Le cancer est une pathologie

Le cancer est une pathologie

Un bref historique de lโ€™oncologie La lignรฉe humaine a รฉtรฉ confrontรฉe extrรชmement tรดt au cancer, puisque cette pathologie se retrouve au cours de la prรฉhistoire, dรจs les premiers Homininรฉs il y a 1.7 millions dโ€™annรฉes (Odes et al. 2016). Nรฉanmoins, les premiรจres traces รฉcrites faisant mention de cancer se retrouvent au Proche-Orient durant la Haute Antiquitรฉ : notamment, les papyrus Edwin Smith (-3000) et Ebers (-1500) contiennent les premiรจres descriptions de tumeurs du sein, de la peau, du pharynx, de lโ€™estomac, du rectum et de lโ€™utรฉrus, mais concluent ร  lโ€™รฉpoque que la maladie est incurable (Hajdu 2004). Au IVe siรจcle avant notre รจre, Hippocrate sera le premier ร  nommer la pathologie sous le nom que nous lui connaissons, comparant ainsi les extensions de la tumeur aux longs appendices du crabe (karkinos/karkinoma). Hippocrate prรฉconise ainsi la rรฉsection chirurgicale ou la cautรฉrisation, pour venir ร  bout de la maladie (Hajdu 2004). Au Moyen-ร‚ge, la rรฉsection chirurgicale sera รฉgalement le principal traitement administrรฉ aux patients cancรฉreux sur le pourtour mรฉditerranรฉen. Nรฉanmoins, lโ€™efficacitรฉ thรฉrapeutique sera particuliรจrement amรฉliorรฉe par la description de plus en plus prรฉcise des tumeurs, et lorsque fut dรฉcouverte la nรฉcessitรฉ dโ€™extirper lโ€™entiรจretรฉ de la tumeur afin que le patient soit guรฉri (Hajdu 2011).

A lโ€™รฉpoque moderne, la dรฉcouverte et la description du systรจme lymphatique permirent ร  de nombreux mรฉdecins europรฉens dโ€™identifier et prรฉvenir les lรฉsions entraรฎnant la mort des patients. Cโ€™est รฉgalement ร  cette รฉpoque que mรฉdecins et biologistes commencent ร  identifier les origines du cancer, crรฉant ainsi les bases de lโ€™รฉpidรฉmiologie du cancer : au XVIIIe siรจcle, Percival Pott dรฉcrit ainsi le cancer du scrotum des ramoneurs et John Hunter identifie les premiers cancers hรฉrรฉditaires. Virchow est le premier, en 1858, ร  identifier lโ€™origine du cancer parmi les cellules de lโ€™organisme (Virchow 1859). A partir du dรฉbut du XXe siรจcle, les avancรฉes thรฉrapeutiques sont de plus en plus importantes. Les travaux de Rรถntgen et des Curie sur le rayonnement permettent le dรฉveloppement de la radiothรฉrapie dรจs 1904. De mรชme, ร  partir des annรฉes 1940, plusieurs mรฉdecins et pharmacologues explorent indรฉpendamment le rรฉ-emploi en oncologie dโ€™armes chimiques, dont lโ€™effet cytotoxique diminue la croissance tumorale. Dรจs lors, chirurgie, radiothรฉrapie et chimiothรฉrapie forment le corpus classique de thรฉrapies utilisรฉes en oncologie. Ce corpus sera amรฉliorรฉ par la suite, et complรฉtรฉ par des traitements de plus en plus prรฉcis (immunothรฉrapie, hormonothรฉrapie, etc).

Les manifestations cliniques du cancerย 

Le cancer se manifeste gรฉnรฉralement par la prolifรฉration cellulaire incontrรดlรฉe. Cette prolifรฉration peut se manifester par la formation dโ€™une tumeur, cโ€™est ร  dire par lโ€™augmentation de volume dโ€™un tissu. Le cancer peut donc รชtre dรฉtectรฉ par lโ€™augmentation de volume dโ€™un organe. Mais il peut รฉgalement รชtre dรฉtectรฉ, en biopsie, par des marqueurs cellulaires de prolifรฉration. Contrairement aux hyperplasies (tumeurs bรฉnignes) dont la croissance est limitรฉe, les nรฉoplasies (tumeurs malignes cancรฉreuses) ont une croissance rapide et envahissent rapidement les tissus avoisinants. Une nรฉoplasie peut รฉgalement essaimer dans le reste de lโ€™organisme : des cellules cancรฉreuses peuvent essaimer par les systรจmes sanguins et lymphatiques jusquโ€™ร  dโ€™autres organes, oรน elles forment des tumeurs secondaires (mรฉtastases). Ainsi, du fait de lโ€™invasion des tissus, le cancer peut รฉgalement รชtre dรฉtectรฉ par les perturbations physiologiques chez le patient, parmi lesquelles :

