Les infections nosocomiales

Les infections nosocomiales

Contamination de l’air

L’air joue un rôle important dans les mécanismes d’échanges des particules d’une zone à l’autre, et donc des germes pouvant s’y trouver. L’air contient des micro-organismes en densité extrêmement variable. En effet, ces germes proviennent de différentes sources : flore endogène du personnel et des patients(flore cutanée, flore nasale ou buccale), du sol, ainsi que de la poussière(Comite Technique National des Infections Nosocomiales, 2002).Ces microorganismes sont composés de bactéries à Gram positif telles que les Bacillus sp, les Staphylococcus, et les Actinomycètes, de bactéries à Gram négatif telles que les entérobactéries ou les Pseudomonas, d’espèces apparentées comme Legionnella, les mycobactéries atypiques, les champignons microscopiques, et les virus tels que les entérovirus ou le virus de l’hépatite A(BERRADA S.et al, 2017).

Contamination de la surface

A l’hôpital, les surfaces susceptibles d’entrer en contact avec le patient soit directement, soit indirectement par l’intermédiaire de dispositifs médicaux ou des mains de personnes, peuvent constituer des réservoirs microbiens(IDRISSI OUADRHI A.,2011 ; BERRADA S.et al, 2017).Les bactéries présentes sur les surfaces de l’environnement hospitalier peuvent également provenir des particules en suspension dans l’air. Par ailleurs, les bactéries peuvent être apportées par l’Homme du fait qu’il émet en permanence des particules (squames de la peau, cheveux, poil…). Ces dernières peuvent servir de véhicule de microorganismes en les sédimentant sur les surfaces. Après contact avec la surface, les bactéries vont adhérer à celle-ci ce qui rend leur élimination plus difficile et pourrait générer la formation d’un biofilm(LEMARIE C.et al, 2013).Ces surfaces constitueraient donc une niche écologique de bactériesmulti-résistantes qui peuvent être un réservoir à partir duquel des infections nosocomiales peuvent se développer(MEITE S.et al, 2010).

Résistance Bactérienne aux Antibiotiques

Les Résistance s’étendent qualitativement mais aussi qualitativement, depuis plus de 20 ans, de nombreux déterminants de résistance ont été décrits avec l’émergence de bactéries de plus en plus résistantes. L’impact de cette multi- résistance aux antibiotiques est essentiel au niveau clinique en termes de mortalité et de morbidité mais aussi sur le plan économique, car les infections liées aux bactéries multi-résistantes engendrent des couts d’hospitalisation élevés. L’extension géographique des résistances se produit au niveau international mais aussi dans le milieu de vie. Les infections causées par les bactéries résistantes et multi-résistantes, autrefois cantonnées au milieu hospitalier, deviennent communautaires, ainsi le nombre de personnes susceptibles d’être exposées à ce type de bactéries est continuellement démultiplié (BERRADA S.,2016).

Profil d’antibio-résistance des souches vis-à-vis des antibiotiques

L’évaluation de l’activité antibactérienne a été réalisée sur 8 isolats bactériens qui comprend : Staphylococcus aureus, Staphylococcus à coagulase négative, Pseudomonas sp, Acinetobacter sp, Streptocoque sp et les Entérobactéries. Ces dernières sont représentées par Hafnia alvei, Yersinia enterolitica, et Serratia marcescens. Le tableau suivant montre le profil de résistance et de sensibilité des isolats vis-à-vis des antibiotiques.

Comme le montre le tableau 2, nous avons constaté que la résistance et la sensibilité bactériennes varie d’une part en fonction de la famille de antibiotiques testés et d’autre en fonction du genre bactérien. Ainsi, la souche de Streptocoque sp, a révélé une résistance élevée à la famille de Bêta-lactamines(Ampicilline et Pénicilline), ainsi qu’à la Tobramycine (TOB) et à l’Erythromycine (E). Les quinolones et les Glycopeptides gardent une bonne activité sur ce germe, avec une sensibilité pour la Ciprofloxacine (CIP) et la Vancomycine (VA). Nous avons également noté une résistance totale de la souche Staphylococcus aureus vis à vis de la Pénicilline(P), de l’Oxacilline (OX), de la Tobramycine (TOB), de la Vancomycine (VA), du Cefotaxime CTX), de l’Acide Fusidique(FD), de la Lincomycine (MY) et de la Ciprofloxacine (CIP). Sauf l’Erythromycine(E) qui a montré une efficacité sur cette bactérie. La souche de Staphylococcus à coagulase négative est très sensible à la plupart des antibiotiques tels que l’acide Fusidique (FD), la Ciprofloxacine (CIP),l’Imipenème (IMP) et à l’Erythromycine (E). Cependant, elle a montré une résistance à la famille de Béta lactamines (AMC et P), à la Tobramycine (TOB), au Cefotaxime (CTX), et au Lincomycine (MY). Nous avons remarqué que la souche d’Acinetobacter sp, était insensible à la plupart des antibiotiques comme (SXT, AMP, CTX, IMP). Elle a aussi présenté une résistance intermédiaire pour l’Amikacine (AK).

