ย GENERALITES
DEFINITION DE LA GRIPPE ET DES SYNDROMES GRIPPAUX
La grippe humaine est une maladie virale aiguรซ, frรฉquente, trรจs contagieuse, gรฉnรฉralement bรฉnigne, mais souvent mortelle. Elle รฉvolue sur un mode รฉpidรฉmique et pandรฉmique et est due ร Myxovirus influenzae [1, 2, 27]. Sa symptomatologie connue sous le nom de syndrome pseudo-grippal ou syndrome grippal se caractรฉrise par lโapparition brutale dโune forte fiรจvre, un mauvais รฉtat gรฉnรฉral, des cรฉphalรฉes, des myalgies, une toux sรจche, un mal de gorge et une rhinite… [1, 2, 27]
HISTORIQUE DE LA GRIPPE
La grippe a existรฉ depuis HIPPOCRATE [3, 4]. Au 14รจme siรจcle, ร Florence, fut proposรฉ le terme de ยซ influenza di freddo ยป qui signifie Influenza causรฉ par le froid. Plusieurs รฉpidรฉmies marquรจrent lโhistoire de la grippe et se caractรฉrisรจrent par leur mortalitรฉ รฉlevรฉe et leur gravitรฉ surtout chez les personnes dโรขge extrรชmes. Selon lโhistorien August Hirsch, il y a eu au moins 94 รฉpidรฉmies entre 1173 et 1875 dont plus de 15 รฉtaient des pandรฉmies. On peut citer en outre les รฉpidรฉmies de 1880 1890 et de 1900 [4, 5, 28].
En 1918, la grippe Espagnole fit plus de victimes que les 4 annรฉes de la Grande guerre : au moins 20 millions de morts dans le monde [5, 6]. Certains parlent de 40 50 millions de morts [4, 29] ; et dโautres estiment ร 50-100millions de morts [30, 31]. En 1931, le 1er virus grippal porcin a รฉtรฉ isolรฉ par SHOPE aux USA. En 1933, SMITH, ANDREWES ET LAIDLOW isolรจrent le 1er virus de la grippe humaine ร Londres. En 1940, un virus grippal fut identifiรฉ et nommรฉ B, pour le diffรฉrencier du prรฉcรฉdent qui devient donc le type A. Le virus C fut identifiรฉ en 1947 [5, 28]. Lโannรฉe 1947 fut marquรฉe par une sรฉvรจre pandรฉmie dite ยซ grippe italienne ยป due ร un virus qui a subi un important glissement antigรฉnique et fut nommรฉ A1. En 1957, la ยซ grippe Asiatique ยป avait occasionnรฉ 2 ร 3 millions de morts dans le monde. Le virus responsable fut dโabord nommรฉ A2 puis devint le type A(H2N2) par la suite. Par ailleurs en 1968, une pandรฉmie (grippe de Hong-Kong) due ร un nouveau virus de type A(H3N2) avait engendrรฉ un million de morts [5, 28].
En 1997 ร Hong Kong, les premiers cas dโinfection humaine au virus aviaire A(H5N1) ont รฉtรฉ dรฉcrits chez 18 personnes dont 6 dรฉcรจs. Entre 2003 et 2008, plusieurs cas de grippe aviaire ont รฉtรฉ notรฉs dont 241 dรฉcรจs humains dus au virus H5N1 [5, 8, 32-35]. En avril 2009 au Mexique et aux Etats Unis dโAmรฉrique, on a assistรฉ ร la survenue de la grippe porcine (ou nord-amรฉricaine) due ร un virus pandรฉmique inรฉdit qui rรฉsulte de rรฉassortiments gรฉnรฉtiques complexes. Plus de 214 pays ont confirmรฉ prรจs de 399 232 cas avec plus de 18 337 dรฉcรจs [4, 36] .
