Le cancer du lymphome

Le cancer du lymphome

Introduction générale

L’anthropologie est la science qui étudie des populations humaines en se basant sur plusieurs disciplines. Sa nouvelle discipline : l’anthropologie génétique, permet d’explorer les génomes et de décrire les diversités génétiques des populations. Ceci permet de confirmer les hypothèses faites sur les évènements survenus au cours de leurs histoires, ou d’en formuler de nouvelles. Comprendre la structure génétique des populations est important, non seulement du point de vue historique, mais également pour la conception et l’interprétation appropriées des études épidémio-génétiques (Laoet al., 2008). La structure de la population à échelle précise peut confondre des études de cartographie des maladies et révèlent l’histoire de la migration et la divergence qui a façonné la diversité de notre espèce (Lao et Kayser, 2015 ; Novembre et Peter, 2016).
L’histoire évolutive de l’Homme signifie bien plus que son histoire démographique. Elle inclut également son adaptation génétique aux divers environnements qu’il a rencontrés, nutritionnels, climatiques ou pathogéniques, ainsi que les différentes réponses épigénétiques mises en place pour y faire face. Les larges éventails de variations phénotypiques observées chez les populations humaines peuvent refléter des processus distinctifs d’adaptation génétique à des conditions environnementales variables (Luis-Quintana, 2016 ; Pinhasi et al., 2012).
Notre histoire récente a donc impliqué des interactions complexes de transmission et d’évolution biologiques et culturelles. De plus, l’évolution culturelle est devenue de plus en plus rapide. Il n’est pas surprenant que nombre, voire la totalité, des caractéristiques psychologiques et des maladies aient une base à la fois génétique et culturelle, avec des interactions complexes entre elles. On espère que l’analyse du génome moderne aidera grandement à comprendre la partie transmise génétiquement (Cavalli-Sforza, 2010). En Afrique du Nord, les grandes questions de l’histoire du peuplement passent nécessairement par l’étude des populations berbères. En effet, leurs ancêtres sont considérés comme les plus anciens habitants du nord de l’Afrique. Ces anciens Berbères ont par la suite connu un passé historique très mouvementé avec de nombreuses conquêtes, invasions et tentatives d’assimilation. La plus récente et importante d’entre elles est la conquête arabe amorcée au VII ème siècle qui a conduit à de profonds changements culturels, linguistiques et religieux. Le refus d’islamisation et d’arabisation de certains groupes berbères a contraint ces derniers à se retirer dans des régions isolées (Coudray et al., 2006).

 Synthèse Bibliographique
 Le Contexte historique et démographique de la population de Honaïne

La région de Honaïne, grâce à son passé historique et culturel, s’inscrit bien dans l’héritage du patrimoine architectural riche et diversifié du chef lieu de la wilaya de Tlemcen. Au niveau ethnique, cette population appartient à la tribu des Koumia établi dans les monts de Taras avant le XVIème siècle. La population berbère de Honaïne est une population endogame à faible effectif, sa structure et son relief géographique feraient d’elle une population de référence (Aouar et al., 2005 ; Otmani et al., 2017), qui nous incitera à évaluer sa diversité génétique et la comparer d’une part aux populations inter-régionales et d’autre part aux populations de l’espace Méditerranéen. La figure 01 présente l’arbre d’organisation tribale de la population de Honaïne.

 Honaïne dans l’antiquité

Au début, la ville a été fondée en tant que comptoir commercial dont les jalons ont été posés par les commerçants phéniciens aux environs du Xllème siècle avant Jésus Christ (J.C.) (Lethielleux, 1974) à l’instar des comptoirs du rivage méridional méditerranéen. Elle est connue sous le nom GYPSARIA PORTUS (Mc Carthy, 1956), le mot désignant le lieu du gypse dont regorgent les cimes élevées lequel varie du calcaire transformé en marbre sous diverses formes naturelles. Sous l’ère de l’occupation romaine, la ville paraît plus moderne afin d’aller de pair avec les exigences des fonctions qui lui ont été dévolues, étant donné qu’il a été procédé à la réparation du port et à son extension à la terre ou un bassin de dimension (85m/50m) a été creusé, en étant relié par un canal au port (Khalifa, 1988).

 Le système MNSs

Le système MNSs constitue l’expression du polymorphisme de certaines glycoprotéines de la membrane du globule rouge, les glycophorines A et B (GPA etGPB) (Lefrère et Rouger, 2009). La principale caractéristique des glycophorines est l’importante glycosylation de leur domaine extracellulaire qui les affecte d’une forte charge négative empêchant toute agglutination spontanée des hématies. Ces molécules contribuent aussi à structurer le glycocalix, véritable manteau de protection contre les agressions mécaniques ou microbiennes de l’hématie. Par ailleurs, la GPA joue un rôle important dans la fixation et la pénétration du Plasmodium falciparum. Les sujets totalement dépourvus de GPA étant extrêmement rares, ces molécules doivent avoir ou avoir eu des fonctions importantes. C’est un système d’une grande complexité qui comporte 48 antigènes. Des études familiales ont démontré qu’il s’agissait d’un système lié, dont la répartition haplotypique n’est pas équilibrée d’où la distinction de quatre haplotypes : MS, Ms, NS et Ns qui déterminent 9 phénotypes et 10 combinaisons génotypiques. Deux couples d’allèles courants, M/N et S/s, sont situés sur 2 loci très fortement liés. L’association des deux couples d’allèles fait l’objet d’un déséquilibre de liaison.

