Les bougainvilliers: des plantes exotiques
Caractรฉrisation phรฉnotypique et gรฉnรฉtique de la collection
Caractรฉrisation morphologique
Sรฉlection des caractรจres morphologiques en trois รฉtapes
De nombreuses clรฉs de dรฉtermination des diffรฉrentes espรจces et de leurs hybrides ainsi que des descripteurs formels des bougainvilliers ont รฉtรฉ proposรฉs successivement (Pancho et Bardenas, 1959 ; Swarup et Singh, 1964 ; Pal et Swarup, 1974 ; Zadoo et al., 1974 ; Gillis, 1976 ; MacDaniels, 1981 ; Iridel, 1995 ; Leonardi et Romano, 2003 ; Srivastava et al., 2009 ; Mohammed, 2007).
Dans cette รฉtude, afin de rรฉaliser une caractรฉrisation morphologique complรจte des individus, une liste de descripteurs a tout dโabord รฉtรฉ รฉtablie ร partir de 9 ouvrages (Swarup et Singh, 1964 ; Zadoo et al., 1974 ; Pal et Swarup, 1974 ; Iridel, 1995; Leonardi et Romano, 2003 ; Srivastava et al., 2009 ; UPOV, 2011; entreprise du Cannebeth, 2012 ; Zu et al., 2009) et de lโobservation des individus de la collection. Ensuite, seuls les descripteurs qui pouvaient รชtre dรฉterminรฉs ร lโaide du matรฉriel disponible dans lโentreprise (rรจgle, mรจtre, pied ร coulisse et loupe binoculaire) et de maniรจre assez objective ont รฉtรฉ sรฉlectionnรฉs. Enfin, ces derniers descripteurs sรฉlectionnรฉs ont รฉtรฉ testรฉs sur une vingtaine de cultivars, choisis au hasard, afin dโรฉliminer ceux qui รฉtaient non discriminants (ex : couleur des branches).
Caractรจres morphologiques quantitatifs et qualitatifsย ย sรฉlectionnรฉs
Au final, 19 caractรจres quantitatifs (Tableau 2) et 48 caractรจres qualitatifs (Tableau 3 et Tableau 4), dรฉcrivant les parties vรฉgรฉtatives (plante, branche, รฉpine, pรฉtiole et feuille) et florales (cyme, pรฉdoncule, pรฉdicelle, bractรฉe et fleur), ont รฉtรฉ sรฉlectionnรฉs. Parmi les 19 caractรจres quantitatifs, 4 caractรจres sont des descripteurs indirects et correspondent ร des rapports entre la longueur et la largeur maximale (LM) de diffรฉrentes parties de la plante.
Afin de faciliter le phรฉnotypage actuel ou ultรฉrieur des cultivars de bougainvilliers, un guide dรฉfinissant et illustrant lโensemble des caractรจres qualitatifs et certains caractรจres quantitatifs ainsi que des fiches types de notation ont รฉtรฉ rรฉalisรฉes (Tableau 5). Lโensemble des donnรฉes a รฉtรฉ stockรฉ dans une base de donnรฉe crรฉe ร lโaide du logiciel Microsoft Access 2007.
Mรฉthodes et outils de descriptions et de mesures
Pour les individus appartenant depuis plus dโun an ร la collection, un individu par cultivar a รฉtรฉ phรฉnotypรฉ. Les individus provenant de lโรฎle Maurice et de Porto Rico รฉtant trop petits et donc prรฉsentant peu de matรฉriel, les parties de plante phรฉnotypรฉes proviennent de plusieurs individus du mรชme cultivar.Ce phรฉnotypage a รฉtรฉ rรฉalisรฉ selon deux grandes รฉtapes : le phรฉnotypage des parties vรฉgรฉtatives, rรฉalisรฉ entre les mois dโAvril et de Juin, et le phรฉnotypage floral rรฉalisรฉ entre les mois de Juin et de Juillet.Pour les parties vรฉgรฉtatives, lโensemble des mesures et des descriptions a รฉtรฉ rรฉalisรฉ, lorsque cela รฉtait possible, sur les dix premiers entre-nลuds, feuilles et รฉpines situรฉes ร la base dโune branche de chaque cultivar. La largeur des รฉpines ainsi que la longueur des entre-nลuds ont รฉtรฉ mesurรฉes ร lโaide dโun pied ร coulisse ร lecture digitale (OTMT, 150 mm) permettant une prรฉcision de 0.03 mm et facilitant les mesures sur ces organes ou parties de plantes. Les autres caractรจres quantitatifs ont รฉtรฉ mesurรฉs ร lโaide dโune rรจgle de 30 cm. Les couleurs des feuilles et des pรฉtioles ont รฉtรฉ attribuรฉes en utilisant le descripteur couleur de lโUPOV.
