Caractéristiques de la forêt dense humide de moyenne altitude
Biodiversité unique au monde
La biodiversité malgache est reconnue dans le monde par sa richesse et son niveau d’endémisme très particulier. Elle est l’un des très rares endroits où des espèces nouvelles sont encore découvertes même parmi les oiseaux et les mammifères. (Mediaterre, 2006). Elle figure parmi les 10 hot spots de la diversité biologique mondiale (Planète vivante, 2008) et possède l’un des écosystèmes les plus riches du monde. Des différenciations très remarquables sont observées sur les espèces tant au niveau végétal qu’animal. Cela est caractérisé par une diversité écologique importante : du climat, de la topographie, des habitats, etc.). Ces niveaux élevés d’endémisme et d’archaïsme des espèces sont expliqués par une longue évolution car au fil du temps, l’île est devenue un refuge exceptionnel pour les descendants d’espèces archaïques maintenant disparues des continents africain et asiatique avec lesquels elle était reliée à certaines périodes de son histoire géologique. Beaucoup d’espèces animales et végétales de la biodiversité malgache font actuellement partie des grandes priorités mondiales en matière de conservation de la biodiversité et de préservation de l’environnement. Concernant les écosystèmes forestiers à Madagascar, ces derniers abritent particulièrement une biodiversité très large. Par ailleurs, les forêts sont de différents types et permettent un développement de large gamme d’espèces animales et végétales dont nombreuses sont endémiques. A Madagascar, les principales formations primaires d’écosystèmes forestiers sont repartis comme suit selon Moat, dans Atlas 2007 les forêts denses humides sempervirentes de basse et moyenne altitude de l’Est occupant 4 773 700 hectares les forêts denses sèches décidues réparties sur les massifs de la partie Ouest et moyennes Ouest de Madagascar sur une superficie de 3 197 000 ha les forêts denses sclérophylles de moyenne altitude de la partie occidentale de l’île près de 540 000 ha; les forêts littorales occupant 34 600 ha les fourrés denses xérophiles de la région méridionale présentant les espèces épineuses sur une superficie de 1 835 500 ha, les mangroves sur le long des zones littorales de la côte Ouest de Madagascar ayant une superficie de 243 300 ha.
Contexte de la gestion des ressources phytogénétiques forestières
Depuis des dizaines d’années, conscient des problèmes de dégradation accrue del’environnement et la perte de biodiversité ainsi que les problèmes issus des différents cataclysmesnaturels, Madagascar s’est engagé dans la protection de son environnement depuis la fin des années1980. Vers 1989, le gouvernement a élaboré son Plan National d’Action Environnemental (PNAE). LaCharte de l’Environnement était adoptée sous forme de loi d’Etat, la loi 90-033 qui constitue le cadregénéral d’exécution de la Politique Nationale de l’Environnement. Elle comporte les objectifs visés, lastratégie à mettre en oeuvre et les trois Programmes Environnementaux (PEI, PEII et PEIII). La PNEvise à rétablir un équilibre durable et harmonieux entre les besoins de développement de l’homme etles ressources écologiques.Plusieurs conventions internationales ont été signées et/ou ratifiées par Madagascar pour lasécurité et la gestion durable de sa biodiversité : la Convention sur la Diversité Biologique, leProtocole sur la Biosécurité, la Convention sur le Commerce International des espèces de fauneetFlore sauvage menacées d’extinction, entre autres. Suite à ces acquis au niveau international, les objectifs de la Stratégie National de la Gestion Durable de la Biodiversité à Madagascar ont été basés sur ceux de la Convention sur la Diversité Biologique. Cela indique la combinaison de la conservation et de la valorisation d’une part, de l’écologie et de l’économie d’autre part pour garantir l’efficacité de la gestion (Minenv, 2002). Selon ce SNGDB, la conservation des ressources génétiques forestières, agricoles et animales a été définie parmi les axes d’orientation de cette stratégie. Concernant cette dernière, Madagascar a déjà établi un Plan National Stratégique de Gestion des ressources phytogénétiques forestières pour leur gestion durable (PNSGRPF), par l’initiative du SNGF et différentes institutions. Ce plan a été déjà mis en œuvre depuis Janvier 2000. Il est basé sur sept axes stratégiques dont le premier axe a mis l’importance de la connaissance de la diversité génétique des espèces cibles pour point de départ d’une gestion rationnelle et durable des ressources phytogénétiques.