 Marqueurs de Morbidité
 Généralités

La morbidité est l’état de maladie ; au sein d’une population déterminée, elle représentele nombre de personnes malades ou de cas de maladies enregistrés à un moment donné ou pendant une période déterminée. Elle peut être exprimée soit en fonction des cas nouveaux (incidence), soit de l’ensemble des cas, anciens et nouveaux (prévalence). On distingue habituellement plusieurs types de morbidité : Une morbidité diagnostiquée : qui correspond aux affections diagnostiquées et traitées par le corps médical, chez des individus ayant eu recours à des médecins ; Une morbidité dite ressentie : qui recouvre l’ensemble des affections, des troubles réels tels que les individus les ressentent et les interprètent, dont un sous-ensemble constitue la morbidité déclarée ; Enfin, la morbidité infra-clinique ; ce sont les affections dont on ne peut encore déceler l’existence, faute de signes cliniques ou de moyens d’investigation suffisamment sensibles L’ensemble constitue la morbidité réelle, comprenant la totalité des affections existant chez un individu, connues ou non de lui, diagnostiquées ou non.

 Matériels et Méthodes
Présentation générale de la population endogame de Honaïne

La région de Honaїne est située au Nord Ouest de chef lieu de la wilaya de Tlemcen. Honaïne est une daïra qui occupe la partie Nord-Est des Traras orientaux, limitrophe à la daïra de Béni Saf (Oulhaça) dans la wilaya d’Ain-Temouchent, limitée au Nord par la mer, à l’ouest par les daïras de Nedroma et de Ghazaouet et au sud par la daïra de Remchi dont elle faisait partie avant le découpage administratif de 1991 (Figure 04). Distante de 68Km du chef lieu de la wilaya de Tlemcen. Honaïne est composée de deux communes (Honaïne et Beni Khellad) qui comptent 12495 habitants et pour une superficie de 137 Km2, avec des activités s’articulant autour de l’agriculture, un secteur halieutique naissant et une émigration importante (principalement vers la France). Ces deux communes font partiedes communes montagneuses de la wilaya et sont toutes les deux côtières.

Conclusion

Dans le cadre de la caractérisation génétique de la population endogame de Honaïne dans le littoral du Nord-Ouest Algérien, nous avons utilisé, comme marqueurs, le polymorphisme des groupes sanguins érythrocytaires ABO, Rh, MNSs et Duffy,qui depuis longtemps ont montré leur efficacité dans l’analyse de la variabilité génétique et la compréhension du rôle joué par les migrations dans la diversité humaine. Le choix non-panmictique du partenaire au sein de la population illustré dans notre population de Honaïne par un taux de consanguinité important et en plus d’autres types d’endogamie géographique, professionnelle, religieuse…..modifie de façon sensible la structure génétique de la population au fil du temps. Mais aussi bien les effets des forces évolutives: mutations, sélection naturelle, dérive génétique et/ ou flux migratoires (géniques) d’une génération à une autre entraînent une diversité génétique des populations avoisinante. Des populations humaines bien caractérisées fournissent d’excellents échantillons d’étude pour de nombreuses études génétiques différentes, allant des études d’association à l’échelle du génome à la caractérisation des interactions entre les gènes et l’environnement (Kristiansson et al., 2008). L’augmentation du fardeau du cancer est due à plusieurs facteurs, notamment la croissance démographique et le vieillissement ainsi que la tendance changeante de certaines causes de cancer liées au développement social et économique. Des efforts de prévention efficaces peuvent expliquer la diminution observée des taux d’incidence de certains cancers, tels que le cancer du poumon (par exemple chez les hommes en Europe du Nord et en Amérique du Nord) et le cancer du col de l’utérus (par exemple dans la plupart des régions à l’exception de l’Afrique subsaharienne). Cependant, les nouvelles données montrent que la plupart des pays sont toujours confrontés à une augmentation du nombre absolu de cas diagnostiqués et nécessitant un traitement et des soins (IARC 2018, Heuzé et al., 2019.).