Pour les parties florales, une dizaine de cymes de chaque cultivar a รฉtรฉ phรฉnotypรฉe. Sur ces cymes (pour les cultivars ร inflorescence simple), 30 inflorescences ร quatre stades de dรฉveloppement diffรฉrents (Figure 12) ont รฉtรฉ prรฉlevรฉes au hasard afin de caractรฉriser la couleur des bractรฉes de chaque cultivar. Les autres mesures et descriptions des bractรฉes, pรฉdicelles et fleurs ont รฉtรฉ rรฉalisรฉes sur 10 bractรฉes et fleurs au troisiรจme stade de dรฉveloppement (Figure 12). Dans cette deuxiรจme partie du phรฉnotypage, lโensemble des caractรจres morphologiques quantitatifs a รฉtรฉ mesurรฉ ร lโaide dโune rรจgle de 30 cm, les couleurs des bractรฉes ont รฉtรฉ attribuรฉes en utilisant la 6รจme รฉdition de la charte de couleurs de la ยซ Royal Horticulture Society ยป รฉditรฉe en 2007 (comprenant 896 couleurs) et les couleurs des diffรฉrentes parties des fleurs ont รฉtรฉ attribuรฉes en utilisant le descripteur couleur utilisรฉ par Iridel (1995).
Analyse des donnรฉes morphologiques Identification des cultivars
Une fois les donnรฉes morphologiques acquises, la premiรจre รฉtape a consistรฉ ร vรฉrifier lโidentitรฉ des cultivars dont le nom est rรฉfรฉrencรฉ et ร tenter dโattribuer lโidentitรฉ correcte aux cultivars dont le nom nโest pas rรฉfรฉrencรฉ. Pour cela, les donnรฉes morphologiques phรฉnotypรฉes des cultivars de la collection ont รฉtรฉ comparรฉes ร celles prรฉsentes dans les ouvrages de rรฉfรฉrence (Iridel, 1995 ; Pal et Swarup, 1974 ; MacDaniels, 1981) ainsi quโaux donnรฉes prรฉsentes dans les dossiers de PlantPatent et COV.Variabilitรฉ et association des caractรจres quantitatifs. La variabilitรฉ des caractรจres quantitatifs au sein de chaque cultivar et entre les cultivars a รฉtรฉ dรฉterminรฉe en calculant le coefficient de variation (CV%) de chaque caractรจre. Les valeurs moyennes obtenues pour les 19 caractรจres de chaque cultivar ont รฉtรฉ utilisรฉes pour calculer le CV de chaque caractรจre entre les cultivars. Ces statistiques descriptives ont รฉtรฉ calculรฉes ร lโaide de Microsoft Office Excel 2007. Afin dโexplorer les associations entre ces caractรจres quantitatifs, le coefficient de corrรฉlation de Pearson a รฉtรฉ calculรฉ. Ce calcul ainsi que les analyses suivantes ont รฉtรฉ effectuรฉs en utilisant le logiciel R version 3.1.1.
Sรฉlection des caractรจres quantitatifs et qualitatifs les plus discriminants. Afin de confirmer les relations entre les caractรจres quantitatifs et de dรฉterminer ceux qui sont les plus discriminants pour la caractรฉrisation morphologique de la collection, une Analyse des Composantes Principales (ACP) a รฉtรฉ rรฉalisรฉe. Les caractรจres quantitatifs sรฉlectionnรฉs ont รฉtรฉ transformรฉs en caractรจres qualitatifs, ces derniers รฉtant majoritaires, en les dรฉcoupant en classes selon des seuils choisis. Ces seuils ont รฉtรฉ fixรฉs de faรงon ร rรฉaliser pour chaque caractรจre trois classes sรฉparรฉes par un pas รฉgal (correspondant ร lโamplitude de chaque caractรจre divisรฉe en 3). Afin de dรฉterminer les caractรจres qualitatifs les plus discriminants pour la caractรฉrisation de la collection, une Analyse des Correspondances Multiples (ACM) a รฉtรฉ effectuรฉe.
Rรฉalisation du dendrogramme basรฉ sur les donnรฉes morphologiques. Les caractรจres quantitatifs transformรฉs ont รฉtรฉ associรฉs aux caractรจres qualitatifs sรฉlectionnรฉs afin de rรฉaliser une ACM. Les composantes principales de cette derniรจre ont รฉtรฉ utilisรฉes pour effectuer une classification ascendante hiรฉrarchique (distance=euclidienne et mรฉthode dโagrรฉgation=Ward).
