Definition de la grippe et des syndromes grippaux

ย GENERALITES

DEFINITION DE LA GRIPPE ET DES SYNDROMES GRIPPAUX

La grippe humaine est une maladie virale aiguรซ, frรฉquente, trรจs contagieuse, gรฉnรฉralement bรฉnigne, mais souvent mortelle. Elle รฉvolue sur un mode รฉpidรฉmique et pandรฉmique et est due ร  Myxovirus influenzae [1, 2, 27]. Sa symptomatologie connue sous le nom de syndrome pseudo-grippal ou syndrome grippal se caractรฉrise par lโ€™apparition brutale dโ€™une forte fiรจvre, un mauvais รฉtat gรฉnรฉral, des cรฉphalรฉes, des myalgies, une toux sรจche, un mal de gorge et une rhinite… [1, 2, 27]

HISTORIQUE DE LA GRIPPE

La grippe a existรฉ depuis HIPPOCRATE [3, 4]. Au 14รจme siรจcle, ร  Florence, fut proposรฉ le terme de ยซ influenza di freddo ยป qui signifie Influenza causรฉ par le froid. Plusieurs รฉpidรฉmies marquรจrent lโ€™histoire de la grippe et se caractรฉrisรจrent par leur mortalitรฉ รฉlevรฉe et leur gravitรฉ surtout chez les personnes dโ€™รขge extrรชmes. Selon lโ€™historien August Hirsch, il y a eu au moins 94 รฉpidรฉmies entre 1173 et 1875 dont plus de 15 รฉtaient des pandรฉmies. On peut citer en outre les รฉpidรฉmies de 1880 1890 et de 1900 [4, 5, 28].

En 1918, la grippe Espagnole fit plus de victimes que les 4 annรฉes de la Grande guerre : au moins 20 millions de morts dans le monde [5, 6]. Certains parlent de 40 50 millions de morts [4, 29] ; et dโ€™autres estiment ร  50-100millions de morts [30, 31]. En 1931, le 1er virus grippal porcin a รฉtรฉ isolรฉ par SHOPE aux USA. En 1933, SMITH, ANDREWES ET LAIDLOW isolรจrent le 1er virus de la grippe humaine ร  Londres. En 1940, un virus grippal fut identifiรฉ et nommรฉ B, pour le diffรฉrencier du prรฉcรฉdent qui devient donc le type A. Le virus C fut identifiรฉ en 1947 [5, 28]. Lโ€™annรฉe 1947 fut marquรฉe par une sรฉvรจre pandรฉmie dite ยซ grippe italienne ยป due ร  un virus qui a subi un important glissement antigรฉnique et fut nommรฉ A1. En 1957, la ยซ grippe Asiatique ยป avait occasionnรฉ 2 ร  3 millions de morts dans le monde. Le virus responsable fut dโ€™abord nommรฉ A2 puis devint le type A(H2N2) par la suite. Par ailleurs en 1968, une pandรฉmie (grippe de Hong-Kong) due ร  un nouveau virus de type A(H3N2) avait engendrรฉ un million de morts [5, 28].

En 1997 ร  Hong Kong, les premiers cas dโ€™infection humaine au virus aviaire A(H5N1) ont รฉtรฉ dรฉcrits chez 18 personnes dont 6 dรฉcรจs. Entre 2003 et 2008, plusieurs cas de grippe aviaire ont รฉtรฉ notรฉs dont 241 dรฉcรจs humains dus au virus H5N1 [5, 8, 32-35]. En avril 2009 au Mexique et aux Etats Unis dโ€™Amรฉrique, on a assistรฉ ร  la survenue de la grippe porcine (ou nord-amรฉricaine) due ร  un virus pandรฉmique inรฉdit qui rรฉsulte de rรฉassortiments gรฉnรฉtiques complexes. Plus de 214 pays ont confirmรฉ prรจs de 399 232 cas avec plus de 18 337 dรฉcรจs [4, 36] .

