NANOTECHNOLOGIE ET NANOCELLULOSE
SECTION 2
La section 2 traite des peptides antimicrobiens puisque ces derniers permettent de fonctionaliser un support de type papier cellulosique. Dans le cadre du projet prรฉsent de maitrise, une fonction antimicrobienne qui limite la croissance bactรฉrienne ou inhibe la croissance bactรฉrienne est recherchรฉe. Une vue d’ensemble des peptides antimicrobiens est d’abord prรฉsentรฉe, en s’appuyant de quatre peptides antimicrobiens spรฉcifiques avec lesquels des expรฉrimentations furent effectuรฉes en s’appuyant sur les travaux non-publiรฉs de Michel Lรฉvesque en 2009. La nisine รฉtait le peptide antimicrobien de choix pour ce projet รฉtant donnรฉ que cette derniรจre est utilisรฉs comme peptides antimicrobien dans le dรฉveloppement des embalages spรฉciaux (Dortu et al., 2008).
Les peptides antimicrobiens
Les peptides antimicrobiens sont souvent comme les antibiotiques de l’ avenir.En effet, ce sont des peptides qui possรจdent des sรฉquences conservรฉes de l’immunitรฉ innรฉe (ARN messager), chez toutes les formes de vie, et qui ont un fort potentiel comme agent thรฉrapeutique. Ils peuvent รชtre antibactรฉriens, antiparasitaires, antiviraux et antifongiques. Le corps humain produit des peptides antimicrobiens de faรงon localisรฉe par diffรฉrent type de cellules (cellules phagocytaires, รฉpithรฉlium, tractus) et dans les sรฉcrรฉtions. Chez les plantes, les peptides antimicrobiens sont produits au niveau des graines, des racines et des feuilles, chez les insectes, la production est systรฉmique. Les recherches actuelles permettent la production de ces types de peptides par les technologies de biologie molรฉculaire. Le terme peptides antimicrobiens englobe รฉgalement les bactรฉriocines soit des peptides antimicrobiens produits par des bactรฉries pour se protรฉger (Hancock et Chapple, 1999). Les bactรฉriocines sont constituรฉes en gรฉnรฉral de 12 ร 50 acides aminรฉs. Il en existe trois types catรฉgorisรฉs selon leurs caractรฉristiques structurales et de leur composition en acides aminรฉs, incluant leur charge qui peut รชtre soit anionique, cationique ou neutre (Yeaman et Yount, 2003).
Les trois types de bactรฉriocine sont les suivantes :
1) les peptides linรฉaires formant des hรฉlices alpha;
2) les peptides riches en cystรฉine avec un ou plusieurs ponts disulfure;
3) les peptides contenant un pourcentage รฉlevรฉ d’un mรชme acides aminรฉs.
Le mode d’action des bactรฉriocines contre les pathogรจnes est principalement liรฉ ร la dรฉstabilisation des membranes ainsi qu’ร la perturbation de la cellule par une action intracellulaire. Dans le premier cas , le mรฉcanisme impliquรฉ est la formation de pores membranaires gรฉnรฉrant ainsi la fuite du matรฉriel cellulaire. Le second mรฉcanisme quant ร lui induit l’entrรฉe du peptide antimicrobien ร l’intรฉrieur de la cellule, il agit alors comme inhibiteur de la synthรจse d’ADN, d’ARN ou de protรฉines. Les peptides antimicrobiens ciblent les virus en s’attaquant aux lipoprotรฉines de l’enveloppe virale ou par adsorption sur le virus. Les peptides antimicrobiens de grandes tailles (> 1 00 acides aminรฉs) ont souvent comme cible les molรฉcules qui lient les nutriments essentiels des bactรฉries ou visent des macromolรฉcules spรฉcifiques ร certaines bactรฉries (Andrรจs et Dimarcq, 2006).
Les peptides antimicrobiens sont des dรฉterminants importants au niveau de la dรฉfense immune de l’รชtre humain. Il en existe une large variรฉtรฉ, et ils ont des capacitรฉs diffรฉrentes au niveau de leur fonction antimicrobienne. Ils jouent le rรดle d’antibiotiques endogรจnes en plus d’avoir des fonctions au delร de la rรฉponse inflammatoire et de la rรฉparation des tissus. Ils sont impliquรฉs dans la rรฉgulation de l’immunitรฉ adaptative. En effet, ร titre d’exemple, un dรฉficit de l’expression de la psoriasine (un peptide antimicrobien) au niveau de la peau peut รชtre expliquรฉ par la susceptibilitรฉ aux infections ร Staphylocoque aureus des patients atteint de psoriasis.