Concernant la souche Pseudomonas sp, elle a révélé une résistance à l’Ampicilline (AMP)au Sulfaméthoxazole+Triméthoprime(SXT) et au Cefotaxime (CTX). Cependant, cette souche reste sensible à l’Imipénème (IMP),à la Ciprofloxacine (CIP) et à l’Amikacine(AK). Nous avons noté que les Entérobactéries présentent une résistance élevée vis-à-vis de la famille de Céphalosporines y compris (CTX, CFM, FOX), ainsi que pour la Colistine (CT) et l’Ampicilline (AMP). Cependant, une sensibilité globale face au Lévofloxacine (LEV) et à la Kanamycine (K) est notée. La résistance globale des souches testées était élevée vis-à-vis de la famille de Beta-lactamines y compris (P, AMP, AMC, OX), les Céphalosporines y compris (FOX, CTX, CFM), les Lincosamides et les Sulfamides. Les quinolones et les glycopeptides gardent une bonne activité sur les souches testées.

Discussion

La part des infections nosocomiales liées à une contamination d’origine environnementale est difficile à apprécier et l’importance du contrôle microbiologique demeure controversée. Toutefois, les recommandations internationales reconnaissent aujourd’hui les intérêts multiples de la surveillance microbiologique de l’environnement dans la prévention des infections nosocomiales, à savoir : la prise en considération de la contamination des surfaces et la recherche des réservoirs microbiens à l’origine des cas groupés d’infections ou d’épidémies (BERRADA S.et al, 2017). Dans ce cadre et suite aux contrôles de l’environnement d’un service hospitalier, nous avons réalisé ce travail afin d’identifier les germes isolés et d’évaluer leur activité antibactérienne vis-à-vis des antibiotiques. L’identification a porté sur 44souches bactériennes dont 28 ont été retrouvées au niveau des surfaces et 16 au niveau de l’air. Leur répartition par coloration de Gram a montré une prédominance des Bactéries Gram positif (70,46%) par rapport aux Bactéries Gram négatif (29,54%). Ce résultat est en accord avec des études antérieures (SAOUIDE EL AYNE N et al, 2014 ;BERRADA S.et al, 2017), mais diffère du profil bactériologique signalé à Abidjan par MEITE S.et al, (2010).

La répartition des Bactéries selon la forme et la coloration de Gram a révélé la prédominance des cocci à Gram positif par rapport aux bacilles à Gram négatif, ces résultats se rapprochent à ceux enregistrés par d’autres auteurs (EL RHAZI K.et al, 2007 ; REBAIAHI S-A.et al, 2014). La prédominance des BGP par rapport aux BGN pourrait être expliquée par la capacité de ces germes à résister aux des conditions hostiles comme la dessiccation. L’environnement hospitalier constitue en effet un réservoir pour les bactéries à Gram positif, très largement dispersées par l’activité humaine (BERRADA S, 2016). L’identification biochimique des Bactéries isolées a révélé la prédominance des Staphylococcus à coagulase négative avec un pourcentage de (31,81%), ces résultats se rapprochent à celui obtenus par (EL KHADER M, 2011). La mise en évidence d’un pourcentage élevé des bactéries issues de la flore cutanée reflète une activité humaine intense dans les locaux des services hospitaliers. Parmi les bactéries retrouvées au niveau de l’air, les cocci à Gram positif sont les plus fréquemment rencontrées, avec une représentativité importante pour les S.non aureus, soit une fréquence de 56%. Ce résultat ne concorde pas à celui trouvé par MARCILA et al (2012) Ces auteurs n’ont pas trouvé ce genre de bactéries

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Table des matières

Dédicace
Remerciements
Liste des Abréviations
Illustration des tableaux et figures
Glossaire
Résumé
Présentation du lieu de stage : LRDEHM Fès
Introduction Générale
Partie I : Synthèse bibliographique
I.Généralités sur les infections nosocomiales
I-1 : Définition
I-2 : Origine et modes d’acquisition des infections nosocomiales
I-3 : Facteurs favorisants la survenue d’infections nosocomiales
II.Environnement hospitalier : Air et Surface
II-1 : Contamination de l’air
II-2 : Contamination de la surface
II-3 : Survie des agents infectieux dans l’environnement
II-4: Microorganismes contaminants l’air et les surfaces en milieu hospitalier
II-5 : Relation entre la contamination environnementale et l’infection nosocomiale
II-6 : Mesure de la contamination de l’air et de la surface
III. Prévention des infections nosocomiales
III.Résistance Bactérienne aux antibiotiques
Partie II.Matériel et méthodes
1.Type, lieu et période d’étude
2.Matériels
2.1.Matériel biologique
2.2. Matériel, équipements et consommables
3.Méthode
3.1. Identification des souches
3.2. Evaluation de l’activité antibactérienne des antibiotiques sur des souches isolées
Partie III. Résultats
Identification des souches
1- Répartition des bactéries en fonction de la coloration de Gram
2- Répartition des Bactéries en fonction de la coloration de Gram et la forme
3- Identification biochimique des bactéries isolées
4- Répartition des bactéries isolées en fonction de la nature du point de prélèvement
4-1- Bactéries isolées de l’air
4-2-Bactéries isolées des surfaces
Profil d’antibio-résistance des souches vis-à-vis des antibiotiques
Discussion
Conclusion, recommandations et perspective
Annexes
Références bibliographiques

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