LES PESTIVIRUS CHEZ LES RUMINANTS DOMESTIQUES ET SAUVAGES
TAXONOMIE ET TERMINOLOGIEย
Les progrรจs effectuรฉs au cours des annรฉes 80 dans lโorganisat ion gรฉnomique, la rรฉplicat ion in vitro et la comprรฉhension de la pathogรฉnie des maladies, ont permis de classer le genre Pestivirus dans la famille des Flaviviridae aux cรดtรฉs des genres Flavivirus (virus de la fiรจvre jaune, virus du Nil occidental, virus de la Dengue) et Hepacivirus (virus de lโhรฉpat ite C) (Moennig, 1994). Le nom du genr e Pestivirus provient de ยซ pestis suum ยป, agent de la Peste Porcine Classique (ou CSFV : Classical Swine Fever Virus). Les pest ivirus ont longtemps รฉtรฉ classรฉs en trois groupes de virus fortement apparentรฉs : le CSFV, le virus de la Border Disease (Border Disease Virus ou BDV) et le virus de la Diarrhรฉe Virale Bovine (Bovine Viral Diarrhea Virus ou BVDV). Le nom dโespรจce fait rรฉfรฉrence ร la maladie du premier isolement (Moennig, 1990). I l est ร prรฉsent connu que des infect ions croisรฉes entre espรจces animales existent et les virus sont dรฉsormais regroupรฉs ร part ir du sรฉquenรงage dโune part ie de leur gรฉnome. Les pest ivirus ont entre eux des relat ions ant igรฉniques croisรฉes รฉt roites. Ce sont des virus ยซ vรฉtรฉrinaires ยป dans la mesure oรน ils nโinfectent pas lโHomme.
Tropisme cellulaire
Le tropisme cellulaire semble รชtre dรฉterminรฉ par une ou plusieurs port ions de la glycoprotรฉine E2 (Liang et al. , 2003). Les pest ivirus ont tropisme marquรฉ pour les cellules du systรจme rรฉt iculoendothรฉlial et pour les รฉpithรฉliums. I ls se lient int imement au rรฉt iculum endoplasmique des cellules hรดtes ce qui, en plus de leur pet ite taille, a longtemps rendu leur purificat ion difficile. On les retrouve prรฉfรฉrent iellement dans la peau, lโรฉpithรฉlium digest if, les poumons, lโencรฉphale, la fract ion leucocytaire sanguine ( lymphocytes, monocytes) et donc dans la plupart des t issus notamment la rate et le foie. Le t ropisme cellulaire semble diffรฉrer selon la souche de pest ivirus Certaines seraient plus entรฉropathogรจnes, dโautres plus tรฉratogรจnes, abort igรจnes etc.โฆ A lโรฉchelle de lโespรจce virale, les virus BD semblent trรจs frรฉquemment tรฉratogรจnes. Le tropisme cellulaire explique directement une bonne part ie de lโexpression clinique. Par exemple, le rรดle entรฉropathogรจne direct liรฉ ร la mult iplicat ion dans les glandes de Lieberkรผhn, bloque le renouvellement de lโรฉpithรฉlium villositaire, et conduit ร des troubles diarrhรฉiques. Par ailleurs lโact ion du virus sur les cellules du systรจme immunitaire (cellules dendr it iques, lymphocytesโฆ) est ร lโorigine dโune immunodรฉpression qui favorise les surinfect ions.
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PARTIE 1 : LES PESTIVIRUS CHEZ LES RUMINANTS DOMESTIQUES ET SAUVAGES
I. TAXONOMIE ET TERMINOLOGIE
II. HISTORIQUE
III. STRUCTURE ย
III.1. Structure et protรฉines structurales
III.2. Protรฉines non structurales
III.3. Organisation gรฉnomique
IV. PHENOTYPES
IV.1. Biotypes
IV.2. Caractรฉristiques antigรฉniques et immunogรฉniques
IV.3. Pathotypes et pouvoir pathogรจne
V. PROPRIETES BIOLOGIQUES ย
V.1. Spรฉcificitรฉ dโhรดte
V.2. Tropisme cellulaire
V.3. Pathogenรจse
VI. ELEMENTS CLINIQUES ET LESIONNELS DES PESTIVIROSES CHEZ LES RUMINANTS ย
VI.1. Le modรจle BVD/MD chez les bovins
VI.1.1. Les infections transitoires
VI.1.2. Les infections permanentes
VI.2. La Border Disease chez les ovins et caprins
VI.3. Les pestiviroses chez les ruminants sauvages
VII. EPIDEMIOLOGIE DES PESTIVIROSES
VII.1. Epidรฉmiologie descriptive
VII.1.1. Espรจces cibles
VII.1.2. Rรฉpartition dans le temps et dans lโespace
VII.2. Epidรฉmiologie analytique
VII.2.1. Propriรฉtรฉs physicochimiques des pestivirus
