Informations récoltées concernant l’animal

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MILIEU ET SITE D’ETUDE

Milieu d’étude

Le Parc National de Ranomafana a été créé le 07 mai, 1991 par le décret 91/250 de 07/05/91 et a été officiellement inauguré le 31 mai 1991. Il couvre 41.601 d’hectares et a un périmètre de 254 kilomètres (ANGAP 2005).
Il est situé dans la région de Vatovavy Fitovinany et est localisé entre 47°18′ et 47°37′ de longitude Est et entre 21°02 et 21°25 de latitude Sud.
Le Parc National de Ranomafana est localisé à :
– 64 Km au Nord Est de Fianarantsoa.
– 400 Km au Sud Est d’Antananarivo, la capitale.
– 139 Km à l’Ouest de Mananjary.
– 90 Km à l’ouest de l’Océan indien
Les routes nationales RN45 et RN25 parcourent le parc et le séparent en trois parcelles de terrains : parcelle 1 au nord : 23, 970 hectares, parcelle 2 à l’ouest : 3,503 hectares et parcelle 3 au sud : 14,128 hectares (Figure 1 ; p.6).
Le parc a un relief essentiellement montagneux avec des forêts humides dont quelques-unes se situent en basse altitude et ombragée mais dont la plupart se trouvent sur des terrains escarpés et s’avèrent être inexplorées.
Ranomafana a un climat tropical humide. La température moyenne annuelle est de 18,6°C, avec une température minimum moyenne de 11,6°C et une température maximale moyenne de 26,08°C (Figure 2 ; p.7). La précipitation atteint un maximum d’approximativement 2517,03 mm par an (Figure 3 ; p.7). L’humidité relative varie entre 90 % à 98 %. L’Alizé qui souffle en direction Est-Sud-Est apporte une humidité considérable par le passage à travers l’escarpement à l’est de Madagascar.
La forêt de Ranomafana est le plus grand réservoir d’eau dans le sud-est de Madagascar. Beaucoup de petites rivières ont leur source dans le parc. La descente escarpée de la Rivière Namorona dans la région fournit de l’énergie hydraulique pour la région Ranomafana et de Fianarantsoa. De nombreux petits lacs et marais sont aussi présents dans le parc (ANGAP 2005).

Site d’étude

Le site d’étude, le système de piste Vatoharanana, est localisé dans la parcelle 3 du Parc National de Ranomafana (Figure 1, p.6). Il se trouve approximativement à quatre kilomètres au sud de l’entrée du Parc. Ce site est localisé entre 21° 15’ S et 47° 25’ E. Rangé parmi les sites de moyenne altitude dans la classification des sites de recherche du Parc National de Ranomafana, il se situe entre 1030 m et 1200 m du niveau de la mer. Ce site semble idéal pour l’étude car :
– C’est avant tout l’endroit où on peut trouver le caméléon d’O’Shaughnessy dans son milieu naturel : cette partie du parc est la moins perturbée (Brady et Griffits, 1997 ; ICTE 2007). Comme Calumma oshaughnessyi est une espèce ayant une préférence pour les habitats imperturbés (Brady et Griffits, 1997), les chances de réussite de l’étude augmentent par ce choix.
– Ce site est traversé par une rivière : la rivière Vatoharanana, dont la présence est nécessaire pour une étude de l’effet d’un cours d’eau, en tant que barrière géographique, sur les populations de caméléons des deux rives.
– Beaucoup de recherches sur les caméléons se sont passées dans ce site : Brady et Griffits, 1997 ; Wright, 1997 ; Razafimamonjy, 1988 ; Grenfell et Robinson, 1995 ; Glaw et Vences, 2004 ; …

MATERIELS ET METHODES

Période d’étude

L’échantillonnage et la collecte de données ont été effectués du 08 avril au 05 mai 2006. Cette période se situe dans la saison pluvieuse. Cependant, il a commencé à faire froid pendant la dernière partie du temps de collecte, comme le montre la courbe de la température mensuelle (Fig.03 p.7). D’autres prélèvements de tissus animaux ont déjà été effectués en février 2002, en novembre 2002 et en juillet 2003 par les équipes du HDZ/MBBP (Henry Doorly Zoo / Madagascar Biodiversity and Biogeography Project). Ils se rapportent au même site d’étude et à la même espèce : Calumma oshaughnessyi. La méthode d’échantillonnage est la même que celle que nous utilisons dans notre étude. Ainsi il y a 50 individus collectés en février 2002, 50 autres spécimens rassemblés en novembre 2002 et les 60 derniers ont été obtenus en juillet 2003. L’existence de ces prélèvements pré-réunis permet l’étude de la variation du génotype de parent en progéniture.