La grippe a causรฉ beaucoup de dรฉcรจs ร travers le monde par des รฉpidรฉmies et pandรฉmies. La grippe saisonniรจre est gรฉnรฉralement bรฉnigne mais peut sโavรฉrer dangereuse surtout chez les personnes dโรขge extrรชme. Elle se manifeste par le syndrome grippal qui est le mode dโexpression de plusieurs infections aux virus respiratoires quโil convient de connaรฎtre.
PRINCIPAUX VIRUS RESPIRATOIRESย
Il existe plusieurs types de virus respiratoires pouvant รชtre responsables de syndromes grippaux. Nous avons principalement le virus influenza et les paramyxovirus dont le Virus respiratoire Syncytial (VRS), le Mรฉtapneumovirus Humain (MPVH), les Virus Para influenza (VPIH). Cependant, de nombreux autres virus peuvent causer des infections respiratoires quโelles soient symptomatiques ou asymptomatiques. On peut citer entre autres : les rhinovirus, les bocavirus, les coronavirus, les adรฉnovirus, les entรฉrovirus [37, 38].
VIRUS INFLUENZA
Dรฉfinition, Classification, Nomenclature
Le Myxovirus influenzae est un virus enveloppรฉ ร ARN segmentรฉ, de polaritรฉ nรฉgative, appartenant ร la famille des orthomyxoviridae qui comporte 5 genres : Influenzavirus A, Influenzavirus B, Influenzavirus C, Isavirus et Thogotovirus. Le genre Isavirus infecte les poissons et le genre Thogotovirus infecte les parasites des poissons. Les trois autres genres dโinfluenzavirus A, B et C, sont responsables de la grippe humaine, mais seuls les genres A et B sont responsables dโรฉpidรฉmie. Ils se distinguent sur la base de lโantigรฉnicitรฉ de leur nuclรฉoprotรฉine. Le virus A comprend plusieurs sous-types qui se distinguent sur la base de leurs Antigรจne(Ag) de surface appelรฉs Hรฉmagglutinine (HA ou H) et Neuraminidase (NA ou N). Il existe de nos jours 17 types de HA et 10 types de NA. Plusieurs combinaisons entre les diffรฉrents types dโHA et de NA sont possibles. Il serait donc possible dโavoir environ 170 soustypes de virus influenza A dans le monde, mais seuls environ 80 ont รฉtรฉ dรฉcouverts par les chercheurs. Les types de HA et de NA pouvant se combiner pour donner naissance aux sous-types pathogรจnes pour les humains sont : H1, H2, H3, H5, H7, H9 et N1, N2 et N9. Les souches virales sont dรฉnommรฉes selon : Type/Hรดte dโorigine si non humain/Lieu dโorigine/Numรฉro dโenregistrement/annรฉe dโisolement/HxNx. Exemple : A/Brisbane/59/2007/ H1N1.
Morphologie et structure du virus influenza
Les virus influenza sont enveloppรฉs, arrondis, de forme ovale, mesurant un diamรจtre de 80-120 nm et sont rarement filamenteux. Le gรฉnome viral est constituรฉ de 8 segments monocatรฉnaires pour les virus A et B et 7 segments pour le virus C. La matrice recouvre la face interne de lโenveloppe virale qui est lipidique et provient de la membrane cytoplasmique de la cellule hรดte. Elle est tapissรฉe de spicules glycoprotรฉiques qui reprรฉsentent les HA et les NA[31] .
Caractรจres antigรฉniques du virus influenzaย
โข Les antigรจnes internes sont : la Nuclรฉoprotรฉine (NP) qui est un antigรจne soluble permettant de caractรฉriser le type viral ; la protรฉine M (matrice ou membrane) ; et les polymรฉrases.
โข Les antigรจnes externes (de lโenveloppe) sont : Hรฉmagglutinine (HA ou H) ; la Neuraminidase (NA ou N), lโantigรจne polysaccharidique de lโhรดte.
