Soutenance mรฉmoire
LA PRODUCTION DE POULETย
Les affections respiratoires virales du poulet
Principaux virus respiratoires aviaires
La diversitรฉ des agents pathogรจnes et l’influence de facteurs techniques font de la pathologie respiratoire des volailles une entitรฉ complexe รฉtudier. Les virus tropisme respiratoire font partie de cette entitรฉ. Ils sont nombreux mais peu ont eux seuls un rรฉel impact sur la santรฉ des volailles. Cinq virus principaux ont une importance dominante dans les maladies respiratoires des volailles :
Le virus de la maladie de Newcastle (NDV)
Le virus de la bronchite infectieuse (IBV)
Le virus de linfluenza aviaire (AIV)
Le virus de la laryngotrachรฉite infectieuse (ILTV)
Le virus de la rhinotrachรฉite infectieuse ou mรฉtapneumovirus aviaire (aMPV)
En se basant sur la littรฉrature, nous avons fait le choix de ne retenir que les 4 premiers virus, pour notre รฉtude de prรฉvalence en Afrique de l’ouest. Les virus IBV et NDV engendrent le plus de pertes sur le terrain et nous avons donc ciblรฉ leur caractรฉrisation pour la suite de notre travail. C’est pourquoi nous allons les exposer de faon plus prรฉcise.
Le virus de la bronchite infectieuse (IBV)
La bronchite infectieuse est une maladie infectieuse, trลs contagieuse, causรฉe par un coronavirus, le virus de la bronchite infectieuse (IBV). C’est une maladie qui a une importance รconomique majeure car elle peut provoquer des retards de croissance, une baisse de la production et de la qualitรฉ des oeufs et une augmentation de la mortalitรฉ Sa premiรจre description remonte 1930 aux Etats-Unis [2], [3].
Le virus de la bronchite infectieuse (IBV)
LIBV appartient la famille des Coronaviridae. Cette famille comprend deux genres, les Coronavirus et les Torovirus. LIBV fait partie du groupe 3 du genre Coronavirus,maintenant nommร Gammacoronavirus.Ce groupe englobe pour l’essentiel des coronavirus aviaires. Les coronavirus des groupes alpha et bรฉta, quant- eux, comprennent les coronavirus des mammifลres. Les deltacoronavirus regroupent des virus aviaires et de mammifรจres.LIBV est un virus enveloppรฉ, ARN simple brin, de polaritรฉ positive. Son enveloppe a un diamรจtre de 120 nanomลtres. Quatre protรines structurales jouent un rle majeur (Figure 1a et 1b) :
– La protรฉine de la spicule (S) : la protรฉine S est une glycoprotรฉine, de 180 KDa. Elle se prรฉsente sous forme de dimลre ou de trimลre. Elle a deux fonctions majeures :
lattachement du virus aux cellules de lhte et la fusion de la membrane virale la membrane des cellules htes [2], [4], [6]. La protรฉine S est formรe de deux sous unitรฉs, les glycoprotรฉines S1 et S2. La glycoprotรฉine S1 est responsable du pouvoir dhรฉmagglutination et de linduction danticorps neutralisants protecteurs. La glycoprotรฉine S2 permet lencrage de S dans la membrane du virus .
– La glycoprotรฉine de la membrane (M) : la protรฉine M est une glycoprotรฉine hydrophobe partiellement exposรe la surface du virion, de masse molรฉculaire comprise entre 27 et 36 KDa. Cette protรฉine est la proรฉine structurale la plus abondante. Elle joue un rle essentiel dans lassemblage et le bourgeonnement des particules virales.
– La nuclรฉocapside (N) : la nuclรฉoprotรฉine N est une protรฉine phosphorylรฉe, hautement basique de 52 KDa [9]. Elle est รฉtroitement liรฉe la molรฉcule dARN du gรฉnome et forme une nuclรocapside de symรฉtrie hรฉlicodale. Une rรฉgion de cette protรฉine est bien conservรฉe chez les diffรฉrentes souches dIBV. Elle jouerait un rle dans la transcription et probablement dans la traduction de lARN viral .
– La protรฉine de l’enveloppe (E) : la protรฉine E est une protรฉine hydrophobe,transmembranaire, non glycosylรฉe, de petite taille et intรฉgrรฉe l’enveloppe virale. Elle joue un role essentiel dans lassemblage et le bourgeonnement des particules virales .L’organisation du gรฉnome de lIBV prรฉsente certaines similitudes avec les autres membres du genre Coronavirus :
– Un gรจne codant pour la polymรrase (ou gลne 1) qui reprรsente les 2/3 du gรฉnome,partir de la rรฉgion 5 terminale : il contient deux cadres de lecture (ORF), 1a et 1b(Figure 2), qui codent pour une polyprotรฉine fusionnรฉe 1ab, indispensable la rรฉplication
– Des gรจnes codant pour les protรฉines structurales (S, E, M et N)
– Deux gรจnes (codant pour des protรฉines non essentielles la rรฉplication mais probablement essentielles dans lรฉchappement la rรฉponse immunitaire de lhte.
Formes cliniques de la bronchite infectieuse
Initialement, la bronchite infectieuse (BI) aviaire รฉtait dรฉcrite comme une atteinte respiratoire desย jeunes poulets. Ce n’est que plus tard quelle fut dรฉcrite sur des animaux plus gรฉs, notamment chez les poules pondeuses.