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Table des matières INTRODUCTION 1ère partie : Contexte et problématique Chapitre I : Contexte général I.1- Madagascar : biodiversité unique au monde I.2- Contexte de la gestion des ressources phytogénétiques forestières Chapitre II : Problématique II.1- Problématique globale II.2- Menace sur les ressources phytogénétiques forestières malgaches II.3- Les Dalbergia malgaches : espèces importantes sur le plan économique mais menacées par les pratiques humaines Chapitre III : Objectifs, hypothèses et méthodologie III.1- Objectifs III.2- Hypothèses III.3 - Méthodologie Chapitre IV : Etat des connaissances IV.1- Caractéristiques de la forêt dense humide de moyenne altitude (écosystème de Dalbergia monticola IV.2- Généralités sur le genre Dalbergia IV.2.1- Dalbergia spp IV.2.2- Dalbergia monticola IV.3- Les apports des méthodes et outils de la génétique IV.4- Technique de multiplication : outils de gestion des ressources phytogénétiques forestières IV.5- Revue bibliographique : impact de la fragmentation et de l’exploitation des forêts sur les ressources phytogénétiques forestières 2ème partie : Matériels et méthodes Chapitre V: Matériels d’étude V.1.- Sites et populations d’étude V.1.1- Choix des sites V.1.2- Caractéristiques des sites V.1.3- Description des populations V.2- Structures spatiales des individus Chapitre VI : Méthodes d’étude VI.1- Etude de la diversité génétique sur la base des marqueurs moléculaires VI.1.1- Mode d’échantillonnage VI.1.2- Collectes des échantillons des feuilles VI.1.3- Analyse par marqueur moléculaire VI.2- Etude de la diversité de physiologie de germination VI.2.1- Mode de récolte des graines VI.2.2- Caractérisation des graines VI.2.3- Analyse statistique des données VI.3- Etude de la diversité de croissance juvénile VI.3.1- Mode d’essai VI.3.2- Analyses statistiques des résultats 3ème partie : Résultats et interprétations Chapitre VII : Diversité par approche moléculaire VII.1- Etude de la diversité génétique à l’échelle de l’aire naturelle VII.1.1- Diversité intra et inter populations VII.1.1.1- Selon les marqueurs microsatellites nucléaires VII.1.1.2- Selon les marqueurs microsatellites chloroplastiques VII.1.2- Gradient de diversité VII.1.3- Structure de la diversité génétique VII.1.3.1- Structure par marqueurs microsatellites nucléaires VII.1.3.2- Structure par marqueurs microsatellites chloroplastiques VII.2- Isolement génétique par la distance VII.3- Analyse des effets de goulots démographiques VII.4- Structure de la diversité génétique à l’échelle du paysage VII.4.1- Population de Ranomafana VII.4.2- Population de Bekorakaka VII.5- Spatialisation la diversité génétique à l’échelle locale Chapitre VIII : Diversité de la physiologie de germination et de croissance juvénileVIII.1- Variabilité intra et inter provenance de la morphologie et de l’anatomie de graines VIII.1.1- Diversité morphologique des graines VIII.1.2- Diversité anatomique des graines VIII.2- Variabilité intra et inter provenance du taux de germination VIII.2.1- Germination en fonction de la température VIII.2.2- Germination en fonction de la teneur en eau VIII.2.3- Corrélation entre le taux de germination et la qualité physiologique des graines VIII.2.4- Corrélation entre la taille des arbres mères et le taux de germination VIII.3- Paramètres étudiés de la croissance juvénile VIII.3.1- Variabilité et héritabilité des caractères VIII.3.2- Corrélation des caractères VIII.3.3- Mortalité au stade juvénile 4ème partie : Discussions et recommandations Chapitre IX : Discussions Chapitre X : Recommandations CONCLUSIONS Bibliographie Annexes
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