Table des matières

Introduction générale
1. Synthèse Bibliographique
1.1 Le Contexte historique et démographique de la population de Honaïne
1.1.1 Honaïne dans l’antiquité
1.1.2 Honaïne dans le médiéval Erreur ! Signet non défini.
1.1.3 Honaïne dans le contemporain Erreur ! Signet non défini.
1.1.4 Aspect démographique
1.2. Paramètres d’étude de la diversité génétique
1.2.1 Les marqueurs érythrocytaires et la notion de groupes sanguins
1.2.1.1 Le système ABO
1.2.1.2 Le système Rhésus
1.2.1.3 Le système Duffy
1.2.1.4 Le système MNSs
1.2.2 Croisements non aléatoires (Endogamie et Consanguinité)
1.2.2.1 Endogamie
1.2.2.2 Consanguinité
1.2.2.3 L’impact de la consanguinité sur la morbidité et la mortalité
1.2.3 Marqueurs de Morbidité
1.2.3.1 Généralités
1.2.3.2 La morbidité cancéreuse  Erreur ! Signet non défini.
1.2.3.3 Le profil épidémiologique des cancers dans le contexte Algérien Erreur ! Signet non défini.
2. Matériels et Méthodes
2.1 Présentation générale de la population endogame de Honaïne
2.2 Analyses des d’échantillons par type du marqueur
2.2.1 Les marqueurs érythrocytaires : les groupes sanguins  Erreur ! Signet non défini.
2.2.1.1 Echantillonnage Erreur ! Signet non défini.
2.2.1.2 Prélèvement du sang  Erreur ! Signet non défini.
2.2.1.3 Groupage sanguin  Erreur ! Signet non défini.
2.2.1.4 Extraction de l’ADN
2.2.1.5 Analyses statistiques
2.2.2 Consanguinité
2.2.2.1 Questionnaire
2.2.2.2 Recrutement des individus
2.2.3 Les marqueurs de morbidité : Le Cancer
2.2.3.1 Structures sanitaires
2.2.3.2 Type d’étudeErreur ! Signet non défini.
2.2.3.3 Recueil des données Erreur ! Signet non défini.
2.2.3.4 Le traitement statistique des données
3. Résultats et Discussion
3.1 Le polymorphisme érythrocytaire
3.1.1 Fréquences phénotypiques et alléliques des systèmes sanguins  Erreur ! Signet non défini.
3.1.1.1 Système ABO  Erreur ! Signet non défini
3.1.1.2 Système Rhésus  Erreur ! Signet non défini
3.1.1.3 Système MNSs  Erreur ! Signet non défini
3.1.1.4 Système Duffy Erreur ! Signet non défini.
3.1.1.5 Hétérozygotie Erreur ! Signet non défini.
3.1.2 Comparaisons inter-populationnelles
3.1.3 La diversité génétique
3.1.4 Affinités inter-populationnelles
3.1.4.1 Analyse en Composante Principales (ACP)
3.1.4.2 Distances et arbres phylogénétiques
3.2 Consanguinité Erreur ! Signet non défini.
3.2.1 Fréquence et nature de la consanguinité Erreur ! Signet non défini.
3.2.2 Comparaison inter-populationnelle du taux de consanguinité à Honaïne  Erreur ! Signet non défini
3.2.2.1 Variabilité inter-circonscriptions Erreur ! Signet non défini.
3.2.2.2 Dans le monde Arabo-musulmans
3.3 Marqueurs de morbidité (La morbidité cancéreuse)
3.3.1 Répartition globale du cancer tous types confondus dans la population endogame de Honaïne
3.3.1.1 Prévalence et incidence du cancer
3.3.1.2 Répartition de taux d’incidence du cancer par sexe
3.3.1.3 Répartition de taux d’incidence du cancer par tranche d’âge  Erreur ! Signet non défini.
3.3.1.4 Répartition de taux d’incidence du cancer par tranche d’âge et par sexe
3.3.2 Variabilité inter-circonscriptions du taux d’incidence du cancer tous types confondus
3.3.2.1 Répartition de taux d’incidence du cancer par circonscriptions
3.3.2.2 Répartition de taux d’incidence du cancer par circonscriptions et par sexe
3.3.2.3 Répartition de l’incidence du cancer par circonscriptions et par tranche d’âge
3.3.3 Evolution chronologique du cancer
3.3.4 Variabilité inter-circonscriptions par type du cancer  Erreur ! Signet non défini.
3.3.4.1 Variabilité inter-circonscriptions de taux d’incidence du cancer Erreur ! Signet non défini
3.3.4.2 Variabilité inter-circonscriptions de la fréquence du cancer Erreur ! Signet non défini.
3.3.5 Variabilités inter-populationnelles de taux d’incidence du cancer en Algérie
3.3.6 Variabilités inter-populationnelles du taux d’incidence du cancer dans le bassin méditerranéen  Erreur ! Signet non défini
3.3.6.1 Le cancer du sein  Erreur ! Signet non défini.
3.3.6.2 Le cancer du poumon  Erreur ! Signet non défini.
3.3.6.3 Le cancer du cerveau  Erreur ! Signet non défini.
3.3.6.4 Le cancer du lymphome
3.3.6.5 Le cancer de bouche- pharynx
3.3.7 Les affinités inter-populationnelles  Erreur ! Signet non défini.
3.3.7.1 Affinité inter-circonscription
3.3.7.2 Affinité inter-populationnelles au niveau national Erreur ! Signet non défini
3.3.7.3 Affinité inter-populationnelles au niveau du bassin méditerranéen  Erreur ! Signet non défini
Conclusion

Télécharger le rapport complet