Le digestat comme substrat pour les microalgues

Le digestat comme substrat pour les microalguesย 

La mรฉthanisation est un procรฉdรฉ anaรฉrobie permettant de produire du mรฉthane et du digestat ร  partir de biodรฉchets (figure 1) [PERDRIER, 2019].

La composition chimique du digestat varie en fonction de lโ€™origine des dรฉchets valorisรฉs : ainsi, le digestat issu de rรฉsidus de nourriture semble prรฉsenter la plus grande concentration en azote total et en nitrates, et une des plus hautes concentrations en phosphates comparรฉ aux lisiers, ensilage, excrรฉments ou boues de stations dโ€™รฉpuration [CHUKA-OGWUDE et al, 2019]. Si le digestat peut thรฉoriquement รชtre valorisรฉ directement en รฉpandage dans les exploitations agricoles, ce mode de valorisation reste trรจs contrรดlรฉ en raison du risque de lessivage des nutriments et polluants prรฉsents dans le digestat vers le milieu naturel. Il est donc nรฉcessaire de sโ€™intรฉresser ร  dโ€™autres maniรจres de valoriser ce rรฉsidu, dont les cultures de microalgues. La croissance algale nรฉcessite un apport nutritif non limitant en N, P et C, les trois รฉlรฉments principaux du mรฉtabolisme des algues, et les cultures classiques de microalgues utilisent gรฉnรฉralement des milieux de culture synthรฉtiques tels que le milieu BBM (Boldโ€™s Basal Medium). Or, une รฉtude de Fen Tan et al, 2016 a dรฉmontrรฉ que les boues issues de la mรฉthanisation รฉtaient plus efficaces que le milieu BBM pour la production de glucides par les algues.

Les espรจces de microalgues

Les algues vertes feront lโ€™objet des expรฉrimentations de ce stage en raison de leur capacitรฉ ร  utiliser la lumiรจre pour croรฎtre. Diffรฉrentes espรจces de microalgues ont รฉtรฉ รฉtudiรฉes derniรจrement, mais dโ€™aprรจs lโ€™รฉtude de Fen Tan et al, 2016, lโ€™espรจce Chlorella vulgaris prรฉsente une croissance plus rapide que les autres algues : sa productivitรฉ est plus รฉlevรฉe et la phase stationnaire arrive par consรฉquent plus rapidement. Elle est en outre trรจs commune et naturellement prรฉsente dans les milieux naturels, tout comme Scenedesmus. Il convient nรฉanmoins dโ€™รชtre attentif aux modifications de la composition de la population de microalgues au sein de la culture: les espรจces ont tendance ร  changer en fonction des ratios de nutriments [BOUGARAN, 2014].

Valeurs optimales des paramรจtres physico-chimiques

Les cultures de microalgues ont dรฉjร  fait lโ€™objet de nombreuses รฉtudes et expรฉrimentations, notamment en ce qui concerne les optimums de croissance.ย  Ces valeurs peuvent varier en fonction des espรจces de microalgues, du type de rรฉacteur utilisรฉ ou encore des injections potentielles de CO2 dans le milieu de culture, cependant les รฉtudes rรฉalisรฉes utilisaient souvent les souches dโ€™algues Scenedesmus et Chlorella, qui sont รฉgalement les principales espรจces prรฉsentes dans le consortium naturel prรฉvu pour les expรฉrimentations au cours de ce stage.

Les mรฉtaux sont รฉgalement nรฉcessaires ร  la croissance algale, mais seulement ร  lโ€™รฉtat de traces. Gรฉnรฉralement, le digestat apporte ces รฉlรฉments en quantitรฉ suffisante. Les valeurs optimales pour certains รฉlรฉments comme le P peuvent รชtre trรจs disparates. En effet, le phosphore prรฉsent dans le milieu de culture peut รชtre stockรฉ par les algues, qui peuvent alors continuer de croรฎtre mรชme lorsque le milieu est รฉpuisรฉ en phosphore [PERDRIER, 2019]. En ce qui concerne la DCO, Demande Chimique en Oxygรจne, ce paramรจtre est liรฉ ร  la turbiditรฉ du milieu de culture. Elle peut donc freiner la croissance des algues lorsque sa valeur est trop รฉlevรฉe. Il en est de mรชme pour la tempรฉrature : les hautes tempรฉratures sont plus nรฉfastes que les basses tempรฉratures pour la croissance des algues. En effet, une tempรฉrature trop importante dรฉsactive certaines protรฉines nรฉcessaires ร  la photosynthรจse. Par ailleurs, ร  une tempรฉrature optimale, les algues tolรจrent une irradiation plus importante. En outre, les hautes tempรฉratures favorisent le dรฉveloppement des bactรฉries AOB, une catรฉgorie de microorganismes oxydant lโ€™ammoniac [GONZALES-CAMEJO et al, 2019].

