La transmission d’agents infectieux par le biais de l’avifaune sauvage

La transmission d’agents infectieux par le biais de l’avifaune sauvage

Rôles de l’avifaune sauvage dans le portage et la transmission d’agents infectieux à potentiel zoonotique

L’avifaune sauvage et en particulier les oiseaux migrateurs ont longtemps été suspectés d’être des réservoirs d’agents de maladies infectieuses pouvant être transmis aux oiseaux domestiques présents dans les élevages, voire aux mammifères ou à l’homme. Des transmissions en sens inverse, c’est-à-dire des volailles domestiques aux oiseaux sauvages sont également envisagées. En fonction des espèces concernées, la réceptivité et la sensibilité aux agents infectieux diffèrent, les oiseaux pouvant ainsi être cliniquement malades, porteurs sains ou porteurs d’un vecteur infecté (arthropode). Ces liens restent difficiles à prouver avec certitude car plusieurs domaines d’étude sont à prendre en compte : écologie, infectiologie (bactériologie, virologie, mycologie, parasitologie), épidémiologie, génétique, biologie moléculaire, biologie médicale, productions animales, médecine humaine dans les cas de zoonoses.La migration est une stratégie adaptative adoptée par certains oiseaux pour pallier le manque de nourriture pendant la saison froide. Pendant ce parcours migratoire, des populations importantes d’oiseaux sont amenées à se côtoyer, notamment au niveau des aires de transition où les oiseaux se reposent et s’alimentent, ce qui crée des conditions propices pour la transmission puis la diffusion d’agents pathogènes (Olsen et al. 2006).Ainsi, pour qu’un oiseau migrateur soit vecteur d’un agent infectieux, il faut que les cinq conditions suivantes soient remplies (Gaidet et al. 2010) : – l’oiseau doit être en contact avec l’agent infectieux, en être une espèce réceptive ou sensible et être capable de l’excréter ; – l’infection doit être asymptomatique dans un premier temps, au moins temporairement pour ne pas affecter les mouvements migratoires de l’oiseau ; – l’oiseau doit être capable de parcourir de nombreux kilomètres durant cette période d’incubation ; – la période d’incubation doit correspondre à la période de la migration ; – l’oiseau en question doit transmettre l’agent infectieux à de nouveaux hôtes réceptifs ou sensibles, par une contamination directe ou indirecte.

La contamination des élevages aviaires par des agents pathogènes portés par les espèces migratrices fait également intervenir les populations locales et commensales d’oiseaux sauvages en tant qu’espèces passerelles car elles sont au contact de l’avifaune migratrice et domestique (Caron et al. 2014; Hill et al. 2012).

Les oiseaux migrateurs jouent un rôle dans le portage et la transmission d’agents pathogènes à l’origine de maladies infectieuses émergentes zoonotiques tels que le virus West Nile (Flaviviridae), l’agent de la maladie de Lyme (Borrelia burgdorferi sensu lato), des virus influenza A (Orthomyxoviridae), des bactéries entéropathogènes (Salmonella spp. et Campylobacter spp.) ou des bactéries multirésistantes aux antibiotiques (Reed et al. 2003).Bien que le rôle de l’avifaune sauvage ne soit pas toujours prouvé dans la transmission et la dispersion d’agents infectieux, il est important de rappeler que l’application de règles de biosécurité afin de limiter tout contact entre volailles et avifaune sauvage devrait être respectée pour minimiser les risques (Olsen et al. 2006; The Global Consortium for H5N8 and Related Influenza Viruses 2016; Webster et al. 2006). En ce qui concerne l’homme, des règles primaires d’hygiène sont à respecter pour éviter tout risque de transmission d’agents infectieux par l’avifaune sauvage, en particulier pour les personnes immunodéprimées. Les marchés d’animaux vivants où de nombreuses espèces d’oiseaux sont mélangées, d’origine domestique ou sauvage, sont propices à la circulation d’agents pathogènes et contribuent particulièrement à la circulation endémique d’influenza aviaire en Asie (Webster 2004).

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Table des matières

Table des figures
Table des tableaux
Liste des abréviations
Introduction
Première partie : précision du contexte sanitaire au cours des deux émergences d’influenza aviaire hautement pathogène en France en 2015-2016 et en 2016-2017 et apport d’éléments de bibliographie concernant la transmission d’agents infectieux par le biais de l’avifaune sauvage
A, Contexte sanitaire au cours des deux émergences d’influenza aviaire hautement pathogène en France en 2015-2016 et en 2016-2017
1, L’émergence d’influenza aviaire hautement pathogène dans les élevages aviaires en France pendant l’année 2015-2016
2, L’émergence d’influenza aviaire hautement pathogène dans les élevages aviaires en France pendant l’année 2016-2017
3, Surveillance épidémiologique de l’avifaune sauvage pendant les émergences d’influenza aviaire hautement pathogène en France en 2015-2016 et en 20162017
B, Rôles de l’avifaune sauvage dans le portage et la transmission d’agents infectieux à potentiel zoonotique
1, Généralités
2, Rôles de l’avifaune sauvage en tant que porteur d’agent de maladies infectieuses : exemple des virus influenza A
3, Rôles de l’avifaune sauvage en tant que porteur d’agent de maladies infectieuses : autres exemples de maladies potentiellement zoonotiques
Deuxième partie : éléments de biologie du Héron garde-bœufs
A, Migration, colonisation et sédentarisation au sein de la France
B, Habitat et reproduction
C, Alimentation
D, Eco-épidémiologie et synthèse sur les données actuelles concernant le statut sanitaire du Héron garde-bœufs
Troisième partie : protocole expérimental et précision du statut sanitaire des hérons garde-bœufs dans le Sud-Ouest de la France en 2016 et en 2017
A, Notions d’infectiologie
1, Virus influenza A
2, Virus de la maladie de Newcastle
3, Mycoplasma gallisepticum
4, Chlamydia spp. et agents de la chlamydiose aviaire
B, Matériels et méthodes
1, Objectifs de l’étude
2, Sites de prélèvements
3, Prélèvements
4, Analyses effectuées au laboratoire
C, Résultats
D, Discussion
Conclusion
Bibliographie
Annexes