โ€ข la tumeur peut comprimer les terminaisons sensorielles et รชtre ร  lโ€™origine de douleurs
โ€ข elle peut comprimer un organe tubulaire et perturber la digestion, la respiration, etc.
โ€ข elle peut blesser les tissus, et provoquer des saignements rรฉpรฉtรฉs .

Ces manifestations, si confirmรฉes en anatomopathologie, sont le signe dโ€™un cancer invasif, ayant dรฉjร  progressรฉ ร  un stade avancรฉ. Nรฉanmoins, plusieurs mรฉthodes permettent de rechercher prรฉventivement les manifestations de cancer ร  des stades subcliniques. Les tissus les plus externes peuvent รชtre palpรฉs pour recherche de tumeurs, et parallรจlement lโ€™imagerie mรฉdicale aide ร  dรฉtecter des corps denses au
sein des tissus internes. Chez un patient, les manifestations potentielles de la maladie peuvent รชtre graves et gรฉnรฉralisรฉes au fur et ร  mesure que le cancer progresse de stade en stade. La croissance de la tumeur et le processus invasif causent de nombreux troubles organiques et fonctionnels dans les organes touchรฉs. La modification de la balance hormonale modifie en profondeur la physiologie du patient : il peut รชtre atteint dโ€™immunosuppression (Almand et al. 2001; Wolf et al. 2003), et subir une perte de poids rapide et gรฉnรฉralisรฉe (Tisdale 2002). Les troubles psychologiques et du sommeil sont รฉgalement frรฉquents (Chochinov 2001; Lowery 2015). La lรฉtalitรฉ du patient cancรฉreux dรฉpend de lโ€™organe touchรฉ, du stade auquel le cancer est pris en charge, et de la condition physique du patient. Ainsi, le taux de survie ร  5 ans est de 87% pour les patients atteints dโ€™une tumeur mammaire, mais de seulement 19% pour les patients atteints dโ€™une tumeur cรฉrรฉbrale. Pour ces derniers, 60% dโ€™entre eux survivent au moins 5 ans sโ€™ils ont moins de 40 ans au diagnostic, mais 1% seulement au delร  de 80 ans .

Traitement clinique du cancer

La guรฉrison du cancer revient ร  rรฉduire le risque de re-dรฉvelopper une tumeur jusquโ€™ร  atteindre celui de la population gรฉnรฉrale non cancรฉreuse, ce qui passe gรฉnรฉralement par une รฉlimination complรจte de la (ou les) tumeur(s). Pour ce faire, il est souvent indispensable dโ€™effectuer une rรฉsection chirurgicale des tissus cancรฉreux. Nรฉanmoins, lโ€™ablation se doit dโ€™รชtre la plus localisรฉe possible, de sorte ร  ne pas enlever des tissus sains indispensables ร  la survie ou la bonne santรฉ du patient (tumeur cรฉrรฉbrale ou osseuse par exemple) : une rรฉduction prรฉalable de la taille de la tumeur peut รชtre nรฉcessaire. De mรชme, la tumeur peut รชtre trop รฉtendue ou placรฉe dans un organe trop complexe ร  opรฉrer, pour que tous les tissus puissent รชtre รฉliminรฉs chirurgicalement. Il est donc souvent nรฉcessaire de procรฉder ร  des traitements complรฉmentaires, antรฉrieurement et/ou postรฉrieurement ร  la chirurgie. Pour ce faire, la radiothรฉrapie et la chimiothรฉrapie sont les traitements les plus couramment utilisรฉs (aux cรดtรฉs des thermothรฉrapies, des immunothรฉrapies, etc.). La radiothรฉrapie consiste ร  exposer localement les tissus cancรฉreux du patient ร  des rayonnements ionisants (rayons X ou gamma), bloquant ainsi leur capacitรฉ de rรฉplication. Elle permet un traitement ciblรฉ de la tumeur, mais prรฉsente des risques de radiotoxicitรฉ. La chimiothรฉrapie anticancรฉreuse consiste ร  exposer toutes les cellules ร  prolifรฉration rapide, au premier rang desquelles les cellules cancรฉreuses, ร  des substances cytotoxiques (agents alkylants, antimรฉtabolites, hormones, etc.). Nรฉanmoins, ces substances peu spรฉcifiques affectent souvent les cellules saines, et peuvent donc รชtre mal supportรฉes par les patients. Quelle que soit la combinaison de traitements employรฉs, il est frรฉquent quโ€™ils ne rรฉussissent pas ร  รฉliminer lโ€™intรฉgralitรฉ des tissus malades. Un petit nombre de cellules cancรฉreuses rรฉsistant au traitement suffit alors ร  reconstituer une tumeur entiรจre, et ร  provoquer la rรฉcidive du cancer.