Le pH est รฉgalement un paramรจtre dรฉterminant pour la croissance algale. Le pKa du couple NH4+/NH3 est de 9,2, ce qui signifie que lorsque le pH du milieu est infรฉrieur ร  9,2 la majoritรฉ des ions sont sous la forme NH4+ . A lโ€™inverse, lorsque le pH du milieu est supรฉrieur ร  9,2, les ions sont majoritairement sous la forme NH3. Or, le NH3 est un gaz et tendra ร  se volatiliser, provoquant une perte dโ€™azote au niveau de lโ€™atmosphรจre. Un pH trop รฉlevรฉ aura donc tendance ร  occasionner une perte de matiรจre, ce qui sera ร  รฉviter : en effet, la perspective du projet est la valorisation de lโ€™azote via sa concentration de lโ€™azote sous forme solide au sein des microalgues.

Enfin, une concentration dโ€™algues trop importante peut nuire au dรฉveloppement de ces derniรจres. La concentration ร  ne pas dรฉpasser dรฉpend de lโ€™รฉpaisseur dโ€™eau dans le milieu de culture : plus lโ€™รฉpaisseur dโ€™eau augmente, moins la concentration dโ€™algues dans le bassin devra รชtre importante afin de limiter le self-shading. Par exemple, dans le cas dโ€™un photobiorรฉacteur, lโ€™รฉpaisseur est trรจs faible et la lumiรจre pรฉnรจtre dans le milieu de culture par plusieurs cรดtรฉs : la concentration dโ€™algues pourra donc รชtre plus importante que dans un bassin raceway dont la hauteur dโ€™eau est gรฉnรฉralement entre 20 et 35cm. Dans un systรจme raceway, la concentration en microalgues sera comprise entre 0,2 et 1 g/L, dans un systรจme PBR entre 1 et 5 g/L et dans un systรจme de plaque (avec une รฉpaisseur dโ€™eau de quelques millimรจtres) elle pourra sโ€™รฉlever ร  20 g/L. Lโ€™alternance des phases obscures et lumineuses causรฉe par le remous augmente par ailleurs lโ€™efficacitรฉ de lโ€™utilisation de la lumiรจre par les algues [LAWS et al, 1983].

Utilisation des nutriments par les algues

Le N est stockรฉ dans les algues sous forme de NH4+ et de NO3- . Le NO3- doit รชtre rรฉduit en NO2- puis en NH4+ avant lโ€™amination qui conduit ร  la transformation en acides aminรฉs ou en acides nuclรฉiques, son utilisation par les microalgues demande donc davantage dโ€™รฉnergie que lโ€™utilisation directe du NH4+ . Lโ€™absorption de NH4+ est donc bien supรฉrieure ร  celle de NO3- [EZE et al, 2018]. Lโ€™utilisation des diffรฉrentes formes dโ€™azote par les microalgues a รฉgalement un effet sur le pH du milieu de culture : en utilisant le NH4+ , elles consomment simultanรฉment des ions OHdans le milieu et font ainsi diminuer le pH. Au contraire, elles produisent des ions OHlorsquโ€™elles rรฉduisent le NO3- et ont alors tendance ร  basifier le milieu.

Le N peut รชtre absorbรฉ par les microalgues par transport passif ou actif. Le transport passif repose sur le gradient de concentration en nutriments entre le milieu de culture et le milieu interne de lโ€™algue : pour cela, la concentration en N intracellulaire doit รชtre infรฉrieure ร  sa concentration dans le milieu. Ce processus est cependant peu frรฉquent dans le milieu naturel, oรน les concentrations en N intracellulaire sont souvent bien plus รฉlevรฉes que les concentrations dans le milieu extรฉrieur. Un milieu ร  base de digestat est cependant plus concentrรฉ en N que le milieu naturel, mais il nโ€™est pas possible dโ€™utiliser un digestat trop concentrรฉ qui pourrait รชtre trop turbide pour laisser passer la lumiรจre nรฉcessaire ร  la croissance algale. Le transport actif est, lui, basรฉ sur lโ€™action dโ€™une protรฉine transmembranaire Na+ -ATPase. Une ร  deux moles dโ€™ATP sont ainsi nรฉcessaires pour transporter une mole de NO3- . Lโ€™ATP sert ร  la fois au transport du N et du C, et le nombre de molรฉcules dโ€™ATP disponibles pour le transport dรฉclenche une ยซ compรฉtition ยป entre ces deux รฉlรฉments.