Matériel biologique

La classification des Chaméléonidés a été sujette à un intense débat. En effet, les auteurs antérieurs ont divisé les caméléons malagasy en deux genres : Brookesia et Chamaeleo. Ce fut seulement en 1986 que Klaver et Böhme ont proposé une autre classification basée sur la forme des hemipénis. Cette classification divise les caméléons malagasy en trois genres : Brookesia, Calumma et Furcifer ; dont les principaux caractères de différenciations en plus de la forme des hemipénis sont mentionnées dans l’introduction. Cette idée est maintenant adoptée par la plupart des chercheurs.

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Table des matières

I. INTRODUCTION
II. MILIEU ET SITE D’ETUDE
II.1. Milieu d’étude
II.2. Site d’étude
III. MATERIELS ET METHODES
III.1. Période d’étude
III.2. Matériel biologique
III.2.1.Systématique
III.2.2.Morphologie
III.2.3.Biologie
III.2.4.Ecologie et éthologie.
III.2.5.Répartition géographique et densité
III.2.6.Statut CITES
III.3.Méthodologie.
III.3.1.Collecte au hasard
III.3.2.Informations récoltées concernant l’animal
III.3.3.Détermination des espèces
III.3.4.Hauteur du perchoir
III.3.5.Pesage.
III.3.6.Morphométrie.
III.3.7.Détermination du sexe
III.3.8.Détermination de l’âge
III.3.9.SEX-RATIO
III.3.10.Prélèvement de sang et de tissu animal
III.3.11.Solution pour la conservation du sang.
III.3.12.Solution pour la conservation de tissu.
III.4.Extraction d’ADN
III.4.1.Extraction de l’ADN du sang par PCI : Phénol Chloroforme Isoamyl alcool
III.4.2.Extraction de l’ADN des tissus par PCI
III.4.3.Vérification de la concentration d’ADN
III.5.Test à froid (Cold test)
III.6.Réaction de polymérisation en chaîne (P.C.R).
III.7.Électrophorèse sur gel d’agarose
III.8.Optimisation
III.9.Analyse de polymorphisme ou Polytest
III.10.Détermination de la richesse allélique ou Séquençage
III.11.Analyse de données
III.11.1.Analyse des données morphométriques.
III.11.2.Analyse des données génétiques.
IV. RESULTATS ET INTERPRETATIONS
IV.1.Résultats de l’échantillonnage
IV.1.1.SEX-RATIO
IV.1.2.Analyse morphométrique
IV.2.Analyse génétique de la population
IV.2.1.Taille de chaque locus pour toutes les populations
IV.2.2.Quelques individus ayant exactement les mêmes données génotypiques pour tous les locales testés
IV.2.3.Structure de chaque population
IV.2.4.Diversité génétique par locus et par population
IV.2.5.Richesse allélique
IV.2.6.Nombre de migrants
IV.2.7.Coefficient de consanguinité par population (FIS)
IV.2.8.Relations entre individus
IV.2.8.1.Relations entre les individus de C2OE.1
IV.2.8.2.Relations entre les individus de C2OW.1
IV.2.8.3.Relations entre les individus de E.RAN4.1
IV.2.8.4.Relations entre les individus de WE.RAN4.1
IV.2.8.5.Relations entre les individus de JUL.1
IV.2.8.6.Relations entre les individus de LUJ.1
IV.2.8.7.Relations entre les individus de RANO2.36
IV.2.8.8.Relations entre les individus de RANO2.70
IV.2.9.Taille de la population effective
V. DISCUSSION
V.1.Les échantillons rassemblés
V.2.Classe d’âge et reproduction
V.3.Données génotypiques
V.4.Rivière Vatoharanana en tant que barrière géographique pour les populations de Calumma oshaughnessyi.
V.5.Moyens de communication entre les deux côtés de la rivière Vatoharanana.
V.6.Future génétique de Calumma oshaughnessyi
V.7.Problème commercial
V.8.Recommandation pour les futurs suivis
VI. CONCLUSION
VII. REFERENCES BIBLIOGRAPHIQUES ET LITTERATURES CITEES
VIII. ANNEXES