Le processus cancรฉreux

Un processus dynamique : de lโ€™initiation ร  la mรฉtastase Le cancer est le plus souvent une pathologie de temporalitรฉ lente : elle suit une progression sur plusieurs รฉtapes obligatoirement successives, dont le passage de lโ€™une ร  lโ€™autre repose sur un processus alรฉatoire. De lโ€™initiation de cette prolifรฉration au moment du diagnostic se passe une durรฉe de lโ€™ordre de la dizaine dโ€™annรฉes (Beerenwinkel et al. 2007). Les premiรจres รฉtapes de cancรฉrogenรจse rรฉalisent la transformation de cellules saines en cellules cancรฉreuses. Ainsi, durant lโ€™initiation, les cellules perdent leur capacitรฉ ร  effectuer lโ€™apoptose, deviennent insensibles aux signaux pro-apoptotiques, et dรฉrรฉgulent leur cycle cellulaire (Gatenby and R. J. Gillies 2008). La promotion pรฉrennise ensuite les transformations acquises durant lโ€™initiation, notamment par une dรฉrรฉgulation profonde du gรฉnome. La formation de la tumeur (tumorigenรจse) rรฉclame la permissivitรฉ du stroma : cโ€™est ร  dire la stimulation de la progression cancรฉreuse par les cellules saines. Ainsi, un cancer in situ pratique lโ€™angiogenรจse (formation de vaisseaux sanguins de novo) et la production de facteurs de croissance. Le cancer devient invasif dรจs lors que la croissance tumorale sโ€™รฉtend au delร  des lames basales. Lโ€™invasion des tissus environnant se poursuit jusquโ€™aux circulations sanguine et lymphatique, ร  partir desquelles le cancer peut prolifรฉrer dans dโ€™autres organes (sous forme de mรฉtastase).

Le phรฉnotype de la cellule cancรฉreuse Bien que la majoritรฉ des cancers soient dโ€™origine ectodermique, cette pathologie peut en fait provenir de tout tissu de lโ€™organisme, et les pathologies diffรจrent รฉnormรฉment selon la cellule dโ€™origine. Nรฉanmoins, les cellules cancรฉreuses partagent des caractรฉristiques phรฉnotypiques communes, largement connues sous le nom de hallmarks of cancer (Hanahan and Weinberg 2000, 2011). Ces caractรฉristiques, acquises au cours de la progression cancรฉreuse, sont au nombre de six : lโ€™autosuffisance en signaux de croissance, lโ€™insensibilitรฉ aux signaux inhibiteurs de la croissance, la capacitรฉ ร  รฉviter lโ€™apoptose, la capacitรฉ de se rรฉpliquer indรฉfiniment, lโ€™induction de lโ€™angiogenรจse, et la capacitรฉ ร  former des mรฉtastases (Hanahan and Weinberg 2000). On y ajoute rรฉguliรจrement deux caractรฉristiques phรฉnotypiques supplรฉmentaires : la dรฉrรฉgulation du mรฉtabolisme รฉnergรฉtique cellulaire et la capacitรฉ ร  รฉviter une destruction par le systรจme immunitaire. Lโ€™ensemble de ces caractรฉristiques apparaissent sous lโ€™influence de lโ€™inflammation et de lโ€™instabilitรฉ gรฉnomique (Hanahan and Weinberg 2011).