โข Il faut noter que des variations antigรฉniques sont possibles :
โข les variations progressives ou mineures ou glissement antigรฉnique (Mutations ou antigenic drift) : Observรฉes chez les types A et B, elles surviennent dans une population immunisรฉe et sont responsables dโรฉpidรฉmies hivernales annuelles.
โข les variations majeures, brutales ou saut antigรฉnique (antigenic shift) : elles sont discontinues et font รฉmerger des nouveaux virus contre lesquels les populations sont sans dรฉfense immunologique, provoquant ainsi des pandรฉmies.
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Table des matiรจres
INTRODUCTION
I. GENERALITES
I.1. DEFINITION DE LA GRIPPE ET DES SYNDROMES GRIPPAUX
I.2. HISTORIQUE DE LA GRIPPE
I.3. PRINCIPAUX VIRUS RESPIRATOIRES
I.3.1. VIRUS INFLUENZA
I.3.2. PARAMYXOVIRUS
II. REVUE DE LA LITTรRATURE
III. QUESTION DE RECHERCHE
III.1. QUESTION DE RECHERCHE
III.2. BUT DE LโETUDE
IV. OBJECTIFS
IV.1. OBJECTIF GENERAL
IV.2. OBJECTIFS SPECIFIQUES
V. MATERIEL ET METHODES
V.1. CADRE ET CHAMP DE LโETUDE
V.1.1. Les sites de surveillance de la grippe
V.1.2. Le Centre National De Rรฉfรฉrence Pour La Grippe (CNRG)
IV.1.3. LโInstitut dโImmunologie du Luxembourg
V.1.4. LโUnitรฉ Navale De Recherche Mรฉdicale Des USA ยซU.S. Naval Medical Research Unit Nยฐ3 ยป (NAMRU3) au Caire, Egypte
V.1.5. La Direction Rรฉgionale de la Mรฉtรฉorologie de Bobo-Dioulasso
V.2. TYPE ET PERIODE DโETUDE
V.3. POPULATION DโETUDE
V.4. ECHANTILLONNAGE
V.5. DESCRIPTION DES VARIABLES ETUDIEES
V.6. DEFINITIONS OPERATIONNELLES
V.7. COLLECTE DES DONNEES
V.8. ANALYSE DES ECHANTILLONS AU LABORATOIRE
V.8.1. Extraction de lโARN viral
V.8.2. Prรฉparation du MIX
V.8.3. Lโamplification et la dรฉtection
V.9. ANALYSES DES DONNEES
VI. CONSIDERATIONS ETHIQUES
VII. RESULTATS
VII.1. CARACTERISTIQUES DE LA POPULATION DโETUDE
VII.2. CARACTERISTIQUES CLINIQUES DE LA POPULATION DโรTUDE
VII.3. LES VIRUS DETECTES DANS LA POPULATION DโรTUDE
VII.3.1. Proportion de chaque type et sous type de virus
VII.3.4. Distribution de chaque type de virus en fonction des pรฉriodes de lโannรฉe
VII.3.5. Impact des facteurs climatiques sur la circulation des diffรฉrents virus
VII.4. RESULTAT DU CONTROLE DE QUALITE DU NAMRU-3
VIII. DISCUSSION ET COMMENTAIRES
VIII.1. LES LIMITES ET LES CONTRAINTES DE LโETUDE
VIII.2. LES CARACTERISTIQUES DE LA POPULATION DโETUDE
VIII.3. CARACTERISTIQUES CLINIQUES DE LA POPULATION DโETUDE
VIII.4. LES TYPES DE VIRUS DETECTES DANS LA POPULATION DโETUDE
VIII.4.1. Prรฉvalence des types et sous types de virus respiratoires
VIII.4.2. Rรฉpartition en fonction du sexe et de lโรขge
VIII.4.3. Rรฉpartition en fonction des pรฉriodes de lโannรฉe
VIII.4.4. Influence des facteurs climatiques sur la circulation des diffรฉrents virus
CONCLUSION
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