Définition d’un biofilm

Table des matières

INTRODUCTION GENERALE
I. THEORIE
I.1 Définition d’un biofilm
I.2 Structure d’un biofilm
I.2.1 La matrice extracellulaire polymérique
I.2.2 Les polysaccharides
I.2.3 Les protéines
I.2.4 Les acides nucléiques
I.3 Formation d’un biofilm
I.4 L’effet des biofilms sur le pH de leur environnement
I.5 La structure responsable de la résistance dans le biofilm
I.6 Le biofilm dans les écosystèmes naturels et leurs effets néfastes
I.7 Les techniques d’élimination des biofilms
I.7.1 Élimination de biofilms par le nettoyage mécanique
I.7.2 Élimination par les agents antibactériens
I.8 Les matériaux mésoporeux structurés
I.8.1 Les nanoparticules de silice mésoporeuses (MSNs)
I.8.2 La fonctionnalisation de la surface des MSNs
I.8.4 Le marquage des MSNs avec des fluorophores
I.8.6 Le déclanchement ciblé en fonction de la variation de pH
I.9 Dispositif microfluidique
I.10 Les avantages de dispositifs microfluidiques
I.10.1 Les faibles volumes
I.10.2 La taille de microcanaux
I.10.3 Les conditions hydrodynamiques précises
I.10.3.1 L’écoulement laminaire
I.10.3.2 Les forces de cisaillement
I.11 Fabrication des dispositifs microfluidiques
II. LES MATERIAUX ET APPAREILS UTILISES 
II.1 Les nanoparticules type MCM-48
II.2 Les fluorophores
II.3 Les souches bactériennes, conditions de culture
II.4 Le dispositif microfluidique MF (matériels et équipements)
II.5 Les accessoires microfluidique
II.6 Les matériels expérimentaux
II.6.1 Le microscope optique à lumière blanche
II.6.2 Le microscope optique à lumière fluorescente
II.6.3 Le microscope confocale à balayage laser (CLSM)
II.6.4 La Spectroscopie infrarouge de réflexion totale atténuée (ATR-FTIR)
II.7 Procédures expérimentales
II.7.1 La microfluidique
II.7.1.1 Conception géométrique du dispositif MF
II.7.1.2 Fabrication de moules par photolithographie
II.7.2 Fabrication du réacteur microfluidique
II.7.3 La culture du biofilm
II.7.4 Stratégies de fixation d’un dépôt de MSNs sur un microcanal MF
II.7.4.1 Les injections successives de suspension de NPS dans le microcanal
II.7.4.2 Dépôt par la technique « flow-deposition »
II.7.4.3 Test d’adhésion de dépôt et influence de flux hydrodynamique
II.7.5 Fixation du dépôt au milieu du microcanal MF ouvert par. Traitement par un surfactant anionique
II.7.6 Mesure des cinétiques de relargage aux différents débits par microscopie in situ
III. RESULTATS ET DISCUSSIONS
III.1 Solubilité de flourophore
III.2 Courbes de calibration
III.3 Mesure de la libération de fluorescéine dans les MSNs vide (sans fonctionnalisation)
III.4 Analyse de la libération de fluorescéine dans les MSNs vide (sans fonctionnalisation) avec des différents débits
III.5 Mesure de la libération de fluorescéinamine dans les MSNs avec fonctionnalisation avec un débit de 1 mL/h
III.5.1 Les MSNs sans fonctionnalisation
III.5.2 Les NPS MSN fonctionnalisés avec NH2dans les pores
III.5.3 Les NPS MSN fonctionnalisé avec le phosphonates
III.5.4 Comparaison de la libération de la fluorescéine entre les MSNset NPs sans pores
III.5.5 Efficacité en fonction du temps
III.6 Les mesures de la couche des nano silice obtenues avec le microscope confocale CLSM
III.7 Vérification de la séchage total de MSNs après l’adsorption de fluorophore en utilisant la Spectroscopie infrarouge de réflexion totale atténuée (ATR)
III.8 Étude de biocompatibilité de dépôt MSNs et le biofilm
IV. CONCLUSION