Généralités sur le paludisme aviaire

L’avifaune

Madagascar est la quatrième plus grande île du monde et a été isolée depuis au moins 120 millions d’années. Un nombre élevé de taxons du règne animal et végétal prouvent ce long passé d’isolement (Langrand O., 1995). Cette situation a pour résultat de pouvoir offrir la possibilité d’étudier in situ des communautés biologiques qui ont disparu de la masse continentale et inversement d’autres communautés biologiques semblent être absentes de l’île comme certains agents pathogènes responsables de pandémies humaines (dengue, fièvre jaune) ou animales (fièvre aphteuse). Cet isolement géographique a des conséquences sur certaines particularités de 1 ‘avifaune de Madagascar. La première caractéristique est sa pauvreté relative en nombre d’espèces non seulement par rapport à un peuplement avien continental à latitude équivalente mais aussi par rapport aux peuplements aviens d’autres îles de l’Océan Indien comme Bornéo ou la Nouvelle-Guinée. La deuxième caractéristique est constituée par le niveau d’endémisme très élevé: 52,2 % des espèces d’oiseaux sont endémiques de Madagascar, toutes presque exclusivement forestières. Cette fréquence est considérable en comparaison du reste du monde (Langrand O., 1995). De plus, les migrations intercontinentales concernent peu d’espèces endémiques. Seulement quatre espèces nicheuses malgaches migrent vers l’Afrique orientale. Inversement, une seule espèce nicheuse d’Afrique, des migrateurs paléarctiques (la plupart des Charadriiformes ainsi que deux Falconiformes) hivernent à Madagascar. Dans ce contexte de fort endémisme et de migrations modérées, a priori favorable à un isolement des oiseaux, on pourrait s’attendre à des particularités de la population parasitaire aviaire et un endémisme élevé parmi les parasites. 5 + Hématozoaires aviaires : Haemoproteus, Plasmodium et Leucocytozoon Parmi les sept phylums constituant l’embranchement des Protozoaires, deux (Phylums Apicomplexa et Sarcomastigophora) contiennent des parasites sanguins d’oiseaux (Reid MW., 1991) (Tableau 1 ). De nombreuses études sur les hématozoaires aviaires ont permis de faire un inventaire sur les parasites et leurs hôtes dans différentes régions du monde. Les genres les plus fréquemment rencontrés sont: Haemoproteus, Plasmodium et Leucocytozoon, pour les coccidies et Trypanosoma pour les flagellés. Les piroplasmes (Babesia et Aegyptianella) sont moins usuels.