VII.2.2. Sources et matiรจres virulentes
VII.2.3. Modes de transmission
PARTIE 2 : ISARDS : BIOLOGIE ET SUIVIS DES POPULATIONS
I. LโISARD
I.1. Rappel de taxonomie (Linnรฉ 1758)
I.2. Principales caractรฉristiques biologiques et รฉthologiques
I.2.1. Caractรจres morphologiques et anatomiques
I.2.2. Biologie de lโisard
I.2.3. Principales donnรฉes รฉthologiques
I.3. La pathologie de lโisard
I.4. Lโisard et lโHomme
II. LE SUIVI DES POPULATIONS
II.1. Historique et mรฉthodologie des comptages de la population dโisards
II.1.1. Historique des comptages
II.1.2. Mรฉthodologie des comptages
II.1.3. Organisation des comptages en Ariรจge
II.1.4. Dรฉcoupage du massif ariรฉgeois en unitรฉs de gestion
II.2. Plans de chasse
PARTIE 3 : SELECTION DES ANIMAUX OBJETS DE LโETUDE ย
I. LA SITUATION INITIALE ย
II. LE RECRUTEMENT DES ISARDS MALADES OU MORTS ย
II.1. La prise en charge sur le terrain
II.2. Rรฉception des isards, examen initial, prรฉlรจvements
III. TECHNIQUES ET ANALYSES DE LABORATOIRE ย
III.1. Hรฉmatologie et biochimie
III.2. Parasitologie
III.3. Histopathologie
III.4. Sรฉrologies
III.4.1. Pestivirose
III.4.2. Paratuberculose
III.4.3. Chlamydiose
III.4.4. Fiรจvre Q
III.4.5. Toxoplasmose
III.5. Bactรฉriologie
III.6. Virologie
III.6.1. Antigรฉnรจmie pestivirus NS3 (p80
III.6.2. Isolement de pestivirus
III.6.3. Amplification gรฉnique ou RT-PCR (Reverse Transcriptase Polymerase Chain Reaction)
III.6.4. Analyse phylogรฉnรฉtique du pestivirus
PARTIE 4 : RESULTATS EPIDEMIOLOGIQUES, CLINIQUES ET DE LABORATOIRE ย
I. ASPECTS EPIDEMIOLOGIQUES ย –
I.1. Evolution dรฉmographique rรฉcente des populations sur le versant franรงais
I.1.1. Evolution ร lโรฉchelle du massif pyrรฉnรฉen
I.1.2. Evolution en Ariรจge
.I.2. Genรจse de lโhypothรจse de pestivirose en Ariรจge
II. EXAMENS CLINIQUES ET NECROPSIQUES ย
II.1. Origine gรฉographique et conditions de capture
II.2. Caractรฉristiques des animaux
II.2.1. Age
II.2.2. Sexe
II.2.3. Poids
II.2.4. Comportement
II.3. Examen clinique des isards malades
II.3.1. Examen ร distance
II.3.2. Examen rapprochรฉ
II.3.2.a. Tempรฉrature rectale
II.3.2.b. Examen des muqueuses, hydratation
II.3.2.c. Maigreur et amyotrophie systรฉmatiques
II.3.2.d. Des lรฉsions cutanรฉes constantes
II.3.2.e. Absence de signes digestifs
II.3.2.f. De rares et discrets signes respiratoires
II.3.2.g. Des lรฉsions anciennes de kรฉratoconjonctivite infectieuse
II.4. Examen nรฉcropsique
II.4.1. Etat de conservation
II.4.2. Lรฉsions externes
II.4.3. Lรฉsions internes
II.4.3.a. Etat dโengraissement
II.4.3.b. Appareil digestif
II.4.3.c. Appareil cardiorespiratoire
II.4.3.d. Observations diverses
III. EXAMENS COMPLEMENTAIRES ย
III.1. Hรฉmatologie
III.2. Biochimie
III.3. Parasitologie
III.4. Histopathologie
III.5. Sรฉrologies
III.6. Bactรฉriologie
III.7. Virologie
PARTIE 5 : DISCUSSION
I. ASPECTS INDIVIDUELS ย
I.1. Une nouvelle maladie de lโisard ?
I.1.1. Troubles cliniques et lรฉsions
I.1.2. Exclusion de diffรฉrentes maladies de lโisard
I.1.2.a. Le parasitisme
I.1.2.b. Les causes environnementales
I.1.2.c. Les causes infectieuses
I.1.2.d. Les causes dโamaigrissement et de dรฉnutrition
I.1.3. La mise en รฉvidence de pestivirus
I.2. Imputabilitรฉ des troubles cliniques au pestivirus
I.2.1. Reproduction expรฉrimentale
I.2.2. Arguments physiopathologiques
I.2.2.a. Infection permanente vs transitoire
I.2.2.b. Mรฉcanismes des lรฉsions, symptรดmes, modifications biologiques
II. ASPECTS EPIDEMIOLOGIQUES
II.1. Sรฉroprรฉvalence des pestivirus dans la faune sauvage et chez lโisard
II.2. Imputabilitรฉ des rรฉductions dโeffectif au pestivirus
III. LE PESTIVIRUS DE LโISARD
III.1. La position phylogรฉnรฉtique du pestivirus de lโisard
III.2. Propriรฉtรฉs des pestivirus ยซ isard
CONCLUSION ย
BIBLIOGRAPHIEย
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