La grippe a causรฉ beaucoup de dรฉcรจs ร  travers le monde par des รฉpidรฉmies et pandรฉmies. La grippe saisonniรจre est gรฉnรฉralement bรฉnigne mais peut sโ€™avรฉrer dangereuse surtout chez les personnes dโ€™รขge extrรชme. Elle se manifeste par le syndrome grippal qui est le mode dโ€™expression de plusieurs infections aux virus respiratoires quโ€™il convient de connaรฎtre.

PRINCIPAUX VIRUS RESPIRATOIRESย 

Il existe plusieurs types de virus respiratoires pouvant รชtre responsables de syndromes grippaux. Nous avons principalement le virus influenza et les paramyxovirus dont le Virus respiratoire Syncytial (VRS), le Mรฉtapneumovirus Humain (MPVH), les Virus Para influenza (VPIH). Cependant, de nombreux autres virus peuvent causer des infections respiratoires quโ€™elles soient symptomatiques ou asymptomatiques. On peut citer entre autres : les rhinovirus, les bocavirus, les coronavirus, les adรฉnovirus, les entรฉrovirus [37, 38].

VIRUS INFLUENZA

Dรฉfinition, Classification, Nomenclature

Le Myxovirus influenzae est un virus enveloppรฉ ร  ARN segmentรฉ, de polaritรฉ nรฉgative, appartenant ร  la famille des orthomyxoviridae qui comporte 5 genres : Influenzavirus A, Influenzavirus B, Influenzavirus C, Isavirus et Thogotovirus. Le genre Isavirus infecte les poissons et le genre Thogotovirus infecte les parasites des poissons. Les trois autres genres dโ€™influenzavirus A, B et C, sont responsables de la grippe humaine, mais seuls les genres A et B sont responsables dโ€™รฉpidรฉmie. Ils se distinguent sur la base de lโ€™antigรฉnicitรฉ de leur nuclรฉoprotรฉine. Le virus A comprend plusieurs sous-types qui se distinguent sur la base de leurs Antigรจne(Ag) de surface appelรฉs Hรฉmagglutinine (HA ou H) et Neuraminidase (NA ou N). Il existe de nos jours 17 types de HA et 10 types de NA. Plusieurs combinaisons entre les diffรฉrents types dโ€™HA et de NA sont possibles. Il serait donc possible dโ€™avoir environ 170 soustypes de virus influenza A dans le monde, mais seuls environ 80 ont รฉtรฉ dรฉcouverts par les chercheurs. Les types de HA et de NA pouvant se combiner pour donner naissance aux sous-types pathogรจnes pour les humains sont : H1, H2, H3, H5, H7, H9 et N1, N2 et N9. Les souches virales sont dรฉnommรฉes selon : Type/Hรดte dโ€™origine si non humain/Lieu dโ€™origine/Numรฉro dโ€™enregistrement/annรฉe dโ€™isolement/HxNx. Exemple : A/Brisbane/59/2007/ H1N1.

Morphologie et structure du virus influenza

Les virus influenza sont enveloppรฉs, arrondis, de forme ovale, mesurant un diamรจtre de 80-120 nm et sont rarement filamenteux. Le gรฉnome viral est constituรฉ de 8 segments monocatรฉnaires pour les virus A et B et 7 segments pour le virus C. La matrice recouvre la face interne de lโ€™enveloppe virale qui est lipidique et provient de la membrane cytoplasmique de la cellule hรดte. Elle est tapissรฉe de spicules glycoprotรฉiques qui reprรฉsentent les HA et les NA[31] .

Caractรจres antigรฉniques du virus influenzaย 

โ€ข Les antigรจnes internes sont : la Nuclรฉoprotรฉine (NP) qui est un antigรจne soluble permettant de caractรฉriser le type viral ; la protรฉine M (matrice ou membrane) ; et les polymรฉrases.
โ€ข Les antigรจnes externes (de lโ€™enveloppe) sont : Hรฉmagglutinine (HA ou H) ; la Neuraminidase (NA ou N), lโ€™antigรจne polysaccharidique de lโ€™hรดte.
โ€ข Il faut noter que des variations antigรฉniques sont possibles :
โ€ข les variations progressives ou mineures ou glissement antigรฉnique (Mutations ou antigenic drift) : Observรฉes chez les types A et B, elles surviennent dans une population immunisรฉe et sont responsables dโ€™รฉpidรฉmies hivernales annuelles.
โ€ข les variations majeures, brutales ou saut antigรฉnique (antigenic shift) : elles sont discontinues et font รฉmerger des nouveaux virus contre lesquels les populations sont sans dรฉfense immunologique, provoquant ainsi des pandรฉmies.