Si les algues ont besoin ร  la fois de N, P et C pour survivre, les apports de N et de P doivent รชtre simultanรฉs pour permettre la croissance algale. Une carence en P occasionne un dรฉcouplage entre la phase dโ€™absorption et celle dโ€™assimilation du N par les microalgues. La croissance algale cesse, et le N organique est alors excrรฉtรฉ par les microalgues sous la forme dโ€™acides aminรฉs, qui peuvent potentiellement รชtre rรฉutilisรฉs par les algues, soit directement soit aprรจs reminรฉralisation [BOUGARAN, 2014]. Les cellules mortes de microalgues peuvent รฉgalement rejeter des nutriments dans le milieu [SERRA-MAIA et al, 2016].

La limitation de la croissance algale dรฉpend รฉgalement des interactions entre diffรฉrents facteurs et paramรจtres : on parle alors de co-limitation. Lorsque les concentrations en nutriments sont trop faibles pour pouvoir รชtre absorbรฉes, il sโ€™agit dโ€™une co-limitation multi-nutriments. La co-limitation biochimique a lieu lorsquโ€™une ressource limitante qui facilite lโ€™absorption dโ€™une autre ressource limitante est ajoutรฉe au milieu. Par exemple, lโ€™ajout du fer nรฉcessaire ร  lโ€˜activitรฉ de la nitrite rรฉductase facilite lโ€™absorption du NO3- . Enfin, on parle de co-limitation communautaire lorsque la diversitรฉ des populations phytoplanctoniques permet de limiter la compรฉtition entre les espรจces, qui nโ€™ont pas les mรชmes besoins [BOUGARAN, 2014]. La limitation de certains nutriments permet รฉgalement de produire certaines molรฉcules. En effet, cโ€™est en absence de N que les microalgues produisent le plus de lipides en utilisant la chlorophylle comme source de N. La culture prend alors une couleur jaune [LIN LUO et al, 2019].

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Table des matiรจres

Introduction
1. Etat de lโ€™art
1.1 Le digestat comme substrat pour les microalgues
1.2 Les espรจces de microalgues
1.3 Valeurs optimales des paramรจtres physico-chimiques
1.4 Modes de croissance
1.5 Utilisation des nutriments par les algues
1.6 Interactions entre les algues et les bactรฉries
1.7 Comparaison des productivitรฉs algales en raceway et photobiorรฉacteur
2. Matรฉriel et mรฉthode
2.1 Description des expรฉrimentations
2.1.1 Entretien dโ€™un inoculum
2.1.2 Description des systรจmes raceways et des expรฉrimentations
2.1.2.1 Expรฉrimentation nยฐ1 avec du NO3-
2.1.2.2 Expรฉrimentation nยฐ2 avec du NH4+
2.1.2.3 Expรฉrimentations nยฐ3 avec du digestat
2.2 Suivi analytique des expรฉrimentations
2.2.1 Description des mรฉthodes analytiques
2.2.1.1 Biomasse
2.2.1.2 Physico-chimie
2.3 Description du modรจle
2.3.1 Fonctionnement et processus pris en compte par le modรจle
2.3.2 Amรฉliorations du modรจle
2.3.2.1 De la version 1 ร  la version 2
2.3.2.2 De la version 2 ร  la version 3a, 3b et 3c
3. Rรฉsultats des simulations numรฉriques du procรฉdรฉ de culture de microalgues en rรฉacteur ouvert
3.1 Comparaisons des rรฉsultats des simulations numรฉriques avec les rรฉsultats expรฉrimentaux
3.2 Etude des interactions entre les algues et les bactรฉries en fonction des conditions
3.3 Etude de la dynamique du carbone
3.3.1 Tests dโ€™efficience du CO2 injectรฉ en fonction de la concentration en CI initial
3.3.2 Tests avec variation du pH
3.3.3 Tests avec variation des concentrations de saturation du CO2 surface et injection
3.3.4 Tests avec variations du KCO2algues
3.3.5 Tests de lโ€™impact des AOB et NOB sur le cycle du carbone
3.4 Etude de la dynamique de lโ€™azote
3.5 Conclusion sur les amรฉliorations apportรฉes au modรจle
4. Rรฉsultats des expรฉrimentations de rรฉpรฉtabilitรฉ
4.1 Rรฉpรฉtabilitรฉ en conditions abiotiques
4.2 Rรฉpรฉtabilitรฉ en conditions biotiques
4.2.1 Rรฉsultats de lโ€™expรฉrimentation nยฐ1
4.2.2 Rรฉsultats de lโ€™expรฉrimentation nยฐ2
4.2.3 Rรฉsultats de lโ€™expรฉrimentation nยฐ3
Conclusion
Bibliographie

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