Le gรฉnotype des cellules cancรฉreuses La transformation de cellules saines en cellules cancรฉreuses est avant tout basรฉe sur le processus de mutation somatique. Les mutations impliquรฉes dans la progression cancรฉreuse (mutations drivers) touchent gรฉnรฉralement trois familles de gรจnes :
โ€ข Les proto-oncogรจnes (p. ex. myc,ras, abl) sont des rรฉgulateurs positifs de la prolifรฉration cellulaire. Le gain de fonction de ces gรจnes stimule la division cellulaire ou inhibe lโ€™apoptose.
โ€ข Les gรจnes gatekeepers (p. ex. p53, Rb) sont des rรฉgulateurs du cycle cellulaire. La perte de fonction de ces gรจnes favorise la croissance cellulaire incontrรดlรฉe.
โ€ข Les gรจnes caretakers (p. ex. brca1/2, atm) participent ร  lโ€™intรฉgritรฉ du gรฉnome. Leur perte de fonction nโ€™influence pas directement la prolifรฉration cellulaire, mais favorise lโ€™accumulation de nouvelles mutations. Cette derniรจre catรฉgorie de gรจnes est, avec les gatekeepers, regroupรฉe sous le terme gรฉnรฉrique de gรจnes suppresseurs de tumeurs.

Ces mutations, lorsquโ€™elles sont accumulรฉes selon une sรฉquence spรฉcifique, favorisent la prolifรฉration des cellules cancรฉreuses (Fearon and Vogelstein 1990). Ainsi, le cancer est caractรฉrisรฉ par une trรจs forte instabilitรฉ gรฉnomique. Le gรฉnome cancรฉreux peut notamment diffรฉrer du gรฉnome sain par plus de 1000 mutations ou รฉpimutations (Vogelstein, Papadopoulos, et al. 2013). On peut รฉgalement retrouver de nombreux exemples de polyploรฏdie, dโ€™aneuploรฏdie et dโ€™aberrations chromosomiques parmi les cellules cancรฉreuses (Davoli et al. 2017; Dewhurst et al. 2014). Du reste, lโ€™accumulation des modifications gรฉnomiques est indรฉpendante dโ€™une cellule ร  lโ€™autre, ce qui rรฉsulte en une trรจs forte hรฉtรฉrogรฉnรฉitรฉ gรฉnรฉtique au sein de chaque tumeur, ainsi que dโ€™une tumeur ร  lโ€™autre (Marusyk and Polyak 2010; Vogelstein, Papadopoulos, et al. 2013).

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Table des matiรจres

I Introduction
1 Introduction ร  la biologie du cancer
1.1 Le cancer est une pathologie
1.2 Le processus cancรฉreux
1.3 Causes intrinsรจques et extrinsรจques du cancer
1.3.1 Causes intrinsรจques
1.3.2 Causes extrinsรจques
2 Ecologie et รฉvolution du processus cancรฉreux
2.1 La cellule cancรฉreuse, une unitรฉ de sรฉlection
2.2 Les tumeurs sont des รฉcosystรจmes
2.3 Processus รฉco-รฉvolutifs et dรฉveloppement de la maladie
3 Impacts รฉcologiques et รฉvolutifs du processus cancรฉreux
3.1 Le cancer dans lโ€™arbre de la vie
3.2 Le cancer comme pression de sรฉlection
3.3 Le cancer dans les รฉcosystรจmes
4 Le cancer, un processus ร  lโ€™interface de plusieurs รฉchelles
4.1 Cancer, conflits, et compromis
4.2 Evolution intra-organisme, รฉvolution inter-organisme
II Ecologie et รฉvolution intra-tumorales
5 Mutations et structure รฉcologique des tumeurs
6 Ecologie tumorale et diversitรฉ clonale
III Le cancer comme pression de sรฉlection
7 Evolution des cancers familiaux : une approche neutraliste
8 Exploration thรฉorique de lโ€™approche neutraliste pour lโ€™รฉvolution des cancers familiaux
IV Des tumeurs aux populations
9 Evolution emboรฎtรฉe des mรฉcanismes de dรฉfenses contre le cancer
10 Une perspective multi-รฉchelle sur les modifications phรฉnotypiques associรฉes au cancer
V Discussion et perspectives
11 Discussion
11.1 Le cancer au cล“ur des dynamiques รฉco-รฉvolutives
11.2 Sciences de lโ€™รฉvolution et oncologie
12 Perspectives
12.1 La mรฉtastase ou lโ€™รฉvolution de la dispersion
12.2 Le cancer dans le phรฉnotype : une รฉvolution ร  plusieurs รฉchelles
12.3 De lโ€™รฉvolutivitรฉ de lโ€™individu : comment lโ€™รฉvolution contraint lโ€™รฉvolution
13 Conclusion gรฉnรฉrale
VI Bibliographie
VII Annexes

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