIMORPHISME
II.A. Le dimorphisme chez Saccharomyces cerevisiae
II.A.1. Les facteurs responsables du dimorphisme
II.A.2. Les voies de signalisation impliquées dans le contrôle du dimorphisme
II.B. Le dimorphisme chez Candida albicans
II.B.1. Les facteurs responsables du dimorphisme
II.B.2. Les voies de signalisations qui contrôlent le dimorphisme
II.C. Le dimorphisme chez Yarrowia lipolytica
II.C.1. Les facteurs responsables du dimorphisme
II.C.2. Les voies de signalisation qui contrôlent le dimorphisme
II.C.3. Le « mating » et son rôle dans le dimorphisme
RESULTATS-DISCUSSION
I. Etude de l’interaction entre deux levures fromagères Yarrowia lipolytica et Debaryomyces hansenii sur un milieu chimiquement défini (MCD)
A. Introduction
B. Publication n°1: Adaptive response of Debaryomyces hansenii in co-culture with Yarrowia lipolytica: switch from respiratory to fermentative metabolism
C. Conclusions
II. Effet de la thiamine sur la morphologie et la croissance de la levure Yarrowia lipolytica 1E07
A. Introduction
B. Publication n°2: Transcriptomic study revealing the effect of thiamin on the morphology of Yarrowia lipolytica
C. Conclusions
III. Effet des bactéries sur la croissance et la morphologie de la levure Yarrowia lipolytica 1E07
A. Introduction
B. Confrontations de la levure Yarrowia lipolytica 1E07 avec différentes bactéries sélectionnées
C. Dosage de la thiamine
D. Etude transcriptomique de Yarrowia lipolytica 1E07
a. Conditions expérimentales pour l’étude transcriptomique
b. Résultats transcriptomiques
E. Validation des données transcriptomiques par RT qPCR
F. Conclusions
CONCLUSION