Les signes cliniques sont souvent frustres, mais un poulet atteint de BI peut presenter :
– une atteinte respiratoire : dรฉtresse respiratoire, toux, reniflement, roles tracheaux, yeux qui pleurent
– une atteinte de l’รฉtat gรฉnรฉral : anorexie, retard de croissance, animaux dรฉprimรฉs – dans de rares cas, une atteinte rรฉnale : fรจces humides, dรฉpression Les poules pondeuses atteintes dIBV, quant elles, prรฉsentent une chute de ponte, avec des ลufs ยซ fripรฉs ยป la coquille fine. Les poules peuvent รฉgalement avoir des lรฉsions au niveau de loviducte [2], [3]. Des souches IBV variantes peuvent provoquer une atrรฉsie de l’appareilย gรฉnital femelle lorsque linfection virale est trลs prรฉcoce (moins de 3 semaines dge) : cette infection prรฉcoce aboutit la formation de kystes. Les poules atteintes sont dites ยซ fausses pondeuses ยป car si elles ne prรฉsentent aucun signe clinique particulier, elles ne seront jamais capables de pondre.
Les souches dIBV
LIBV a รฉtรฉ pour la premiรจre fois isolรฉ au Massachussetts, dans les annรฉes 1930 et pendant de nombreuses annรฉes, le sรฉrotype Mass fut le seul sรฉrotype dIBV connu [12]. On compte maintenant une dizaine de sรrotypes et un nombre bien plus รฉlevรฉ de gรฉnotypes. La distinction gรฉnรฉtique et antigรฉnique entre souches dIBV est complexe et ne correspond pas aux protectotype (une souche dun sรฉrotype ou d’un gรฉnotype donnรฉ ne protรจgera pas forcรฉment contre une autre souche de ce mลme sรฉrotype/gรฉnotype) [14][16]. Les souches en circulation dans le monde sont rรฉsumรฉes dans le tableau 3 .
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Guide du mรฉmoire de fin d’รฉtudes avec la catรฉgorie LES AFFECTIONS RESPIRATOIRES VIRALES DU POULET |
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Table des matiรจres
REMERCIEMENTS
DEDICACES
LISTE DES FIGURES
LISTE DES TABLEAUX
LISTE DES ABREVIATIONS
INTRODUCTION
PREMIERE PARTIE BIBLIOGRAPHIQUE : PRODUCTION ET MALADIES RESPIRATOIRES DU POULET EN AFRIQUE DE LOUEST
1. LA PRODUCTION DE POULET EN AFRIQUE DE LOUEST
1.1. PRODUCTION AVICOLE DANS LUEMOA (UNION ECONOMIQUE ET MONETAIRE OUEST AFRICAINE)
1.2. PRODUCTION AVICOLE AU TOGO, AU BENIN ET EN COTE DIVOIRE
2. LES AFFECTIONS RESPIRATOIRES VIRALES DU POULET
2.1. PRINCIPAUX VIRUS RESPIRATOIRES AVIAIRES
2.2. LE VIRUS DE LA BRONCHITE INFECTIEUSE (IBV)
2.2.1. Le virus de la bronchite infectieuse (IBV)
2.2.2. Formes cliniques de la bronchite infectieuse
2.2.3. Les souches dIBV
2.2.4. Epidรmiologie de la bronchite infectieuse dans le monde et en Afrique
2.3. LE VIRUS DE LA MALADIE DE NEWCASTLE (NDV)
2.3.1. Etiologie de NDV
2.3.2. Formes cliniques de la maladie de Newcastle
2.3.3. Souches virales de NDV
2.3.4. Epidรmiologie de NDV dans le monde et en Afrique
DEUXIEME PARTIE : ETUDES EXPERIMENTALES
1. ETUDE DE LA PREVALENCE DIBV, NDV, ILTV ET AIV AU TOGO ET AU BENIN EN 2011
1.1. MATERIELS ET METHODES
1.1.1. Extraction dADN/ARN
1.1.2. (RT)-PCR
1.1.2.1. Prรsentation
1.1.2.2. Application
1.2. RSULTATS
1.3. DISCUSSION
2. EPIDEMIOLOGIE MOLECULAIRE DE SOUCHES IVOIRIENNES DU VIRUS DE LA MALADIE DE NEWCASTLE
2.1. MATERIELS ET METHODES
2.1.1. PCR de contrle
2.1.2. Purification
2.1.3. Sรquenage
2.2. RESULTATS
2.3. DISCUSSION
3. EVALUATION DE LEFFICACITE DU VACCIN H120 CONTRE UNE SOUCHE AFRICAINE DU VIRUS DE LA BRONCHITE INFECTIEUSE
3.1. MATERIELS ET METHODES
3.1.1. Amplification du virus sur ufs embryonnรs
3.1.1.1. Infection
3.1.1.2. Rรcolte du liquide allantoque
3.1.2. Etude vaccinale
3.1.2.1. Formation des lots
3.1.2.2. Infection et รcouvillonnages
3.1.2.3. (RT)-PCRq
3.1.2.4. Sรrologie
3.2. RESULTATS
3.3. DISCUSSION
CONCLUSION
REFERENCES BIBLIOGRAPHIQUES
ANNEXE 1 : POSTER SYMPOSIUM TOULOUSE-MUNICH-SARRAGOSSE 2013
ANNEXE 2 : AVIAN INFLUENZA SURVEILLANCE IN CENTRAL AND WEST AFRICA, 20102014, T. Fuller and al. 2014
ANNEXE 3 : PREVALENCE OF NEWCASTLE DISEASE VIRUS AND INFECTIOUS BRONCHITIS VIRUS IN AVIAN INFLUENZA NEGATIVE BIRDS FROM LIVE BIRD MARKETS AND BACKYARD AND COMMERCIAL FARMS IN IVORY-COAST, A. V. Kouakou and al. 2015
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