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Table des matiรจres

INTRODUCTION
I. GENERALITES
I.1. DEFINITION DE LA GRIPPE ET DES SYNDROMES GRIPPAUX
I.2. HISTORIQUE DE LA GRIPPE
I.3. PRINCIPAUX VIRUS RESPIRATOIRES
I.3.1. VIRUS INFLUENZA
I.3.2. PARAMYXOVIRUS
II. REVUE DE LA LITTร‰RATURE
III. QUESTION DE RECHERCHE
III.1. QUESTION DE RECHERCHE
III.2. BUT DE Lโ€™ETUDE
IV. OBJECTIFS
IV.1. OBJECTIF GENERAL
IV.2. OBJECTIFS SPECIFIQUES
V. MATERIEL ET METHODES
V.1. CADRE ET CHAMP DE Lโ€™ETUDE
V.1.1. Les sites de surveillance de la grippe
V.1.2. Le Centre National De Rรฉfรฉrence Pour La Grippe (CNRG)
IV.1.3. Lโ€™Institut dโ€™Immunologie du Luxembourg
V.1.4. Lโ€™Unitรฉ Navale De Recherche Mรฉdicale Des USA ยซU.S. Naval Medical Research Unit Nยฐ3 ยป (NAMRU3) au Caire, Egypte
V.1.5. La Direction Rรฉgionale de la Mรฉtรฉorologie de Bobo-Dioulasso
V.2. TYPE ET PERIODE Dโ€™ETUDE
V.3. POPULATION Dโ€™ETUDE
V.4. ECHANTILLONNAGE
V.5. DESCRIPTION DES VARIABLES ETUDIEES
V.6. DEFINITIONS OPERATIONNELLES
V.7. COLLECTE DES DONNEES
V.8. ANALYSE DES ECHANTILLONS AU LABORATOIRE
V.8.1. Extraction de lโ€™ARN viral
V.8.2. Prรฉparation du MIX
V.8.3. Lโ€™amplification et la dรฉtection
V.9. ANALYSES DES DONNEES
VI. CONSIDERATIONS ETHIQUES
VII. RESULTATS
VII.1. CARACTERISTIQUES DE LA POPULATION Dโ€™ETUDE
VII.2. CARACTERISTIQUES CLINIQUES DE LA POPULATION Dโ€™ร‰TUDE
VII.3. LES VIRUS DETECTES DANS LA POPULATION Dโ€™ร‰TUDE
VII.3.1. Proportion de chaque type et sous type de virus
VII.3.4. Distribution de chaque type de virus en fonction des pรฉriodes de lโ€™annรฉe
VII.3.5. Impact des facteurs climatiques sur la circulation des diffรฉrents virus
VII.4. RESULTAT DU CONTROLE DE QUALITE DU NAMRU-3
VIII. DISCUSSION ET COMMENTAIRES
VIII.1. LES LIMITES ET LES CONTRAINTES DE Lโ€™ETUDE
VIII.2. LES CARACTERISTIQUES DE LA POPULATION Dโ€™ETUDE
VIII.3. CARACTERISTIQUES CLINIQUES DE LA POPULATION Dโ€™ETUDE
VIII.4. LES TYPES DE VIRUS DETECTES DANS LA POPULATION Dโ€™ETUDE
VIII.4.1. Prรฉvalence des types et sous types de virus respiratoires
VIII.4.2. Rรฉpartition en fonction du sexe et de lโ€™รขge
VIII.4.3. Rรฉpartition en fonction des pรฉriodes de lโ€™annรฉe
VIII.4.4. Influence des facteurs climatiques sur la circulation des diffรฉrents virus
CONCLUSION

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