Prélèvements Morond1

Sainte-Marle Toamasina (Tamatave) ~70km * Site de capture • Montagne -Route Carte 1. Localisation du site de capture. Mon principal rôle était d’assurer les prélèvements des oiseaux et je participais également à la lecture des lames. Le prélèvement était pratiqué à la veine jugulaire droite avec seringue à insuline puis transféré dans des tubes Nunc contenant 0,9 ml de diluant* afin d’augmenter le volume de sang prélevé. Le maximum prélevé était de l’ordre de 0,1 ml et en moyenne 0,05 ml. Cependant, la taille de certains oiseaux capturés ne permettait pas toujours ce type de prélèvement, quelques gouttes de sang étaient alors récupérées en coupant une griffe. Dans les deux cas, un frottis sanguin était pratiqué et immédiatement coloré, le reste du sang conservé dans l’azote liquide. La recherche d’hématozoaires aviaires sur frottis sanguins se faisait également sur place : 10 à 15 minutes était en moyenne consacré par lame. Si le résultat s’avérait positif, l’oiseau qui était maintenu dan un pochon, était sacrifié et les organes (foie, rate, cœur, cerveau) étaient prélevés en vue d’appositions sur lames puis de congélation dans l’azote liquide. *Composition du diluant : lx M-199 sels Banks, Tris 0,05 M pH 7,6, BSA 1%, Bicarbonate de soude 0,35 g/1, Penicilline 100 U/ml, Streptomycine 100 µg/ml, Amphotericine B 1 µ1/ml. 10 + Résultats (Annexe 3) Soixante dix sept oiseaux forestiers au total furent capturés avec une moyenne de 13 oiseaux par jour. Dix sept espèces différentes étaient représentées, toutes endémiques de Madagascar. Aucune espèce migratrice ne fut répertoriée. L’espèce majoritaire (20/77) correspondait à un passériforme: le Bulbul zosterops (Phyllastrephus zosterops). Le pourcentage de mortalité fut important: 32/77 (41%), mortalité en partie due au prélèvement lui-même mais aussi à la durée dans le pochon. Les résultats microscopiques (Annexe 3) montrent cinq infections à Plasmodium ou Haemoproteus (Figure 3), deux infections à Leucocytozoon (Figure 4), deux également à Trypanosoma (Figure 5) et six à microfilaires (Figure 6). Au total, 11 oiseaux sur 77 (14%) ont eu une recherche positive Hématozoaires aviaires. Des coinfections concernent trois d’entre eux : Plasmodium ou Haemoproteus / Microfilaires (n°3 l), Haemoproteus / Leucocytozoon / Microfilaires (n° 40), Trypanosoma / Microfilaires (n° 33). Les images des frottis positifs m’ont permis de participer à l’élaboration d’un CD regroupant également des images d’hématozoaires d’oiseaux prélevés à Madagascar en 1996, ainsi que de RCA en 2001. L’identification des espèces étant comme on l’a vu délicate, le choix a été fait d’adresser, au mois d’août 2001, ce CD au Centre International de Référence pour les Hématozoaires aviaires à Brisbane en Australie*. Les résultats ne sont pas encore disponibles. *International Reference Center for Avian Haematozoa (IRCAH)- Queensland Museum, PO Box 3300, South Brisbane, Queensland 410 l Australia. • Discussion Le choix du site de capture mérite quelques commentaires. Tout d’abord, l’altitude (1300m) et la saison de capture (saison froide en moyenne 11 ° C le matin) n’étaient pas propices à un fort niveau de transmission par la rareté des vecteurs. L’influence d’une autre période de capture ainsi qu’un autre biotope plus chaud comme la côte ouest sur la prévalence de l’infection serait intéressante. Concernant la mortalité des oiseaux, nous avons pu constater un fort pourcentage sur les oiseaux capturés le soir, qui étaient restés dans le pochon toute la nuit. Pour les prochaines missions, ce pourcentage pourra être nettement amélioré notamment avec l’habitude du préleveur mais aussi en relâchant les oiseaux du soir avant le coucher du soleil.

Table des matières

Introduction
Présentation du terrain de stage : Institut Pasteur de Madagascar-Groupe de recherche
sur le paludisme
• Présentation générale de! ‘Institut Pasteur
• Situation du paludisme à Madagascar • Présentation du Groupe de Recherche sur le Paludisme (GRP)
Généralités sur le paludisme aviaire
• L’avifaune de Madagascar • Hématozoaires aviaires : Haemoproteus, Plasmodium etLeucocytozoon
Récolte des prélèvements
• Site de capture
• Prélèvements
• Résultats (Annexe 3)
• DiscusSion Etude m oléclllaire
• Phylogénie du genre Plasmodium. Positionnement de P. jalciparum
• Choix des séquences et des amorces
• Mise au point des réactions PCR
• Analyse phylogénique : Construction d’un arbre
Conclusion
Bibliographi.e
Annexes
Annexe 1 : Article de revue générale : Endoparasites of Malagasy birds
Annexe 2. Photographies du site de capture des oiseaux
Annexe 3. Compte rendu de mission : liste des oiseaux capturés et résultats microscopiques
Annexe 4. Alignement de séquences cytochrome b
Annexe 5. Alignement et chromatogramme de séquences reçues

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