Sa surexpression n’est toutefois pas avantageuse. En effet, la surabondance de la psoriasine peut engendrer le psoriasis (Peck, Ong et al, 2002). Cela indique que les peptides antimicrobiens peuvent avoir. des effets secondaires indรฉsirables sur la peau, mรชme s’ils sont dรฉjร endogรจnes chez l’รชtre humain. Cela doit รชtre pris en considรฉration quant ร l’utilisation potentielle de ces molรฉcules sur la peau lors du dรฉveloppement de produits comme des pansements ou des semelles qui utilisent ce type de molรฉcules en contact avec la peau (Drider et Rebuffat, 2012). Les sous-sections suivantes prรฉsentes certains peptides antimicrobiens d’intรฉrรชt pour le prรฉsent projet et qui sont suffisamment documentรฉs dans la littรฉrature.
Gramicidine D
La gramicidine est un groupe de peptides antibiotiques linรฉaires (sauf la gamicidine S qui est cyclique) qui est produit par plusieurs souches de Bacil/us brevis.
L’ensemble de ces peptides forme la gramicidine D. La gramicidine est dรฉjร utilisรฉe sur le marchรฉ en conjugaison avec d’autres molรฉcules. Par exemple, la gamicidine D jumelรฉe ร la polymixine A et la nรฉomycine constituent les ingrรฉdients bioactifs du Polysporin, crรจme ou onguent antibactรฉrien en vente libre au Canada. pour le traitement topique des infections cutanรฉes ou ophtalmologiques (Medlineplus, 2013).
Ce type d’utilisation indique que la gramicidine pourrait avoir du potentiel dans le cadre des expรฉrimentations du prรฉsent projet. La gramicidine est efficace envers un large spectre de microorganismes cocci GRAM+, GRAM- et champignons.
Cependant, elle est toxique pour les รฉrythrocytes humains (Jakubke et Sewald, 2008). Son mode d’action s’explique par l’ accroissement de la permรฉabilitรฉ membranaire de la bactรฉrie occasionnant la pรฉnรฉtration d’ions monovalents cationiques. ร titre d’exemple, les protons peuvent dรฉsรฉquilibrer le gradient ionique entre le cytoplasme et l’environnement extรฉrieur lorsque le peptide antirnicrobien forme un pore et provoque un flux d’ions aqueux. Ce pore sรฉlectif et semi-permรฉable possรจde des sites qui lient des cations particuliers (Hladky et Haydon, 1972).
Lactoferricin
La lactoferricine est un peptide antirnicrobien ร caractรจre amphyphile et fortement cationique. Elle provient du tractus gastro-intestinal. Cette derniรจre est une glycoprotรฉine qui lie les ions ferriques dans le lait chez les bovins. (Hwang Zhou, Shan et al.,1998). La lactoferricine a plusieurs fonctions immunologiques dont antimicrobienne, antivirale et antitumorale. La lactoferricine bovine (LfcinB) et lactoferrinine humaine (LfcinH) ne sont pas identiques et leurs diffรฉrences majeures se situent au niveau de la grosseur du peptide et en sa sรฉquence d’acides aminรฉs (Jakubke et Sewald, 2008). La molรฉcule le LfcinB est dรฉpourvue des rรฉsidus d’histidines et de tyrosines ce qui le confรจre plus la possibilitรฉ de lier le fer. La LfcinB est plus antirnicrobienne que la LfcinH. Elle est aussi plus abordable ce qui en fait un candidat de choix dans le prรฉsent projet. LfcinB est actif contre un large spectre de microorganismes GRAM- et รฉgalement de bactรฉries GRAM + puisque le tractus gastro-intestinal contient majoritairement des bactรฉries GRAM+ opportunistes. La LfcinB a รฉgalement des capacitรฉs antivirales (VIH-l) et antiparasitaires (Giardia larndia) Son mode d’action rรฉsulte de son pouvoir liant envers les lipopolysaccharides des membranes qui sont libรฉrรฉs. (Hladky et Haydon, 1972). Il s’agit d’une action qui est lente et qui dรฉtruit l’intรฉgritรฉ de la membrane, amenant la lyse de la cellule bactรฉrienne. La lactoferricine est plus active dans un pH lรฉgรจrement alcalin.
Pseudomonas jluorescens, Enteroococus faecalis, Bifidobacterium bifidum sont trรจs rรฉsistants ร ce peptide (Belamy, Takase et al., 1992).
รtant donnรฉ que la lactoferricine bovine est un dรฉrivรฉ de la lactoferrine qui est une protรฉine allergisante prรฉsente dans le petit-lait (Host, Hu, Gjesing et al., 1992), l’utilisation de ce peptide antimicrobien pourrait รฉgalement provoquer รฉgalement des allergies cutanรฉs. Son utilisation sur un pansement bioactif pourrait donc comporter certains risques.