Guide du mรฉmoire de fin d’รฉtudes avec la catรฉgorie Le genre Bougainvillea et ses espรจces |
รtudiant en universitรฉ, dans une รฉcole supรฉrieur ou dโingรฉnieur, et que vous cherchez des ressources pรฉdagogiques entiรจrement gratuites, il est jamais trop tard pour commencer ร apprendre et consulter une liste des projets proposรฉes cette annรฉe, vous trouverez ici des centaines de rapports pfe spรฉcialement conรงu pour vous aider ร rรฉdiger votre rapport de stage, vous prouvez les tรฉlรฉcharger librement en divers formats (DOC, RAR, PDF).. Tout ce que vous devez faire est de tรฉlรฉcharger le pfe et ouvrir le fichier PDF ou DOC. Ce rapport complet, pour aider les autres รฉtudiants dans leurs propres travaux, est classรฉ dans la catรฉgorie Les bougainvilliers : plantes phare du Cannebeth oรน vous pouvez trouver aussi quelques autres mรฉmoires de fin d’รฉtudes similaires.
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Table des matiรจres
Liste des abrรฉviations
Unitรฉ de mesures
Liste des annexes
Liste des illustrations
Liste des Tableaux
1 Introduction
1.1 Les bougainvilliers: des plantes exotiques de plus en plus populaires dans les rรฉgions
tropicales, subtropicales et mรฉditerranรฉennes mais dont lโidentification des cultivars et
lโattribution ร une espรจce ou ร un groupe dโhybride restent encore difficiles et confuses
1.1.1 Les bougainvilliers : des plantes grimpantes en hommage ร Bougainville
1.1.2 Une plante exotique de plus en plus populaire pour sa floraison spectaculaire
1.1.3 Le genre Bougainvillea et ses espรจces
1.1.4 Les trois principales espรจces et trois principaux groupes dโhybrides de bougainvilliers
cultivรฉs dans le monde
1.1.5 Une diversitรฉ de cultivars obtenue mais dont lโidentification des cultivars et
lโattribution ร une espรจce ou ร un groupe dโhybrides sont difficiles et confuses
1.2 Les bougainvilliers : plantes phare du Cannebeth mais qui doivent รชtre caractรฉrisรฉes afin de crรฉer de nouveaux cultivars rustiques et dโobtenir la certification ยซ collection nationale ยป
1.2.1 Les bougainvilliers : plantes phare du Cannebeth
1.2.2 Le froid et le gel : les principaux freins ร lโachat de ces fleurs de voyage
1.2.3 Une collection qui doit รชtre caractรฉrisรฉe phรฉnotypiquement et gรฉnรฉtiquement
1.3 Objectifs du stage
2 Matรฉriels et Mรฉthodes
2.1 Matรฉriel Vรฉgรฉtal
2.2 Caractรฉrisation phรฉnotypique et gรฉnรฉtique de la collection
2.2.1 Caractรฉrisation morphologique
2.2.2 Caractรฉrisation gรฉnรฉtique
2.3 Paramรจtres biologiques et mรฉthodologiques, des espรจces ornementales de bougainvilliers,
essentiels pour initier un programme dโamรฉlioration
2.4 Rรฉalisation du dossier de demande de certification ยซ collection nationale ยป du CCVS
3 Rรฉsultats
3.1 Caractรฉrisation morphologique de la collection
3.1.1 Caractรฉrisation de 90 individus sur 128
3.1.2 Vรฉrification de lโidentitรฉ des individus rรฉfรฉrencรฉs et non rรฉfรฉrencรฉs
3.1.3 Statistiques descriptives et diversitรฉ des caractรจres morphologiques quantitatifs
รฉtudiรฉs 13
3.1.4 Sรฉlection des caractรจres quantitatifs et qualitatifs les plus discriminants
3.2 Caractรฉrisation gรฉnรฉtique de la collection
3.2.1 Amplification des ISSR
3.2.2 Relations gรฉnรฉtiques
3.3 Paramรจtres biologiques et mรฉthodologiques, des espรจces ornementales de bougainvilliers,essentiels pour initier un programme dโamรฉlioration
3.3.1 Les diffรฉrentes mรฉthodes dโobtention de nouveaux cultivars
3.3.2 La polyploรฏdie
3.3.3 B. glabra: lโespรจce ornementale la plus tolรฉrante au froid
3.4 Rรฉalisation du dossier de demande de certification ยซ collection nationnale ยป du CCVS
4 Discussion
4.1 Les outils morphologiques et molรฉculaires
4.1.1 Les outils morphologiques
4.1.2 Les outils molรฉculaires
4.2 Une collection qui semble se structurer en trois principaux groupes
4.3 Une collection qui prรฉsente de nombreux clones et mutants
4.3.1 Les 13 groupes de proximitรฉ confirmรฉs
4.3.2 Les 6 groupes de clones clairement identifiรฉs
4.3.3 Les individus proches, les mutants et les clones ร confirmer par des รฉtudes futures
4.4 Les cultivars โViolet de Mรจzeโ (โVDMโ) et โSanderiana Alexandraโ (โSanderianaAโ) : des
parents potentiels pour la crรฉation de nouveaux cultivars rustiques
5 Conclusion
Bibliographie
7 Annexes
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