Analyses individuelles de lait

Table des matières

INTRODUCTION
I. MATERIELS ET METHODES 
I.1: CONTRIBUTION A L’EVALUATION DE LA PCR EN TEMPS REEL APPLIQUEE AU LAIT DE TANK
A. SELECTION DES ELEVAGES
B. REALISATION DES PRELEVEMENTS EN ELEVAGE
C. ANALYSE DES LAITS (LABORATOIRE DES PYRENEES ET DES LANDES)
1. Echantillons réalisés
2. Inclusion des laits
3. PCR en temps réel
4. Méthodes statistiques
I.2: UTILISATION DE LA PCR EN TEMPS REEL POUR LA REFORME CIBLEE
A. SELECTION DES ELEVAGES
B. EXAMENS ET PRELEVEMENTS REALISES DANS LES ELEVAGES
2. Prélèvements
3. Suivi des troupeaux au cours de la campagne 2013
4. Mesures de biosécurité
D. TECHNIQUES ANALYTIQUES
1. PCR en temps réel sur le lait
2. Trousses Elisa utilisées sur le sang
II. RESULTATS 
II.1. CONTRIBUTION A LA VALIDATION DE LA PCR EN TEMPS REEL SUR LE LAIT DE TANK
A. REPRESENTATION GRAPHIQUE DE LA VARIABILITE OBTENUE
1. Ensemble des valeurs
2. Variabilité de l’échantillon de surface « S »
3. Variabilité de l’échantillon au fond du tank « F »
C. REPETABILITE ET REPRODUCTIBILITE : ENSEMBLE DES VALEURS
1. Répétabilité et reproductibilité de premier ordre (R1)
2. Reproductibilités de deuxième et troisième ordres (R2 et R3)
D. VALEURS PAR FRACTION
II.2. UTILISATION DE LA PCR EN TEMPS REEL POUR LA REFORME CIBLEE
A. SYMPTOMATOLOGIE
B. RESULTATS DES PCR SUR LAITS DE TANK
C. RESULTATS DES PCR SUR PRELEVEMENTS INDIVIDUELS DE LAIT
1. Résultats globaux
2. Cheptel n° 1
3. Cheptel n° 2
4. Cheptel n° 3
5. Cheptel n° 4
6. Cheptel n° 5
D. RESULTATS DES SEROLOGIES
1. Trousse Elisa P48 (Idexx)
2. Trousse Elisa à antigène total (LSI)
E. COMPARAISON DES RESULTATS OBTENUS EN PCR ET EN SEROLOGIE
G. SUIVI DES TROUPEAUX SUR LA CAMPAGNE 2013-2014
III. DISCUSSION
III.1. CONTEXTE SPECIFIQUE DE L’AGALACTIE CONTAGIEUSE DANS LES PYRENEES-ATLANTIQUES
A. NECESSITE D’ASSAINIR LA SITUATION DANS LES PYRENEES-ATLANTIQUES
1. Une région touchée par l’Agalactie Contagieuse
2. Un impact économique et zootechnique important
B. INTRODUCTION DE LA PCR EN TEMPS REEL
III.2. CONTRIBUTION A L’EVALUATION DE LA PCR EN TEMPS REEL APPLIQUEE AU LAIT DE TANK
A. EN ELEVAGES, UN PROTOCOLE SIMPLE POUR UNE ETUDE PRELIMINAIRE
B. AU LABORATOIRE, UNE ETUDE COMBINEE DE LA REPETABILITE ET DE LA REPRODUCTIBILITE
C. INTEGRER LA VARIABILITE DES RESULTATS OBTENUS POUR AMELIORER LA SENSIBILITE DE LA DETECTION
III.3. UTILISATION DE LA PCR EN TEMPS REEL ET DE LA SEROLOGIE POUR LA REFORME CIBLEE
A. PERTINENCE DE L’UTILISATION DE LA PCR EN TEMPS REEL
1. Analyses de lait pour détecter les excrétrices
2. Une surveillance sur le lait de tank au cours de la campagne 2012-201
3. La surveillance sur le lait de tank au cours de la campagne 2013-2014
4. Analyses individuelles de lait
B. TESTS SEROLOGIQUES ET SEUILS
C. ELIMINATION DES BREBIS EXCRETRICES.
D. BREBIS PRESENTANT DES SIGNES DE MAMMITES CHRONIQUES
E. ELIMINATION DES BREBIS PRESENTANT UN RESULTAT DE SEROLOGIE POSITIF
F. CAUSES POSSIBLES D’ECHEC DU PROTOCOLE
1. Insuffisance de sensibilité et entretien de l’excrétion : rôle des brebis infectées chroniquement
2. Rôle des autres animaux et de la faune sauvage
3. Recontamination du cheptel
G. PERTINENCE D’UN PROTOCOLE D’ASSAINISSEMENT PAR ABATTAGE PARTIEL
CONCLUSION
BIBLIOGRAPHIE
ANNEXES