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Table des matiรจres
REMERCIEMENTS
RรSUMร
TABLE DES MATIรRES
LISTE DES T ABLEAUX
LISTE DES รQUATIONS
LISTE DES FIGURES
LISTE DES ABRรVIATIONS, SIGLES ET ACRONYMES
INTRODUCTION
CHAPITRE 1 : CADRE THรORIQUE
SECTION 1 : NANOTECHNOLOGIE ET NANOCELLULOSE
1.1 Les Nanotechnologies
1.2 La nanotechnologie et la santรฉ humaine
] .3 Biocompatibilitรฉ de la nanocellulose
1.4 Les papiers bioactifs
1.5.1 La nanocellulose oxydรฉe (NCO)
1.6 Possibilitรฉ d’association
SECTION 2ย
2.1 Les peptides antimicrobiens
2.1.1 Grarnicidine D
2.1.2 Lactoferricin
2.1.3 Magainine
2.1.4 Nisine
2.2 Peptides antimicrobiens et la rรฉsistance
SECTION 3
3.1 Flore commensale humaine
3.2 Staphylococcus sp
3.3 Diphtรฉroรฏdes
3.3.1 Corynebacterium minutissimum
3.4 Autres bactรฉries
SECTION 4
4.1 Les plaies
4.2 Propriรฉtรฉs recherchรฉes
4.3 Les pansements
4.3.1 Les hydrocolloรฏdes
4.3.2 Les hydrocellulaires
4.3.3 Les hydrogels
4.3 .4 Les alginates et chitosan
4.3.5 Les interfaces et les films
4.3.6 Les pansements au charbon
4.3.7 Pansements ร l’argent
4.4 La nanocellulose : un bon candidat?
SECTION 5
5.1 Spectroscopie de photoรฉlectron X (XPS)
5.2 Acide bicinchoninique
5.3 Le Luminotoxโข
5.3.1 Rรฉactifs (SAPS)
CHAPITRE IIย
BUTS, HYPOTHรSES ET OBJECTIFS
CHAPITRE III
MATรRIEL ET MรTHODE
3.1 Prรฉparation des รฉchantillons pour les expรฉrimentations
3.1.1 Support cellulosique: solution et films de nanocellulose oxydรฉe
3.1.2 Prรฉparation des รฉchantillons de carton fourni par Cascades inc
3.1.3 Prรฉparation รฉchantillon pour la spectroscopie
3.1.4 Prรฉparation รฉchantillon pour le Luminotox
3.1.5 Milieux de culture
3.2 Sรฉlections de l’ efficacitรฉ des peptides antimicrobiens
3.3 รvaluation de l’utilisation de la NCO et de la cellulose comme source de carbone pour les microorganismes auxanogramme du carbone
3.4 Utilisation de la nanocellulose comme source de nutriment pour les microorganismes par milieu de culture ร la nanocellulose
3.5 Mรฉthode de fonctionnalisation
3.5.1 Couplage du peptide antimicrobien sur film de NCO
3.5.2 Test de couplage entre la NCO aqueuse et nisine
3.6 Quantification de la fonctionnalisation
3.6.1 Spectroscopie ร photoรฉlectron X
3.6.2 Dรฉtection des protรฉines avec la trousse ร l’acide Bicinchininique
3.7 Impact de paramรจtres sur l’efficacitรฉ de la nisine
3.7.1 Impact de la tempรฉrature
3.7.2 Impact du pH
CHAPITRE III
RรSUL T ATS ET ANAL YSES
4.1 Fabrication d’un film de nanocellulose oxydรฉ
4.1.1 Sรฉlection du matรฉriau pour la fabrication des films
4.1.2 Sรฉlection de la membrane filtrante
4.1.3 Impact de la filtration sur le film de NCO
4.2 Effet des ptides antimicrobiens sur la croissance des souches bactรฉriennes
4.2.1 Application de la mรฉthode Kirby-Bauer par diffusion sur disque
4.2.2 Application de la mรฉthode Kirby-Bauer par dรฉpรดt direct
4.3.3 Application de la mรฉthode par dillution en sรฉrie pour la dรฉtermination de la CMI
4.3.4 Sรฉlection du peptide antimicrobien
4.4 รvaluation de l’utilisation de la NCO et de la cellulose comme source de carbone pour les microorganismes par auxanogramme du carbone
4.5 Utilisation de la nanocellulose comme source de nutriment pour les microorganismes par milieu de culture ร la nanocellulose
4.6 Couplage du peptide antimicrobien sur film de NCO et essais antimicrobiens
4.7 Test de couplage entre la NCO aqueuse et nisine
4.7.1 Effet du couplage NCO + nisine au XPS
4.8 Analyse des protรฉines solubles dans la NCO par la mรฉthode ร l’acide bicinchoninique
4.9 Luminotox
4.9.1 รvaluation du SAPS pour le LuminoTox
4.9.2 Ajustement des cellules du SAPS et รฉchantillon de NCO
4.9.3 Mesure de l’efficacitรฉ photochimique avec Anabaenaflos aquae
4.1 0 Effet du carton mince de Cascade jumelรฉ avec la ni sine
4.11 รvaluation de l’impact de la tempรฉrature sur la nisine avec le carton de Cascades
4.12 รvaluation de l’impact du pH sur la nisine avec le carton de Cascades
CONCLUSION
RรFรRENCESย
ANNEXE A
ANNEXE B
ANNEXE C
ANNEXE D
ANNEXE E
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